CD302

Перейти к навигацииПерейти к поиску
CD302
Идентификаторы
ПсевдонимыCD302, BIMLEC, CLEC13A, DCL-1, DCL1, CD302 molecule
Внешние IDOMIM: 612246 MGI: 1913455 HomoloGene: 8919 GeneCards: CD302
Расположение гена (человек)
2-я хромосома человека
Хр.2-я хромосома человека[1]
2-я хромосома человека
Расположение в геноме CD302
Расположение в геноме CD302
Локус2q24.2Начало159,768,628 bp[1]
Конец159,798,255 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
2-я хромосома мыши
Хр.2-я хромосома мыши[2]
2-я хромосома мыши
Расположение в геноме CD302
Расположение в геноме CD302
Локус2|2 C1.1Начало60,082,337 bp[2]
Конец60,114,832 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
Наибольшая экспрессия в
Дополнительные справочные данные
BioGPS
н/д
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

9936

66205

Ensembl

ENSG00000241399

ENSMUSG00000060703

UniProt

Q8IX05

Q9DCG2

RefSeq (мРНК)

NM_014880
NM_001198763
NM_001198764

NM_001290660
NM_025422

RefSeq (белок)

NP_001185692
NP_001185693
NP_055695

NP_001277589
NP_079698

Локус (UCSC)Chr 2: 159.77 – 159.8 MbChr 2: 60.08 – 60.11 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

CD302, или CLEC13A (англ. C-type lectin domain family 13 member A, лектин С-типа домен семейство 13 член A) — мембранный белок, лектин типа С. Продукт гена человека CD302[5][6].

Тканевая специфичность

Экспрессирован в умеренном количестве на моноцитах, миелоидных дендритных клетках крови, низкий уровень обнаружен на плазмацитоидных дендритных клетках крови, а также макрофагах и дендритных клетках моноцитарного происхождения. Наивысший уровень находится в печени, лёгких, лейкоцитах периферической крови, селезёнке. При лимфоме Ходжкина изоформы 2 и 3 экспрессируются клетками Ходжкина-Рида-Штернберга.

Функции

Белок относится к суперсемейству белков CTL/CTLD (лектин типа С/лектин типа С-подобный домен). Члены этого семейства имеют сходную белковую структуру и обладают разнообразными функциями, такими как адгезия клеток, межклеточная передача сигнала, метаболизм гликопротеинов, роль в воспалении и иммунном ответе. CD302 является мультифункциональным рецептором, который играет роль в клеточной адгезии, миграции, а также в эндоцитозе и фагоцитозе.[7].

Структура

Является трансмембранным белком 1-го типа. Белок состоит из 210 аминокислот, содержит один трансмембранный домен. Внеклеточный домен содержит 1 участока N-гликозилирования аспарагинового остатка и 1 дисульфидную связь.

Примечания

  1. ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000241399 - Ensembl, May 2017
  2. ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000060703 - Ensembl, May 2017
  3. ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ↑ Nomura N., Miyajima N., Sazuka T., Tanaka A., Kawarabayasi Y., Sato S., Nagase T., Seki N., Ishikawa K., Tabata S. Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. I. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0001-KIAA0040) deduced by analysis of randomly sampled cDNA clones from human immature myeloid cell line KG-1 (англ.) // DNA Res.[англ.] : journal. — 1994. — Vol. 1, no. 1. — P. 27—35. — doi:10.1093/dnares/1.1.27. — PMID 7584026.
  6. ↑ Nomura N., Miyajima N., Sazuka T., Tanaka A., Kawarabayasi Y., Sato S., Nagase T., Seki N., Ishikawa K., Tabata S. Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. I. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0001-KIAA0040) deduced by analysis of randomly sampled cDNA clones from human immature myeloid cell line KG-1 (supplement) (англ.) // DNA Res.[англ.] : journal. — 1994. — Vol. 1, no. 1. — P. 47—56. — doi:10.1093/dnares/1.1.47. — PMID 7584028.
  7. ↑ Kato M., Khan S., d'Aniello E., McDonald K.J., Hart D.N. The novel endocytic and phagocytic C-Type lectin receptor DCL-1/CD302 on macrophages is colocalized with F-actin, suggesting a role in cell adhesion and migration (англ.) // J. Immunol.[англ.] : journal. — 2007. — November (vol. 179, no. 9). — P. 6052—6063. — doi:10.4049/jimmunol.179.9.6052. — PMID 17947679.

Литература

  • Hillier L.W., Graves T.A., Fulton R.S. et al. Generation and annotation of the DNA sequences of human chromosomes 2 and 4. (англ.) // Nature : journal. — 2005. — Vol. 434, no. 7034. — P. 724—731. — doi:10.1038/nature03466. — PMID 15815621.
  • Gerhard D.S., Wagner L., Feingold E.A. et al. The Status, Quality, and Expansion of the NIH Full-Length cDNA Project: The Mammalian Gene Collection (MGC) (англ.) // Genome Res. : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334. — PMC 528928.
  • Yang S., Noble C.G., Yang D. Characterization of DLC1-SAM equilibrium unfolding at the amino acid residue level (англ.) // Biochemistry : journal. — 2009. — Vol. 48, no. 19. — P. 4040—4049. — doi:10.1021/bi9000936. — PMID 19317456.
  • Kato M., Khan S., Gonzalez N. et al. Hodgkin's lymphoma cell lines express a fusion protein encoded by intergenically spliced mRNA for the multilectin receptor DEC-205 (CD205) and a novel C-type lectin receptor DCL-1 (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2003. — Vol. 278, no. 36. — P. 34035—34041. — doi:10.1074/jbc.M303112200. — PMID 12824192.
  • Bonaldo M.F., Lennon G., Soares M.B. Normalization and subtraction: two approaches to facilitate gene discovery (англ.) // Genome Res. : journal. — 1996. — Vol. 6, no. 9. — P. 791—806. — doi:10.1101/gr.6.9.791. — PMID 8889548.
  • Strausberg R.L., Feingold E.A., Grouse L.H. et al. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2002. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.