EVI2B

Перейти к навигацииПерейти к поиску
EVI2B
Идентификаторы
ПсевдонимыEVI2B, CD361, D17S376, EVDB, ecotropic viral integration site 2B
Внешние IDOMIM: 158381 MGI: 5439444 HomoloGene: 48438 GeneCards: EVI2B
Расположение гена (человек)
17-я хромосома человека
Хр.17-я хромосома человека[1]
17-я хромосома человека
Расположение в геноме EVI2B
Расположение в геноме EVI2B
Локус17q11.2Начало31,303,770 bp[1]
Конец31,314,105 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
11-я хромосома мыши
Хр.11-я хромосома мыши[2]
11-я хромосома мыши
Расположение в геноме EVI2B
Расположение в геноме EVI2B
Локус11 B5|11Начало79,404,211 bp[2]
Конец79,421,415 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
BioGPS
Дополнительные справочные данные
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_006495

NM_146023

RefSeq (белок)

NP_006486

NP_666135
NP_001070964

Локус (UCSC)Chr 17: 31.3 – 31.31 MbChr 11: 79.4 – 79.42 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

EVI2B (англ. ecotropic viral integration site 2B) — мембранный белок, продукт гена EVI2B.[5][6]

Тканевая специфичность

EVI2B синтезируется клетками костного мозга, периферическими моноцитами и фибробластами. Обнаружен также на лимфобластоидных клеточных линиях, трансформированных вирусом Эпштейна — Барр.

Структура

Белок состоит из 427 аминокислот, молекулярная масса — 46,1 кДа. Это мембранный белок, содержит единственный трансмембранный участок. Цитозольный фрагмент имеет до 3 участков гликозилирования и 2 участка фосфорилирования (1 треонин и 1 серин).

Ген

Ген EVI2B расположен на 17-й хромосоме человека, в том же интроне гена NF1, что и ген EVI2A.

В патологии

Повышенная экспрессия белка ассоциирована с усиленным метастазированием клеток рака толстой кишки.[7]

Примечания

  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000185862 - Ensembl, May 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000070354 - Ensembl, May 2017
  3. Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. Cawthon R.M., Andersen L.B., Buchberg A.M., Xu G.F., O'Connell P., Viskochil D., Weiss R.B., Wallace M.R., Marchuk D.A., Culver M., et al. cDNA sequence and genomic structure of EV12B, a gene lying within an intron of the neurofibromatosis type 1 gene (англ.) // Genomics : journal. — 1991. — June (vol. 9, no. 3). — P. 446—460. — doi:10.1016/0888-7543(91)90410-G. — PMID 1903357.
  6. Entrez Gene: EVI2B ecotropic viral integration site 2B. Архивировано 5 декабря 2010 года.
  7. Huang, MY.; Wang, HM.; Tok, TS.; Chang, HJ.; Chang, MS.; Cheng, TL.; Wang, JY.; Lin, SR. EVI2B, ATP2A2, S100B, TM4SF3, and OLFM4 as potential prognostic markers for postoperative Taiwanese colorectal cancer patients. (англ.) // DNA and Cell Biology[англ.] : journal. — 2012. — April (vol. 31, no. 4). — P. 625—635. — doi:10.1089/dna.2011.1365. — PMID 22047082.

Библиография

  • Matesanz-Isabel, J.; Sintes, J.; Llinàs, L.; de Salort, J.; Lázaro, A.; Engel, P. New B-cell CD molecules. (англ.) // Immunology Letters[англ.] : journal. — 2011. — January (vol. 134, no. 2). — P. 104—112. — doi:10.1016/j.imlet.2010.09.019. — PMID 20933010.
  • Kaufmann, D.; Gruener, S.; Braun, F.; Stark, M.; Griesser, J.; Hoffmeyer, S.; Bartelt, B. EVI2B, a gene lying in an intron of the neurofibromatosis type 1 (NF1) gene, is as the NF1 gene involved in differentiation of melanocytes and keratinocytes and is overexpressed in cells derived from NF1 neurofibromas. (англ.) // DNA and Cell Biology[англ.] : journal. — 1999. — May (vol. 18, no. 5). — P. 345—356. — doi:10.1089/104454999315240. — PMID 10360836.
  • Rasmussen, SA.; Ho, VT.; Colman, SD.; Abernathy, CR.; Wallace, MR. A multiplex-PCR test for EVI2A and EVI2B polymorphisms within the human NF1 gene. (англ.) // Mammalian Genome[англ.] : journal. — 1996. — March (vol. 7, no. 3). — P. 233—234. — PMID 8833251.