EED

Перейти к навигации Перейти к поиску

Эмбриональное развитие эктодермы

Представлено на основе PDB 3IIW.

Представлено на основе PDB 3IIW.

Доступные структуры

Поиск ортологов: PDBe, RCSB

Список идентификаторов PDB

3IIW, 3IIY, 3IJ0, 3IJ1, 3IJC, 3JPX, 3JZG, 3JZH, 3JZN, 3K26, 3K27

Идентификаторы

EED ; HEED; WAIT1

Внешние ID

OMIM: 605984 MGI: 95286 HomoloGene: 2814 IUPHAR: GeneCards: Ген EED

Генная онтология

Функция	• chromatin binding • protein binding • histone methyltransferase activity • identical protein binding
Компонент клетки	• sex chromatin • nucleus • nucleoplasm • nucleolus • cytoplasm • ESC/E(Z) complex • pronucleus
Биологический процесс	• regulation of gene expression by genetic imprinting • transcription, DNA-templated • histone methylation • negative regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of histone H3-K27 methylation
Источники: Amigo / QuickGO

Профиль экспрессии РНК

Больше информации

Ортологи

Вид

Человек

Мышь

Entrez

ENSG00000074266

ENSMUSG00000030619

RefSeq (мРНК)

RefSeq (белок)

Локус (UCSC)

Chr 11:
85.96 – 85.99 Mb

Chr 7:
89.95 – 89.98 Mb

Поиск в PubMed

Белок группы Polycomb EED (эмбрионального развития эктодермы) (англ. Polycomb protein EED) — белок, кодируемый у человека геном EED^[1]^[2]^[3].

Функции

Белок Polycomb EED является членом семейства Polycomb (PcG). Члены семейства PcG образуют многомерные белковые комплексы, которые участвуют в поддержании транскрипционно-репрессивного состояния генов в ходе последовательных клеточных поколений. Этот белок взаимодействует с усилителем zeste 2, цитоплазматическим хвостом интегрина β7, белком MА вируса иммунодефицита типа 1 (ВИЧ-1) и гистондеацетилазами. Этот белок опосредует подавление активности генов гистонов посредством деацетилирования и может выступать в качестве специфичного регулятора функции интегрина. Для этого гена были определены два варианта транскриптов, кодирующих различные изоформы^[3].

Клиническое значение

У человека мутация de novo^[англ.] в EED, как сообщалось, приводит к развитию симптомов, напоминающих синдром Уивера^[4].

Взаимодействия с другими белками

EED, как было выявлено, взаимодействует с:

Примечания

↑ ¹ ² Rietzler M., Bittner M., Kolanus W., Schuster A., Holzmann B. The human WD repeat protein WAIT-1 specifically interacts with the cytoplasmic tails of beta7-integrins. (англ.) // The Journal of biological chemistry. — 1998. — Vol. 273, no. 42. — P. 27459—27466. — PMID 9765275. [исправить]
↑ Schumacher A., Lichtarge O., Schwartz S., Magnuson T. The murine Polycomb-group gene eed and its human orthologue: functional implications of evolutionary conservation. (англ.) // Genomics. — 1998. — Vol. 54, no. 1. — P. 79—88. — doi:10.1006/geno.1998.5509. — PMID 9806832. [исправить]
↑ ¹ ² Entrez Gene: EED embryonic ectoderm development (неопр.).
↑ Cohen A. S., Tuysuz B., Shen Y., Bhalla S. K., Jones S. J., Gibson W. T. A novel mutation in EED associated with overgrowth. (англ.) // Journal of human genetics. — 2015. — doi:10.1038/jhg.2015.26. — PMID 25787343. [исправить]
↑ ¹ ² ³ van der Vlag J., Otte A. P. Transcriptional repression mediated by the human polycomb-group protein EED involves histone deacetylation. (англ.) // Nature genetics. — 1999. — Vol. 23, no. 4. — P. 474—478. — doi:10.1038/70602. — PMID 10581039. [исправить]
↑ van Lohuizen M., Tijms M., Voncken J. W., Schumacher A., Magnuson T., Wientjens E. Interaction of mouse polycomb-group (Pc-G) proteins Enx1 and Enx2 with Eed: indication for separate Pc-G complexes. (англ.) // Molecular and cellular biology. — 1998. — Vol. 18, no. 6. — P. 3572—3579. — PMID 9584197. [исправить]
↑ Denisenko O., Shnyreva M., Suzuki H., Bomsztyk K. Point mutations in the WD40 domain of Eed block its interaction with Ezh2. (англ.) // Molecular and cellular biology. — 1998. — Vol. 18, no. 10. — P. 5634—5642. — PMID 9742080. [исправить]
↑ Jin Q., van Eynde A., Beullens M., Roy N., Thiel G., Stalmans W., Bollen M. The protein phosphatase-1 (PP1) regulator, nuclear inhibitor of PP1 (NIPP1), interacts with the polycomb group protein, embryonic ectoderm development (EED), and functions as a transcriptional repressor. (англ.) // The Journal of biological chemistry. — 2003. — Vol. 278, no. 33. — P. 30677—30685. — doi:10.1074/jbc.M302273200. — PMID 12788942. [исправить]
↑ Enünlü I., Pápai G., Cserpán I., Udvardy A., Jeang K. T., Boros I. Different isoforms of PRIP-interacting protein with methyltransferase domain/trimethylguanosine synthase localizes to the cytoplasm and nucleus. (англ.) // Biochemical and biophysical research communications. — 2003. — Vol. 309, no. 1. — P. 44—51. — PMID 12943661. [исправить]

Литература

Joseph A. M., Kumar M., Mitra D. Nef: "necessary and enforcing factor" in HIV infection. (англ.) // Current HIV research. — 2005. — Vol. 3, no. 1. — P. 87—94. — PMID 15638726. [исправить]
Van Maele B., Debyser Z. HIV-1 integration: an interplay between HIV-1 integrase, cellular and viral proteins. (англ.) // AIDS reviews. — 2005. — Vol. 7, no. 1. — P. 26—43. — PMID 15875659. [исправить]
Jones C. A., Ng J., Peterson A. J., Morgan K., Simon J., Jones R. S. The Drosophila esc and E(z) proteins are direct partners in polycomb group-mediated repression. (англ.) // Molecular and cellular biology. — 1998. — Vol. 18, no. 5. — P. 2825—2834. — PMID 9566901. [исправить]
van Lohuizen M., Tijms M., Voncken J. W., Schumacher A., Magnuson T., Wientjens E. Interaction of mouse polycomb-group (Pc-G) proteins Enx1 and Enx2 with Eed: indication for separate Pc-G complexes. (англ.) // Molecular and cellular biology. — 1998. — Vol. 18, no. 6. — P. 3572—3579. — PMID 9584197. [исправить]
Sewalt R. G., van der Vlag J., Gunster M. J., Hamer K. M., den Blaauwen J. L., Satijn D. P., Hendrix T., van Driel R., Otte A. P. Characterization of interactions between the mammalian polycomb-group proteins Enx1/EZH2 and EED suggests the existence of different mammalian polycomb-group protein complexes. (англ.) // Molecular and cellular biology. — 1998. — Vol. 18, no. 6. — P. 3586—3595. — PMID 9584199. [исправить]
Denisenko O., Shnyreva M., Suzuki H., Bomsztyk K. Point mutations in the WD40 domain of Eed block its interaction with Ezh2. (англ.) // Molecular and cellular biology. — 1998. — Vol. 18, no. 10. — P. 5634—5642. — PMID 9742080. [исправить]
Peytavi R., Hong S. S., Gay B., d'Angeac AD, Selig L., Bénichou S., Benarous R., Boulanger P. HEED, the product of the human homolog of the murine eed gene, binds to the matrix protein of HIV-1. (англ.) // The Journal of biological chemistry. — 1999. — Vol. 274, no. 3. — P. 1635—1645. — PMID 9880543. [исправить]
van der Vlag J., Otte A. P. Transcriptional repression mediated by the human polycomb-group protein EED involves histone deacetylation. (англ.) // Nature genetics. — 1999. — Vol. 23, no. 4. — P. 474—478. — doi:10.1038/70602. — PMID 10581039. [исправить]
Satijn D. P., Hamer K. M., den Blaauwen J., Otte A. P. The polycomb group protein EED interacts with YY1, and both proteins induce neural tissue in Xenopus embryos. (англ.) // Molecular and cellular biology. — 2001. — Vol. 21, no. 4. — P. 1360—1369. — doi:10.1128/MCB.21.4.1360-1369.2001. — PMID 11158321. [исправить]
Kuzmichev A., Nishioka K., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D. Histone methyltransferase activity associated with a human multiprotein complex containing the Enhancer of Zeste protein. (англ.) // Genes & development. — 2002. — Vol. 16, no. 22. — P. 2893—2905. — doi:10.1101/gad.1035902. — PMID 12435631. [исправить]
Jin Q., van Eynde A., Beullens M., Roy N., Thiel G., Stalmans W., Bollen M. The protein phosphatase-1 (PP1) regulator, nuclear inhibitor of PP1 (NIPP1), interacts with the polycomb group protein, embryonic ectoderm development (EED), and functions as a transcriptional repressor. (англ.) // The Journal of biological chemistry. — 2003. — Vol. 278, no. 33. — P. 30677—30685. — doi:10.1074/jbc.M302273200. — PMID 12788942. [исправить]
Enünlü I., Pápai G., Cserpán I., Udvardy A., Jeang K. T., Boros I. Different isoforms of PRIP-interacting protein with methyltransferase domain/trimethylguanosine synthase localizes to the cytoplasm and nucleus. (англ.) // Biochemical and biophysical research communications. — 2003. — Vol. 309, no. 1. — P. 44—51. — PMID 12943661. [исправить]
Violot S., Hong S. S., Rakotobe D., Petit C., Gay B., Moreau K., Billaud G., Priet S., Sire J., Schwartz O., Mouscadet J. F., Boulanger P. The human polycomb group EED protein interacts with the integrase of human immunodeficiency virus type 1. (англ.) // Journal of virology. — 2003. — Vol. 77, no. 23. — P. 12507—12522. — PMID 14610174. [исправить]
Witte V., Laffert B., Rosorius O., Lischka P., Blume K., Galler G., Stilper A., Willbold D., D'Aloja P., Sixt M., Kolanus J., Ott M., Kolanus W., Schuler G., Baur A. S. HIV-1 Nef mimics an integrin receptor signal that recruits the polycomb group protein Eed to the plasma membrane. (англ.) // Molecular cell. — 2004. — Vol. 13, no. 2. — P. 179—190. — PMID 14759364. [исправить]
Cao R., Zhang Y. SUZ12 is required for both the histone methyltransferase activity and the silencing function of the EED-EZH2 complex. (англ.) // Molecular cell. — 2004. — Vol. 15, no. 1. — P. 57—67. — doi:10.1016/j.molcel.2004.06.020. — PMID 15225548. [исправить]
Pasini D., Bracken A. P., Jensen M. R., Lazzerini Denchi E., Helin K. Suz12 is essential for mouse development and for EZH2 histone methyltransferase activity. (англ.) // The EMBO journal. — 2004. — Vol. 23, no. 20. — P. 4061—4071. — doi:10.1038/sj.emboj.7600402. — PMID 15385962. [исправить]

Похожие исследовательские статьи

Белки группы polycomb — это семейство белков, которые способны ремоделировать хроматин. Эти белки-регуляторы были впервые описаны у дрозофил, где они подавляют гомеозисные гены, контролирующие индивидуальные отличия сегментов развивающегося эмбриона.

Белки группы Trithorax — это белки, регулирующие структуру хроматина и участвующие в поддержании экспрессии генов. Это семейство белков гетерогенно, входящие в него белки образуют сложные белковые комплексы, способные связываться с хроматином. Так, функция самого белка Trithorax в составе комплекса TAC1 — поддержание локального открытого состояния хроматина путём монометилирования лизина-4 гистона H3 (H3K4me1), что сохраняет активность окрестных генов в ряду клеточных поколений. Действие этой гистоновой метки усиливается ацетилированием лизина-27 гистона H3 (H3K27ac), привносимой тем же комплексом TAC1. В дополнение к этому некоторые белки группы Trithorax ремоделируют хроматин, используя энергию АТФ для активации нуклеосом.

<span class="mw-page-title-main">PCAF</span>

Фактор, связанный с P300/СВР (PCAF), также известный как K(лизиновая) ацетилтрансфераза 2B (KAT2B) — ген человека и коактиватор транскрипции, связанный с p53.

<span class="mw-page-title-main">Гистондеацетилаза 1</span>

Гистондеацетилаза 1 — фермент, который у человека кодируется геном HDAC1 .

<span class="mw-page-title-main">POLR2A</span>

Субъединица RPB1 ДНК-управляемой РНК-полимеразы II , также известная как RPB1 , — фермент, кодируемый у человека геном POLR2A .

<span class="mw-page-title-main">POLR2G</span>

Субъединица RPB7 ДНК-управляемой РНК-полимеразы II — фермент, кодируемый у человека геном POLR2G .

<span class="mw-page-title-main">POLR2J</span>

Субъединица RPB11 ДНК-управляемой РНК-полимеразы II — фермент, кодируемый у человека геном POLR2J .

<span class="mw-page-title-main">POLR2E</span>

Субъединица RPABC1 ДНК-зависимой РНК-полимеразы I, II и III — белок, кодируемый у человека геном POLR2E .

<span class="mw-page-title-main">POLR2L</span>

Субъединица RPABC5 ДНК-управляемых РНК-полимераз I, II и III — белок, кодируемый у человека геном POLR2L .

<span class="mw-page-title-main">Гистондеацетилаза 2</span>

Гистондеацетилаза 2 — фермент из семейства деацетилаз гистонов, кодируемый у человека геном HDAC2 .

<span class="mw-page-title-main">CHD4</span>

Геликазный хромодомен ДНК-связывающего белка 4 — фермент, кодируемый у человека геном CHD4.

Компонент комплексного корепрессора Sin3 гистондеацетилазы SDS3 — фермент, кодируемый у человека геном SUDS3 .

<span class="mw-page-title-main">SAP30</span>

Белок, ассоциированный с Sin3A, 30 кДа, известный также как SAP30, — белок, кодируемый у человека геном SAP30.

<span class="mw-page-title-main">RAD9A</span>

Белок контрольной точки управления клеточным циклом RAD9A — белок, кодируемый у человека геном RAD9A .

<span class="mw-page-title-main">MLL</span>

Гистон лизин-N-метилтрансфераза 2A , известный также как белок острого лимфобластного лейкоза 1 (ALL-1), миелоидная/лимфоидная или смешанная линия лейкоза (MLL), или белок цинкового пальца HRX (HRX) — фермент, кодируемый у человека геном KMT2A .

<span class="mw-page-title-main">CTBP1</span>

С-конец связывающий белок 1, известный также как CtBP1 — белок, кодируемый у человека геном CTBP1.

<span class="mw-page-title-main">CREBBP</span>

CREB-свя́зывающий бело́к — белок, который у человека кодируется геном CREBBP, локализованным на 16-й хромосоме. CBP функционирует как транскрипционный коактиватор, то есть посредством белок-белковых взаимодействий связывает различные белковые трансактиваторы транскрипции с основным транскрипционным комплексом. Впервые описан исследователями в 1993 году.

<span class="mw-page-title-main">Циклин A1</span>

Цикли́н A1 — белок, кодируемый у человека геном CCNA1.

<span class="mw-page-title-main">Циклинзависимая киназа 2</span>

Циклинзави́симая кина́за 2 — фермент, кодируемый у человека геном CDK2.

<span class="mw-page-title-main">Гистондеацетилаза 6</span>

Гистондеацетилаза 6 — фермент, кодируемый у человека геном HDAC6.

Эта страница основана на статье Википедии.
Текст доступен на условиях лицензии CC BY-SA 4.0; могут применяться дополнительные условия.
Изображения, видео и звуки доступны по их собственным лицензиям.