Микрооргани́змы, или микро́бы — собирательное название живых организмов, которые слишком малы для того, чтобы быть видимыми невооружённым глазом. Термин микроб был предложен 26 февраля 1878 года французским филологом Эмилем Литтре по просьбе учёного Шарля-Эммануэля Седийо дать подходящее название микроорганизмам.
Анаммо́кс (сокр. от англ. anaerobic ammonium oxidation — анаэробное окисление аммония) — один из ключевых микробных процессов в круговороте азота. Бактерии, осуществляющие этот процесс, были открыты в 1999 году, и в своё время описание этого процесса стало большим сюрпризом для научного сообщества. Уравнение процесса:
- NH4+ + NO2− → N2 + 2H2O.
Фрикселл — бессточное озеро в районе Земли Виктории, Антарктида. Расположено в долине Тейлора Трансантарктического хребта между ледником Канада и ледником Содружества. Длина озера составляет 4,5 км, площадь — 7 км². Располагается на высоте 15 м над уровнем моря, имеет глубину 19,2 м.
Ваа́л — водоток в Нидерландах, один из основных рукавов Рейна в его дельте.
Rhodospirillum rubrum (лат.) — вид грамотрицательных пурпурных бактерий из семейства Rhodospirillaceae класса альфа-протеобактерий.
Bradyrhizobium (лат.) — род грамотрицательных почвенных бактерий, часть видов которого способна к фиксации азота.
Bradyrhizobium arachidis (лат.) — вид клубеньковых азотофиксирующих эндосимбиотических бактерий. Впервые этот вид был выделен из корневых клубеньков Arachis hypogaea в Китае. Типовой штамм — CCBAU 051107T.
Bradyrhizobium betae (лат.) — вид клубеньковых азотофиксирующих эндосимбиотических бактерий, впервые выделенная из кореней Beta vulgaris, откуда и происходит её название. Медленно растущий эндофит. Типовой штамм — PL7HG1T.
Bradyrhizobium canariense (лат.) — вид клубеньковых азотофиксирующих эндосимбиотических бактерий. Это ацидотолерантная бактерия, образует клубеньки с эндемиком Канарских островов из трибы Дроковые. Типовой штамм — BTA-1T.
Bradyrhizobium elkanii (лат.) — вид клубеньковых эндосимбиотических азотфиксирующих бактерий, впервые выделенная как ДНК гомологичная группа II штаммов B. japonicum. В 1988 году выяснилось, что только группа II вызывает обесцвечивание листьев, по-научному называемое «микросимбионт-индуцированный листовой хлорозис». Это заболевание было распространено на соевых полях на юге США. Иной состав жирных кислот вместе с необычным профилем устойчивости к антибиотикам оказались достаточно большими фенотипческими отличием, что бы выделить ДНК гомологичную группу штаммов II в отдельный вид Bradyrhizobium elkanii.
Bradyrhizobium jicamae (лат.) — грамотрицательная, строго аэробная бактерия из рода Bradyrhizobium, были выделены из клубеньков растения Pachyrhizus erosus в Гондурасе, название происходит от ацтекского названия этого растения.
Bradyrhizobium liaoningense (лат.) — вид клубеньковых симбиотических азотфиксирующих бактерий. Впервые её выделили из корневых клубеньков Glycine soja и Glycine max в Китае. Типовой штамм — 2281.
Bradyrhizobium oligotrophicum (лат.) — азотфиксирующая бактерия из рода Bradyrhizobium, которую впервые выделили из почвы залитых рисовых полей в префектуре Мияги, Япония. Типовые штаммы: ATCC 43045, DSM 12412, Hattori strain S58, JCM 1494, LMG 10732, NCIMB 12151.
Bradyrhizobium yuanmingense (лат.) — вид клубеньковых эндосимбиотических азотфиксирующих бактерий, образующих клубеньки с видами Lespedeza и Vigna. Типовые штаммы — CCBAU 10071(T).
Geobacter sulfurreducens — грамотрицательная металл- и серовосстанавливающая протеобактерия. Палочковидная, облигатно анаэробная, неферментирующая, имеет жгутик и фимбрии IV типа, близкий родственник Geobacter metallireducens.
Ацетогены — прокариоты, которые выделяют ацетат (CH3COO−) в качестве конечного продукта анаэробного дыхания или гомоацетатного брожения. Однако обычно этот термин используется в более узком смысле: только в отношении бактерий и архей, которые одновременно осуществляют анаэробное дыхание и фиксацию углерода в восстановительном ацетил-КоА-пути (путь Вуда — Льюнгдаля). Этот процесс известен как ацетогенез. Ацетогенов следует отличать от уксуснокислых бактерий, которые выделяют ацетат, получающийся в результате неполного аэробного окисления этилового спирта до уксусной кислоты.
Thioploca (лат.) — род гамма-протеобактерий из порядка Thiotrichales. Нитчатые серные бактерии, которые встречаются на глубине до 3000 метров у западного побережья Южной Америки, а также встречаются в пресноводных водоемах по всему миру. Большая вакуоль занимает более 80 % объёма их клеток и запасает растворенный нитрат. Также бактерия ассимилирует сульфиды и накапливает элементную серу внутри клеток, которые используются для получения энергии путём окисления сульфида и серы нитратом. Концентрация нитрата в вакуоли чрезвычайно высока, хотя осадочные породы, в которых они живут, содержат относительно мало азота. Поскольку данный тип бактерий использует как соединения серы, так и азота, они могут обеспечить важную связь между циклами азота и серы. Отличительной особенностью сероокисляющих бактерий рода Thioploca является слизистый чехол, который они используют в качестве туннеля для перемещения между восстановленным сульфидосодержащим осадком и придонной водой, содержащей нитрат.
Acidobacteria (лат.) — тип бактерий. Представители типа широко распространены и имеют разнообразный метаболизм, особенно много их обнаруживается в почве. Однако лишь немногих представителей удалось культивировать.
Azotobacter chroococcum (лат.) — типовой вид бактерий рода азотобактер, первый известный вид азотфиксирующих бактерий. Открыт в 1901 году известным немецким микробиологом Мартином Бейеринком.
Thiothrix (лат.) — это род нитчатых сероокисляющих бактерий, родственный родам Beggiatoa и Thioploca. Они обычно грамотрицательные, клетки их палочковидной формы. Они образуют прикрепленные к субстрату многоклеточные нити с гонидиями на свободном конце. Вершинные гонидии обладают скользящей подвижностью. Розетки филаментов образуются не всегда, но являются типичными. Сера откладывается в складках клеточной мембраны.