
Calligra Suite — это пакет офисных приложений, входящий в состав проекта KDE. Изначально создавался как форк пакета KOffice, разрабатывавшегося ранее.

Synaptic — графический интерфейс для системы управления пакетами apt или проекта Debian а также варианта apt-rpm, используемого в дистрибутивах Conectiva и других.
CakePHP — программный каркас для создания веб-приложений, написанный на языке PHP и построенный на принципах открытого ПО. CakePHP реализует паттерн «Модель-Вид-Контроллер» (MVC).

Smart — менеджер пакетов. Его цель — создание разумных и портируемых алгоритмов для решения проблем управления программным обеспечением, его обновлением и установкой. Smart Package Manager выпускается под лицензией GPL и работает на всех основных дистрибутивах Linux. Проект нацелен на привнесение существенного превосходства над родными утилитами, такими как APT, apt-rpm, yum и urpmi.

Enlightenment — оконный менеджер с открытым исходным кодом для X Window System. Название переводится как «просветление» и часто сокращается до одной буквы E.

apt — программа для установки, обновления и удаления программных пакетов в операционных системах Debian и основанных на них, иногда также используется в дистрибутивах, основанных на Mandrake, например Mandriva, ALT Linux и PCLinuxOS. Способна автоматически устанавливать и настраивать программы для UNIX-подобных операционных систем как из предварительно откомпилированных пакетов, так и из исходных кодов.

Umbrello — среда UML-моделирования. Это приложение является свободным программным обеспечением, предназначенным для построения UML диаграмм на платформе Unix. Является CASE инструментом. Umbrello входит в пакет kdesdk оконного менеджера KDE, но также хорошо работает и с другими оконными менеджерами. Пользовательский интерфейс программы прост и функционален.

digiKam — программа для работы с цифровыми фотографиями, каталогизатор и редактор для Linux, macOS и Windows. Программа digiKam органично интегрирована в среду рабочего стола KDE.

CMake — кроссплатформенное программное средство автоматизации сборки программного обеспечения из исходного кода. Не занимается непосредственно сборкой, а лишь генерирует файлы сборки из предварительно написанного файла сценария CMakeLists.txt и предоставляет простой единый интерфейс управления. Помимо этого, способно автоматизировать процесс установки и сборки пакетов.
CheckInstall — компьютерная программа для Unix-подобных операционных систем, созданная с целью облегчить установку и удаление программного обеспечения, скомпилированного из исходных кодов, используя при этом родную для дистрибутива систему управления пакетами. После компиляции программного обеспечения checkinstall может автоматически сгенерировать Slackware-, RPM- или Debian-совместимый пакет, который впоследствии может быть полностью удалён через соответствующий менеджер пакетов. Эта возможность является предпочтительной при установке любых пакетов.
PowerDNS — DNS-сервер, написанный на C++, распространяемый по лицензии GPL для Unix-подобных систем. Разработан в конце 1990-х нидерландским программистом Бертом Хубертом в качестве более гибкой альтернативы BIND; поддерживается сообществом свободного программного обеспечения, коммерческую поддержку оказывает основанная Хубертом компания PowerDNS.COM.

LightDM — это дисплейный менеджер X, который стремится быть лёгким, быстрым, расширяемым и поддерживающим множество рабочих столов. Фронтенд Unity Greeter из состава Ubuntu использует WebKit для отображения основанного на HTML интерфейса входа в систему.
SWFTools — свободный пакет программ командной строки для создания и работы с файлами SWF. Программное обеспечение выпущено по лицензии GNU General Public License и может быть скомпилировано из исходных кодов на C для работы под Linux, Microsoft Windows, и Apple Mac OS X. Для платформы Microsoft Windows также поставляется установщик, который устанавливает уже скомпилированные и готовые к использованию программы. Также под платформу Microsoft Windows существует графический интерфейс для программы pdf2swf.

Apache OpenOffice — свободный пакет офисных приложений, является одним из преемников OpenOffice.org и наследник IBM Lotus Symphony. Впервые появился 2012 году когда корпорация Oracle объявила о передаче всех прав на OpenOffice.org фонду Apache. Официально поддерживается на платформах Linux, Windows, macOS Intel/PowerPC. Существуют неофициальные портированные версии для FreeBSD, Linux PowerPC, OS/2 и Android.

Atom — бесплатный текстовый редактор с открытым исходным кодом для Linux, macOS, Windows с поддержкой плагинов, написанных на JavaScript, и встраиваемых под управлением Git. Большинство плагинов имеют статус свободного программного обеспечения, разрабатываются и поддерживаются сообществом.

Void Linux — независимый дистрибутив Linux, который использует менеджер пакетов XBPS, который был разработан и реализован с нуля и использует систему инициализации runit. Исключая блобы, базовая установка полностью состоит из свободного программного обеспечения, но пользователи могут получить доступ к официальному несвободному репозиторию для установки проприетарного программного обеспечения.
QPDF — свободная библиотека и утилита командной строки для преобразования PDF документов. Позволяет гибко создавать, конкатенировать, поворачивать, масштабировать, разделять, шифровать и линеаризовывать документы для онлайн-просмотра. Имеет встроенный валидатор. QPDF зависит от минимума внешних библиотек zlib, libjpeg-turbo и криптопровайдера операционной системы.

qooxdoo — JavaScript-Фреймворк с открытым исходным кодом для разработки пользовательских интерфейсов. Служит фреймворком для одностраничных приложений. Разработка веб-приложений возможна полностью на JavaScript без использования HTML и каскадных таблиц стилей (CSS). По своему стилю и философии похож на библиотеки виджетов Qt и SWT, о чем заявляли сами разработчики qooxdoo.

Windows Package Manager — это бесплатный менеджер пакетов с открытым исходным кодом, разработанный Microsoft для Windows 10 и Windows 11. Он состоит из утилиты командной строки и набора служб для установки приложений. Независимые поставщики программного обеспечения могут использовать его в качестве канала распространения своих пакетов.
Ниже представлен список известных систем управления пакетами программного обеспечения, классифицированный сперва по формату пакета, а затем по семейству операционных систем.