CLEC4A

CLEC4A
CLEC4A
Доступные структуры
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB
Список идентификаторов PDB
	5B1W, 5B1X
Идентификаторы
Псевдонимы	CLEC4A, CLECSF6, DCIR, DDB27, LLIR, CD367, HDCGC13P, C-type lectin domain family 4 member A, hDCIR
Внешние ID	OMIM: 605306 MGI: 1349412 HomoloGene: 49291 GeneCards: CLEC4A
Расположение гена (человек)
Расположение гена (человек)
Хр.	12-я хромосома человека
Конец	8,138,607 bp
Расположение гена (Мышь)
Расположение гена (Мышь)
Хр.	6-я хромосома мыши
Конец	123,120,958 bp
Паттерн экспрессии РНК
Паттерн экспрессии РНК
	Наибольшая экспрессия в
	Наибольшая экспрессия в
	Дополнительные справочные данные
	; ;
	Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
	Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
Ортологи
	50856
	26888
	ENSG00000111729
	ENSMUSG00000030148
	Q9UMR7
	Q9QZ15
	NM_016184; NM_194447; NM_194448; NM_194450
	NM_001170332; NM_001170333; NM_011999
	NP_057268; NP_919429; NP_919430; NP_919432
	NP_001163803; NP_001163804; NP_036129
	Информация в Викиданных
Смотреть (человек)	Смотреть (мышь)

CLEC4A (англ. C-type lectin domain family 4 member A, лектин С-типа домен семейство 4 член A; CD367) — мембранный белок, рецептор семейства лектинов типа С. Продукт гена человека CLEC4A^[5]^[6].

Структура

CLEC7A состоит из 237 аминокислот, молекулярная масса 27,5 кДа. Содержит лектиновый домен типа C и ингибирующий ITIM-подобный мотив.

Функции

CLEC4A является мембранным белком 2-го типа из семейства лектинов типа С. Этот рецептор опознавания паттерна связывает углеводы маннозу и фукозу и с меньшей афинностью N-ацетилглюкозамин в Ca²⁺-зависимой манере. Регулирует иммунную реактивность. После связывания антигена рецептор CLEC4A интернализуется в ходе клатрин-зависимого эндоцитоза и доставляет антиген в антиген-представляющий путь, что приводит к презентации антигена CD8+ T-лимфоцитам. Презентация и активация CD8+ T-клеток усиливается агонистами рецепторов TLR7 и TLR8.

Через ITAM-мотив может также участвовать в ингибировании мобилизации кальция, опосредованной B-клеточным рецептором, и фосфорилирования.

Играет роль во взаимодействии вируса HIV-1 и дендритных клеток. Повышает связывание вируса с клеткой, его проникновение и инфицирование.

Тканевая специфичность

Белок экспрессирован в основном на гематопоэтических клетках: на всех циркулирующих антиген-представляющих клетках, включая дендритные клетки, миелоидные клетки, моноциты, макрофагы, B-лимфоциты и эпидермальных клетках Лангерганса. Кроме этого, экспрессирован на лейкоцитах, нейтрофилах периферической крови, в меньше степени - в селезёнке, лимфатических узлах и костном мозге.

Примечания

↑ ¹ ² ³ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000111729 - Ensembl, May 2017
↑ ¹ ² ³ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000030148 - Ensembl, May 2017
↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
↑ Bates E.E., Fournier N., Garcia E., Valladeau J., Durand I., Pin J.J., Zurawski S.M., Patel S., Abrams J.S., Lebecque S., Garrone P., Saeland S. APCs express DCIR, a novel C-type lectin surface receptor containing an immunoreceptor tyrosine-based inhibitory motif (англ.) // J Immunol^[англ.] : journal. — 1999. — September (vol. 163, no. 4). — P. 1973—1983. — PMID 10438934.
↑ Entrez Gene: CLEC4A C-type lectin domain family 4, member A (неопр.). Архивировано 5 декабря 2010 года.

Литература

Drickamer K. C-type lectin-like domains. (англ.) // Curr. Opin. Struct. Biol.. — 1999. — Vol. 9, no. 5. — P. 585—590. — doi:10.1016/S0959-440X(99)00009-3. — PMID 10508765.
Huang X., Yuan Z., Chen G. et al. Cloning and characterization of a novel ITIM containing lectin-like immunoreceptor LLIR and its two transmembrane region deletion variants. (англ.) // Biochem. Biophys. Res. Commun.^[англ.] : journal. — 2001. — Vol. 281, no. 1. — P. 131—140. — doi:10.1006/bbrc.2001.4322. — PMID 11178971.
Richard M., Veilleux P., Rouleau M. et al. The expression pattern of the ITIM-bearing lectin CLECSF6 in neutrophils suggests a key role in the control of inflammation. (англ.) // J. Leukoc. Biol.^[англ.] : journal. — 2002. — Vol. 71, no. 5. — P. 871—880. — PMID 11994513.
Strausberg R.L., Feingold E.A., Grouse L.H. et al. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
Ebner S., Sharon N., Ben-Tal N. Evolutionary analysis reveals collective properties and specificity in the C-type lectin and lectin-like domain superfamily. (англ.) // Proteins : journal. — 2003. — Vol. 53, no. 1. — P. 44—55. — doi:10.1002/prot.10440. — PMID 12945048.
Richard M., Thibault N., Veilleux P. et al. The ITIM-bearing CLECSF6 (DCIR) is down-modulated in neutrophils by neutrophil activating agents. (англ.) // Biochem. Biophys. Res. Commun.^[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 310, no. 3. — P. 767—773. — doi:10.1016/j.bbrc.2003.09.077. — PMID 14550269.
Gerhard D.S., Wagner L., Feingold E.A. et al. The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). (англ.) // Genome Res. : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334. — PMC 528928.
Richard M., Thibault N., Veilleux P. et al. Granulocyte macrophage-colony stimulating factor reduces the affinity of SHP-2 for the ITIM of CLECSF6 in neutrophils: a new mechanism of action for SHP-2. (англ.) // Mol. Immunol.^[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 43, no. 10. — P. 1716—1721. — doi:10.1016/j.molimm.2005.10.006. — PMID 16360206.
Lorentzen J.C., Flornes L., Eklöw C. et al. Association of arthritis with a gene complex encoding C-type lectin-like receptors. (англ.) // Arthritis Rheum.^[англ.] : journal. — 2007. — Vol. 56, no. 8. — P. 2620—2632. — doi:10.1002/art.22813. — PMID 17665455.

[refGRCh38EnsemblENSG00000111729-1] ¹ ² ³ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000111729 - Ensembl, May 2017

[refGRCm38EnsemblENSMUSG00000030148-2] ¹ ² ³ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000030148 - Ensembl, May 2017

[3] Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid10438934-5] Bates E.E., Fournier N., Garcia E., Valladeau J., Durand I., Pin J.J., Zurawski S.M., Patel S., Abrams J.S., Lebecque S., Garrone P., Saeland S. APCs express DCIR, a novel C-type lectin surface receptor containing an immunoreceptor tyrosine-based inhibitory motif (англ.) // J Immunol^[англ.] : journal. — 1999. — September (vol. 163, no. 4). — P. 1973—1983. — PMID 10438934.

[entrez-6] Entrez Gene: CLEC4A C-type lectin domain family 4, member A (неопр.). Архивировано 5 декабря 2010 года.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

Белки: Кластеры дифференцировки
1-50	CD1 (a-c, 1A, 1D, 1E) CD2 CD3 (γ, δ, ε) CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 (a) CD9 CD10 CD11 (a, b, c, d) CD13 CD14 CD15 CD16 (A, B) CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 (A, B) CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 (a, b, c, d) CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 (a, b, c, d, e, f) CD50
51-100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 (E, L, P) CD63 CD64 (A, B, C) CD66 (a, b, c, d, e, f) CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 (a, b) CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 (a, d, e, h, j, k) CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101-150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 (a, b) CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 (a, b) CD121 (a, b) CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151-200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 (a, b, c) CD157 CD158 (a, d, e, i, k) CD159 (a, c) CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 (a, b) CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 (a, b, g) CD174 CD177 CD178 CD179 (a, b) CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201-250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 (a, b) CD212 CD213a (1, 2) CD217 CD218 (a, b) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 (a, b) CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 CD248 CD249
251-300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD270 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301-350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD319 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350
351-400	CD351 CD352 CD353 CD354 CD355 CD357 CD358 CD360 CD361 CD362 CD363 CD364 CD365 CD366 CD367 CD368 CD369 CD370 CD371