FTP — протокол передачи файлов по сети, появившийся в 1971 году задолго до HTTP и даже до TCP/IP, благодаря чему является одним из старейших прикладных протоколов. Изначально FTP работал поверх протокола NCP, на сегодняшний день широко используется для распространения ПО и доступа к удалённым хостам. В отличие от TFTP, гарантирует передачу за счёт применения квотируемого протокола.
SSH — сетевой протокол прикладного уровня, позволяющий производить удалённое управление операционной системой и туннелирование TCP-соединений. Схож по функциональности с протоколами Telnet и rlogin, но, в отличие от них, шифрует весь трафик, включая и передаваемые пароли. SSH допускает выбор различных алгоритмов шифрования. SSH-клиенты и SSH-серверы доступны для большинства сетевых операционных систем.
IIS — проприетарный набор серверов для нескольких служб Интернета от компании Microsoft. IIS распространяется с Windows NT.
SCP — утилита и протокол копирования файлов между компьютерами, использующий, в отличие от утилиты RCP, в качестве транспорта не RSH, а шифрованный SSH. Сходная по функционалу утилита — sftp.

WinSCP — свободный графический клиент протоколов SFTP и SCP, предназначенный для Windows. Распространяется по лицензии GNU GPL. Обеспечивает защищённое копирование файлов между компьютером и серверами, поддерживающими эти протоколы.

PuTTY — свободно распространяемый клиент для различных протоколов удалённого доступа, включая SSH, Telnet, rlogin. Также имеется возможность работы через последовательный порт.

Virtual Network Computing (VNC) — система удалённого доступа к рабочему столу компьютера, использующая протокол RFB. Управление осуществляется путём передачи нажатий клавиш на клавиатуре и движений мыши с одного компьютера на другой и ретрансляции содержимого экрана через компьютерную сеть.
FTP-клиент FTP — File Transfer Protocol — программа для упрощения доступа к FTP серверу. В зависимости от назначения может либо предоставлять пользователю простой доступ к удалённому FTP-серверу в режиме текстовой консоли, беря на себя только работу по пересылке команд пользователя и файлов, либо отображать файлы на удалённом сервере как если бы они являлись частью файловой системы компьютера пользователя, либо и то и другое. В последних двух случаях FTP-клиент берёт на себя задачу интерпретации действий пользователя в команды протокола FTP, тем самым давая возможность использовать протокол передачи файлов без ознакомления со всеми его премудростями.

OpenSSH — набор программ, предоставляющих шифрование сеансов связи по компьютерным сетям с использованием протокола SSH. Он был создан под руководством Тео де Раадта как открытая альтернатива проприетарного ПО от SSH Communications Security.
SFTP — протокол прикладного уровня передачи файлов, работающий поверх безопасного канала. Предназначен для копирования и выполнения других операций с файлами поверх надёжного и безопасного соединения. Протокол разработан группой IETF как расширение к SSH-2, однако SFTP допускает реализацию и с использованием иных протоколов сеансового уровня. Разработчики инженерного совета интернета(IETF) заявляют, что, хотя этот протокол описан в контексте протокола SSH-2, он может использоваться в ряде различных приложений, таких как безопасная передача файлов через Transport Layer Security (TLS) и передача информации в приложениях VPN.
rsync — программа для UNIX-подобных систем, которая выполняет синхронизацию файлов и каталогов в двух местах с минимизированием трафика, используя кодирование данных при необходимости. Важным отличием rsync от многих других программ/протоколов является то, что зеркалирование осуществляется одним потоком в каждом направлении. rsync может копировать или отображать содержимое каталога и копировать файлы, опционально используя сжатие и рекурсию.
Expect — инструмент для автоматизации и тестирования в ОС Unix, написанный Don Libes как расширение к скрипт-языку Tcl, для интерактивных приложений таких, как telnet, ftp, passwd, fsck, rlogin, tip, ssh, и других. С помощью Tk интерактивные приложения могут быть использованы с графическим интерфейсом (GUI) X11.

lftp — консольный FTP-клиент для UNIX и UNIX-подобных операционных систем. Программа написана Александром Лукьяновым и распространяется по лицензии GNU GPL.
FTPS — это расширение широко используемого протокола передачи данных FTP, которое добавляет поддержку для криптографических протоколов уровней транспортной безопасности и защищенных сокетов.

Unreal Commander — бесплатный двухпанельный файловый менеджер с закрытым исходным кодом, работающий под управлением Microsoft Windows.
Handy Backup — программа, разработанная компанией «Новософт», позволяющая осуществлять резервное копирование, восстановление и синхронизацию данных из различных источников.

WebDrive — условно бесплатный FTP-клиент, а также файловый менеджер для Microsoft Windows и Mac OS X, который позволяет открывать и редактировать файлы на сервере без предварительной загрузки файлов на компьютер, разработанный South River Technologies, LLC.

GigaGet — свободный менеджер закачек с открытым исходным кодом для загрузки файлов из Интернета или локальной сети. Утилита не является кроссплатформенным программным обеспечением и работает только на компьютерах под управлением 32-битных операционных систем Microsoft Windows.

Offline Explorer — это условно бесплатный офлайн-браузер, разработанный компанией Metaproducts для работы под управлением операционной системы Microsoft Windows, который позволяет скачивать файлы, а также целые веб-сайты в Интернете по протоколам HTTP, FTP, HTTPS, MMS, RTSP и Bittorrent.

gFTP — кроссплатформенный многопоточный FTP-клиент, позволяющий безопасно и надёжно обмениваться файлами между локальным компьютером и серверами в Интернете.