
Jakarta EE. В 2018 Eclipse Foundation переименовала Java EE в Jakarta EE — набор спецификаций и соответствующей документации для языка Java, описывающей архитектуру серверной платформы для задач средних и крупных предприятий.

NetBeans IDE — свободная интегрированная среда разработки приложений (IDE) на языках программирования Java, Python, PHP, JavaScript, C, C++, Ада и ряда других.

OSGi — спецификация динамической модульной системы и сервисной платформы для Java-приложений, разрабатываемая консорциумом OSGi Alliance. Спецификации дают модель для построения приложения из компонентов, связанных вместе посредством сервисов. Суть заключается в возможности переинсталлировать динамически компоненты и составные части приложения без необходимости останавливать и перезапускать его.
Проект Jakarta — один из проектов Apache Software Foundation. Проект развивает и поддерживает свободно распространяемое ПО, написанное на языке программирования Java.

Apache Geronimo — сервер приложений с открытым исходным кодом, разрабатываемый Apache Software Foundation.

Apache Struts — фреймворк с открытым исходным кодом для создания Java EE веб-приложений. Основывается на Java Servlet API и расширяет его, в архитектурном плане реализует паттерн MVC. Фреймворк создан Крейгом МакКланаханом и передан Apache Foundation в мае 2000 года. Сначала находился в составе Apache Jakarta Project и был известен как Jakarta Struts. С 2005 года является проектом Apache верхнего уровня.

Google Web Toolkit — свободный Java-фреймворк, который позволяет веб-разработчикам создавать Ajax-приложения. Его особенность — это компилятор Java -> JavaScript, позволяющий почти всю разработку клиента и сервера реализовать на основе Java и лишь на последнем этапе создать соответствующие JavaScript, HTML и CSS. Выпускается под лицензией Apache версии 2.0. GWT делает акцент на повторное использование и кросс‐браузерную совместимость.

Tomcat — контейнер сервлетов с открытым исходным кодом, разрабатываемый Apache Software Foundation. Реализует спецификацию сервлетов, спецификацию JavaServer Pages (JSP) и JavaServer Faces (JSF). Написан на языке Java.
Apache ServiceMix — пакет для создания композитных приложений, базирующийся на концепции корпоративной сервисной шины и комбинирующий сервис-ориентированную архитектуру и событийно-ориентированная архитектуру. ServiceMix реализует также спецификацию Java Business Integration, хотя последняя теряет свою популярность.

Tapestry — объектно-ориентированный Java фреймворк для создания веб-приложений, реализующих модель MVC. Tapestry был создан Howard Lewis Ship и продолжает активно развиваться. Фреймворк является проектом верхнего уровня в организации Apache Software Foundation. Основной акцент в Tapestry сделан на продуктивность разработчика, лёгкость использования, невозможность программистами создания больших кусков «glue code». Tapestry использует модульный подход к веб-разработке, используя биндинг между компонентами (объектами) пользовательского интерфейса на веб-странице и соответствующими им java-классами. Эта компонентно-ориентированная архитектура почерпнула большое количество идей из WebObjects.
Apache Camel — открытый кроссплатформенный java-фреймворк, который позволяет проводить интеграцию приложений в простой и понятной форме. Идеологически основан на Шаблонах Интеграции Корпоративных Приложений.
EclipseLink — это свободный фреймворк для языка программирования Java, предназначенный для решения задач объектно-реляционного отображения ORM. Разрабатывается Фондом Eclipse. Позволяет работать с разными сервисами данных, включая базы данных, веб-сервисы, Object XML mapping (OXM), и корпоративные информационные службы. EclipseLink поддерживает следующие стандарты персистирования данных:
- Java Persistence API (JPA)
- Java API for XML Binding (JAXB)
- Java Connector Architecture (JCA)
- en:Service Data Objects (SDO).

Knopflerfish — некоммерческая организация, развивающая технологию OSGi. Проект представляет собой свободную сертифицированную реализацию спецификации OSGi R4 v4.2, а также связанные с ней инструменты и приложения. Knopflerfish доступен под лицензией BSD license.
Apache Derby — реляционная СУБД, написанная на Java, предназначенная для встраивания в Java-приложения или обработки транзакций в реальном времени. Занимает 2 MB на диске. Распространяется на условиях лицензии Apache 2.0. Ранее известна как IBM Cloudscape. Oracle распространяет те же бинарные файлы под именем Java DB.

Spring Roo — фреймворк с открытым исходным кодом для быстрого создания бизнес-приложений на Java. Полученные в результате приложения используют общие технологии Java, такие как Spring Framework, Java Persistence API, JSP, Apache Maven и AspectJ. Spring Roo является частью проекта Spring.
Thrift — язык описания интерфейсов, который используется для определения и создания служб под разные языки программирования. Является фреймворком к удалённому вызову процедур (RPC). Используется компанией Facebook в качестве масштабируемого кросс-языкового сервиса по разработке. Сочетает в себе программный конвейер с движком генерации кода для разработки служб, в той или иной степени эффективно и легко работающих между такими языками как C#, C++, Cappuccino, Cocoa, Delphi, Erlang, Go, Haskell, Java, OCaml, Perl, PHP, Python, Ruby, Rust, Smalltalk и JavaScript. Проще говоря, Thrift является двоичным протоколом связи. С апреля 2007 разрабатывается как open source проект некоммерческой организации Apache Software Foundation.
Apache TomEE — проект верхнего уровня Apache, сервер приложений, базирующийся на спецификации стека Java EE 6 Web Profile.
В качестве контейнера сервлетов TomEE использует оригинальный Tomcat без каких либо изменений.
Это является важной особенностью, так как позволяет легко добавить более специфичные технологии стека Java EE без необходимости разрешения проблем переносимости.
Mule ESB — легковесная интеграционная платформа, которая позволяет разработчику объединять различные информационные системы на основе принципов обмена сообщениями, сопоставления данных, управления сообщениями (orchestration), надежности, защиты и масштабирования между узлами (коннекторами).
Здесь представлен список существующего ORM программного обеспечения.
Java EE претерпела множество изменений с первой версии.