EMR2

Перейти к навигацииПерейти к поиску
EMR2
Доступные структуры
PDBПоиск по базе UniProt: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

2BOX, 2BO2, 2BOU

Идентификаторы
ПсевдонимыADGRE2, CD312, VBU, EMR2, adhesion G protein-coupled receptor E2, CD97
Внешние IDOMIM: 606100 HomoloGene: 113735 GeneCards: ADGRE2
Расположение гена (человек)
19-я хромосома человека
Хр.19-я хромосома человека[1]
19-я хромосома человека
Расположение в геноме ADGRE2
Расположение в геноме ADGRE2
Локус19p13.12Начало14,732,392 bp[1]
Конец14,778,560 bp[1]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
Дополнительные справочные данные
BioGPS
Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

30817

н/д

Ensembl

ENSG00000127507

н/д

UniProt

Q9UHX3

н/д

RefSeq (мРНК)
NM_001271052
NM_013447
NM_152916
NM_152917
NM_152918

NM_152919
NM_152920
NM_152921

н/д

RefSeq (белок)

NP_001257981
NP_038475

н/д

Локус (UCSC)Chr 19: 14.73 – 14.78 Mbн/д
Поиск по PubMedИскать[2]н/д
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)

EMR2 (англ. EGF-like module-containing mucin-like hormone receptor-like 2; CD312) — мембранный белок группы адгезивных рецепторов, сопряжённых с G-белком[3][4]. Продукт гена человека ADGRE2[5]. Белки этой группы характеризуются относительно большим внеклеточным участком с особым аутопротеолитическим участком[6]. EMR2 экспрессирован на моноцитах и макрофагах, на дендритных клетках и всех типах гранулоцитов[7] Альтернативный сплайсинг приводит к полиморфизму EMR2, который в результате содержит от 2 до 5 EGF-подобных доменов на N-концевом участке белка. Эти домены у EMR2 на 97% идентичны с таковыми белка CD97[8]. Аналог гена Emr2 отсутствует в геноме мыши.[9] Ген также тесно связан с геном EMR3 на хромосоме 19.

Лиганд

EMR2, так же как белок CD97, связывает хондроитинсульфат B и таким образом играет роль в прикреплении клетки[10].

Примечания

  1. ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000127507 - Ensembl, May 2017
  2. ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  3. ↑ Stacey M., Yona S. Adhesion-GPCRs: Structure to Function (Advances in Experimental Medicine and Biology) (англ.). — Berlin: Springer, 2011. — ISBN 1-4419-7912-3.
  4. ↑ Langenhan T., Aust G., Hamann J. Sticky signaling--adhesion class G protein-coupled receptors take the stage (англ.) // Science Signaling[англ.] : journal. — 2013. — May (vol. 6, no. 276). — P. re3. — doi:10.1126/scisignal.2003825. — PMID 23695165.
  5. ↑ Hamann J., Aust G., Araç D., Engel F.B., Formstone C., Fredriksson R., Hall R.A., Harty B.L., Kirchhoff C., Knapp B., Krishnan A., Liebscher I., Lin H.H., Martinelli D.C., Monk K.R., Peeters M.C., Piao X., Prömel S., Schöneberg T., Schwartz T.W., Singer K., Stacey M., Ushkaryov Y.A., Vallon M., Wolfrum U., Wright M.W., Xu L., Langenhan T., Schiöth H.B. International Union of Basic and Clinical Pharmacology. XCIV. Adhesion G protein-coupled receptors (англ.) // Pharmacological Reviews[англ.] : journal. — 2015. — April (vol. 67, no. 2). — P. 338—367. — doi:10.1124/pr.114.009647. — PMID 25713288. — PMC 4394687.
  6. ↑ Araç D., Boucard A.A., Bolliger M.F., Nguyen J., Soltis S.M., Südhof T.C., Brunger A.T. A novel evolutionarily conserved domain of cell-adhesion GPCRs mediates autoproteolysis (англ.) // The EMBO Journal : journal. — 2012. — March (vol. 31, no. 6). — P. 1364—1378. — doi:10.1038/emboj.2012.26. — PMID 22333914. — PMC 3321182.
  7. ↑ Lin H.H., Stacey M., Hamann J., Gordon S., McKnight A.J. Human EMR2, a novel EGF-TM7 molecule on chromosome 19p13.1, is closely related to CD97 (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press, 2000. — July (vol. 67, no. 2). — P. 188—200. — doi:10.1006/geno.2000.6238. — PMID 10903844.
  8. ↑ Gordon S., Hamann J., Lin H.H., Stacey M. F4/80 and the related adhesion-GPCRs (англ.) // European Journal of Immunology[англ.] : journal. — 2011. — September (vol. 41, no. 9). — P. 2472—2476. — doi:10.1002/eji.201141715. — PMID 21952799.
  9. ↑ Kwakkenbos M.J., Matmati M., Madsen O., Pouwels W., Wang Y., Bontrop R.E., Heidt P.J., Hoek R.M., Hamann J. An unusual mode of concerted evolution of the EGF-TM7 receptor chimera EMR2 (англ.) // The FASEB Journal[англ.] : journal. — Federation of American Societies for Experimental Biology[англ.], 2006. — December (vol. 20, no. 14). — P. 2582—2584. — doi:10.1096/fj.06-6500fje. — PMID 17068111.
  10. ↑ Stacey M., Chang G.W., Davies J.Q., Kwakkenbos M.J., Sanderson R.D., Hamann J., Gordon S., Lin H.H. The epidermal growth factor-like domains of the human EMR2 receptor mediate cell attachment through chondroitin sulfate glycosaminoglycans (англ.) // Blood[англ.] : journal. — American Society of Hematology[англ.], 2003. — October (vol. 102, no. 8). — P. 2916—2924. — doi:10.1182/blood-2002-11-3540. — PMID 12829604.