Живо́тные (лат. Animalia) — традиционно выделяемая категория организмов, в настоящее время рассматриваемая в качестве биологического царства. Животные являются основным объектом изучения зоологии.
Гу́бки (лат. Porifera) — тип водных, преимущественно морских, многоклеточных животных, ведущих прикреплённый образ жизни. Распространены по всему земному шару от прибрежной зоны и до почти максимальных глубин океана. Насчитывают около 8000 видов.
Гено́м — совокупность наследственного материала, заключённого в клетке организма. Геном содержит биологическую информацию, необходимую для построения и поддержания организма. Большинство геномов, в том числе геном человека и геномы всех остальных клеточных форм жизни, построено из ДНК, однако некоторые вирусы имеют геномы из РНК.
Пласти́нчатые (лат. Placozoa) — тип многоклеточных животных, в который включают как минимум 3 вида: Trichoplax adhaerens, Hoilungia hongkongensis и Polyplacotoma mediterranea. Это маленькие бесцветные организмы, распространённые в спокойных морских водах на небольших глубинах в тропиках и субтропиках; кроме того, их выращивают в лабораториях по всему миру.
Завропси́ды, или ящерообра́зные (лат. Sauropsida), или репти́лии (лат. Reptilia), — клада амниот, объединяющая представителей традиционного класса пресмыкающихся и произошедших от них птиц. Все современные таксоны завропсид относятся к кроновой группе заврий (Sauria), давшей большое таксономическое и морфологическое разнообразие. В этой группе выделяется три основных эволюционных ветви : лепидозавры, архозавры и черепахи (Testudines).
Myxozoa (лат.) — класс или подтип паразитических беспозвоночных из типа стрекающих (Cnidaria). В качестве хозяев представителей выступают морские и пресноводные рыбы и малощетинковые черви; один вид — Buddenbrockia plumatellae — паразитирует на пресноводных мшанках из класса Phylactolaemata. Многие виды паразитируют в промысловых рыбах и могут наносить серьёзный урон хозяйству. Известно около 1200 представителей.
Хоанофлагеллаты, или воротничковые жгутиконосцы (лат. Choanoflagellata), — тип одноклеточных эукариот (протистов). Характерная черта — наличие у клетки одного жгутика, окружённого воротничком из 30—40 микроворсинок. Хоанофлагеллаты представлены одиночными и колониальными формами, обитающими в морских и пресных водах. Описано около 150 видов.
Бореоэуте́рии — таксон млекопитающих, выделенный недавно на основе молекулярных исследований. Название происходит от греческих слов: βόρειο ‘север’ + θεριό ‘зверь’. Магнотряд бореоэутерии состоит из двух сестринских таксонов: Laurasiatheria (лавразиатерии) и Euarchontoglires (эуархонтоглиры); в последний, в частности, входит и человек.
Xenoturbella (лат.) — род морских червеобразных животных, выделяемый в монотипное семейство Xenoturbellidae и подтип ксенотурбеллид (Xenoturbellida) из типа Xenacoelomorpha. Включает 6 видов, которые встречаются в водах Атлантического и Тихого океанов. Для Xenoturbella характерно чрезвычайно простое строение: у них нет централизованной нервной системы, ануса, почек и кровеносной системы. Эволюционное происхождение рода Xenoturbella неясно, и на этот счёт существует несколько гипотез.
Эузухии — клада рептилий, существующая с начала мелового периода (Hylaeochampsa). Все современные крокодилы, а также часть их вымерших родственников, входят в кладу Eusuchia.
Заднежгутиковые, или опистоконты (лат. Opisthokonta), — обширная группа эукариот, включающая царства грибов и животных, а также родственные им эукариотические микроорганизмы, которых ранее относили к расформированному царству протистов. Все генетические и ультраструктурные исследования подтвердили монофилию данного таксона.
Гены-сироты — это гены без обнаруженных гомологов в других эволюционных ветвях. Сироты — подгруппа таксономически ограниченных генов (TRG), которые являются уникальными для определённого таксономического уровня. В отличие от несиротных TRG, сироты обычно считаются уникальными для очень узкого таксона, в основном вида.
Последний общий предок животных — , от которого произошли все представители царства животные. Этот организм был схож с воротничковыми жгутиконосцами (хоанофлагеллатами) и обитал в воде, но больше сказать про него ничего нельзя. Выдвинуты разные гипотезы касаемо строения и происхождения этого организма.
Olfactores — клада хордовых животных, включающая в себя позвоночных и оболочников. Единственные хордовые, не входящие в эту кладу — бесчерепные.
Rhagophthalmidae (лат.) — семейство жесткокрылых из надсемейства Elateroidea. Представители этого семейства жуков имеют биолюминесцентные органы и близки к жукам-светлякам.
Archelosauria (лат.) — клада рептилий, включающая в себя черепах, архозавров и их ближайших вымерших родственников, но не лепидозавров. Большинство филогенетических анализов, основанных на молекулярных данных, подтверждают родство между черепахами и архозаврами. С другой стороны, архелозавры не были подтверждены большинством морфологических анализов, которые вместо этого обнаружили, что черепахи либо являются потомками парарептилий, рано расходящихся диапсидов, не входящих в заврий, или близкие родственники лепидозавров, не входящие в Ankylopoda.
Notopalaeognathae — клада бескилевых птиц, включающая в себя всех представителей инфракласса, кроме самой базальной группы — страусов. Точные взаимоотношения этой группы были выяснены лишь недавно, поскольку[уточнить] тинаму и моа имели общего предка а киви более близко родственны эму и казуарам. Вымершие слоновые птицы с Мадагаскара недавно были идентифицированы как ближайшие родственники киви. Нанду являются либо самой базальной ветвью Notopalaeognathae, либо сестринской группой Novaeratitae.
Columbimorphae (лат.) — клада новонёбных птиц, включающая три отряда: голубеобразные, рябкообразные и мезитообразные. Ранние анализы также устанавливали эту группировку, хотя точные отношения отличались. Некоторые исследования указывают на сестринские отношения между рябчиками и голубями, в то время как другие исследования отдавали предпочтение сестринской группе мезитов и рябков.
Pancrustacea (лат.) — клада, включающая всех ракообразных, в том числе шестиногих. Такое объединение противоречит гипотезе неполноусых (Atelocerata), согласно которой шестиногие (Hexapoda) и многоножки (Myriapoda) являются сестринскими таксонами, а у ракообразных с ними более отдалённое родство. По состоянию на 2010 год таксон Pancrustacea в целом поддерживался, по результатам большинства исследований группа шестиногих обнаруживалась внутри группы ракообразных. Кладу также называли Tetraconata, отсылаясь на наличие четырёх конусных клеток в омматидиях. Некоторые учёные предпочитают это название, чтобы избежать путаницы с использованием слова «pan-» для обозначения клады, включающей краун-группу и всех представителей её стволовой группы.