Apache Cocoon, часто называемый просто Cocoon, — программный каркас для разработки веб-приложений. Он ориентирован на использование XML и построен с использованием языка программирования Java. Гибкость, завязанная на использование XML, позволяет публиковать содержимое в различных форматах, включая XML, PDF и WML. В частности, на основе данного программного каркаса создана мощная система управления содержимым Apache Lenya. Cocoon также широко используется как средство хранения данных, а также как промежуточное программное обеспечение для передачи данных между системами.
Веб-служба, веб-сервис — идентифицируемая уникальным веб-адресом (URL-адресом) программная система со стандартизированными интерфейсами.

Apache Geronimo — сервер приложений с открытым исходным кодом, разрабатываемый Apache Software Foundation.

Apache Struts — фреймворк с открытым исходным кодом для создания Java EE веб-приложений. Основывается на Java Servlet API и расширяет его, в архитектурном плане реализует паттерн MVC. Фреймворк создан Крейгом МакКланаханом и передан Apache Foundation в мае 2000 года. Сначала находился в составе Apache Jakarta Project и был известен как Jakarta Struts. С 2005 года является проектом Apache верхнего уровня.

Tomcat — контейнер сервлетов с открытым исходным кодом, разрабатываемый Apache Software Foundation. Реализует спецификацию сервлетов, спецификацию JavaServer Pages (JSP) и JavaServer Faces (JSF). Написан на языке Java.
Apache ServiceMix — пакет для создания композитных приложений, базирующийся на концепции корпоративной сервисной шины и комбинирующий сервис-ориентированную архитектуру и событийно-ориентированная архитектуру. ServiceMix реализует также спецификацию Java Business Integration, хотя последняя теряет свою популярность.

CouchDB — документо-ориентированная система управления базами данных с открытым исходным кодом, не требующая описания схемы данных, распространяется свободно, написана на языке Erlang. Впервые вышла в 2005 году, с 2008 года — проект фонда Apache.

Apache Felix — свободный фреймворк, являющийся реализацией спецификации OSGi Release 4. Основой данного фреймворка является проект Oscar из состава ObjectWeb. 21 июня 2007 года фреймворк стал проектом верхнего уровня некоммерческой организации Apache Software Foundation.

Apache ActiveMQ — брокер сообщений с открытым исходным кодом, реализующий спецификацию JMS 1.1. Среди возможностей — кластеризация, возможность использовать для хранения сообщений различные СУБД, кэширование, ведение журналов.
Apache Velocity является проектом с открытым исходным кодом, развиваемым Apache Software Foundation. Ранее Apache Velocity был известен как Jakarta Velocity и входил в состав зонтичного проекта Apache Jakarta Project, но впоследствии был выделен в самостоятельный популярный проект. Velocity — это процессор шаблонов, базирующийся на Java, который обеспечивает простой, но мощный шаблонный язык, не требующий предварительной подготовки модели переменных для шаблона: в шаблон просто передаются ссылки на Java-объекты, а обработчик разбирает указанные методы и посредством Java reflection получает их значения. Его цель состоит в том, чтобы гарантировать чистое разделение между уровнем представления и бизнес-уровнем в Веб-приложении, однако он не ограничен областью Веб-приложений.
Thrift — язык описания интерфейсов, который используется для определения и создания служб под разные языки программирования. Является фреймворком к удалённому вызову процедур (RPC). Используется компанией Facebook в качестве масштабируемого кросс-языкового сервиса по разработке. Сочетает в себе программный конвейер с движком генерации кода для разработки служб, в той или иной степени эффективно и легко работающих между такими языками как C#, C++, Cappuccino, Cocoa, Delphi, Erlang, Go, Haskell, Java, OCaml, Perl, PHP, Python, Ruby, Rust, Smalltalk и JavaScript. Проще говоря, Thrift является двоичным протоколом связи. С апреля 2007 разрабатывается как open source проект некоммерческой организации Apache Software Foundation.
Java API for XML Web Services (JAX-WS) — это прикладной программный интерфейс языка Java для создания веб-служб, являющийся частью платформы Java EE. JAX-WS является заменой технологии JAX-RPC, предоставляя более документо-ориентированную модель сообщений и упрощая разработку веб-служб за счёт использования аннотаций, впервые появившихся в Java SE 5. Технология JAX-WS является стандартом и описана в JSR 224.
Apache TomEE — проект верхнего уровня Apache, сервер приложений, базирующийся на спецификации стека Java EE 6 Web Profile.
В качестве контейнера сервлетов TomEE использует оригинальный Tomcat без каких либо изменений.
Это является важной особенностью, так как позволяет легко добавить более специфичные технологии стека Java EE без необходимости разрешения проблем переносимости.

Apache Qpid — это система сообщений с открытым кодом, реализующая AMQP протокол. Он предоставляет управление транзакциями, очереди, распределение, защиту, управление, кластеризацию, федерации и гетерогенную мульти-платформенную поддержку.

Solr — платформа полнотекстового поиска с открытым исходным кодом, основанная на проекте Apache Lucene. Её основные возможности: полнотекстовый поиск, подсветка результатов, фасетный поиск, динамическая кластеризация, интеграция с базами данных, обработка документов со сложным форматом. Так как в Solr есть возможность распределенного поиска и репликации, Solr хорошо масштабируем. По состоянию на май 2016 года Solr является вторым по популярности поисковым движком.
Apache Roller — открытый полнофункциональный, многопользовательский сервер для создания веб-блогов с поддержкой групп сообществ, написанный на Java. Roller сначала был написан Дейвом Джонсоном в 2002 году для журнальной статьи об инструментах разработки открытых программ, но стал популярным на FreeRoller.net и был позже выбран как движок для блогов сотрудников Sun Microsystems и IBM developerWorks.
Apache Shale — проект Apache Software Foundation, в рамках которого с 2004 года велась разработка альтернативы JavaServer Faces (JSF) для Apache Struts, MVC-среды для разработки веб-приложений на Java.
Java EE претерпела множество изменений с первой версии.

Apache Continuum, партнёр Apache Maven, — инструмент непрерывной интеграции программного обеспечения на платформе Java, нацеленный на автоматизацию процесса сборки. Управление и просмотр информации о сборках осуществляется через веб-интерфейс. Интегрируется с Apache Ant, различными системами управления версиями.
Apache Oozie — это серверная система планирования рабочих процессов для управления заданиями Hadoop.