XML — «расширяемый язык разметки». Рекомендован Консорциумом Всемирной паутины (W3C). Спецификация XML описывает XML-документы и частично описывает поведение XML-процессоров. XML разрабатывался как язык с простым формальным синтаксисом, удобный для создания и обработки документов как программами, так и человеком, с акцентом на использование в Интернете. Язык называется расширяемым, поскольку он не фиксирует разметку, используемую в документах: разработчик волен создать разметку в соответствии с потребностями к конкретной области, будучи ограниченным лишь синтаксическими правилами языка. Расширение XML — это конкретная грамматика, созданная на базе XML и представленная словарём тегов и их атрибутов, а также набором правил, определяющих, какие атрибуты и элементы могут входить в состав других элементов. Сочетание простого формального синтаксиса, удобства для человека, расширяемости, а также базирование на кодировках Юникод для представления содержания документов привело к широкому использованию как, собственно, XML, так и множества производных специализированных языков на базе XML в самых разнообразных программных средствах.
XPath — язык запросов к элементам XML-документа. Разработан для организации доступа к частям документа XML в файлах трансформации XSLT и является стандартом консорциума W3C. XPath призван реализовать навигацию по DOM в XML. В XPath используется компактный синтаксис, отличный от принятого в XML. В 2007 году завершилась разработка версии 2.0, которая теперь является составной частью языка XQuery 1.0. В декабре 2009 года началась разработка версии 2.1, которая использует XQuery 1.1.
XSLT — язык преобразования XML-документов. Спецификация XSLT входит в состав XSL и является рекомендацией W3C.
Oracle Database или Oracle RDBMS — объектно-реляционная система управления базами данных компании Oracle.
Веб-служба, веб-сервис — идентифицируемая уникальным веб-адресом (URL-адресом) программная система со стандартизированными интерфейсами.
Язы́к запро́сов — искусственный язык, на котором делаются запросы к базам данных и информационно-поисковым системам.
Berkeley DB (BDB) — высокопроизводительная встраиваемая система управления базами данных, реализованная в виде библиотеки. Нереляционная система — хранит пары «ключ — значение» как массивы байтов и поддерживает множество значений для одного ключа.
XQuery — язык запросов, разработанный для обработки данных в формате XML. XQuery использует XML как свою модель данных.
Hibernate — библиотека для языка программирования Java, предназначенная для решения задач объектно-реляционного отображения (ORM), самая популярная реализация спецификации JPA. Распространяется свободно на условиях GNU Lesser General Public License.
Xist — ген, кодирующий РНК и локализованный на Х-хромосоме плацентарных млекопитающих, является ключевым эффектором в инактивации Х-хромосомы. Он входит в состав комплекса Xic, наряду с двумя другими РНК-кодирующими генами и двумя белоккодирующими генами. Продукт гена Xist — Xist-РНК — представляет собой крупный транскрипт, который экспрессируется на неактивной хромосоме и не экспрессируется на активной. Процессинг этого транскрипта напоминает процессинг мРНК и тоже включает этапы сплайсинга и полиаденилирования, однако он остаётся в ядре и не транслируется. Было высказано предположение, что ген Xist по крайней мере частично образовался как часть белоккодирующего гена, который впоследствии стал псевдогеном. Инактивированная Х-хромосома покрыта Xist-РНК, который необходим для процесса инактивации. Х-хромосома, лишённая гена Xist, не будет инактивирована, однако дупликация этого гена на другой хромосоме вызывает инактивацию и первой хромосомы тоже.
Sedna — система управления базами данных, изначально спроектированная для хранения и обработки XML-данных. Разработана и развивается Отделом управления данными и информационных систем Института системного программирования РАН. Система распространяется в открытых исходных текстах. Существуют версии под Windows, Linux, Mac OS и FreeBSD.
SQL/XML — спецификации, связанные с XML) — расширение стандарта SQL, закрепленное в документе ISO/IEC 9075-14:2003 (SQL:2003). SQL/XML определяет расширения SQL для использования XML в сочетании с SQL. Вводятся типы данных XML наряду с несколькими подпрограммами, функциями, а также связывание XML-в-SQL типов данных для поддержки обработки и хранения XML в SQL-базах данных.
Инактивация X-хромосомы — эпигенетический процесс, в результате которого во время раннего эмбрионального развития одна из двух копий X-хромосом, представленных в клетках самок млекопитающих, становится транскрипционно молчащей. ДНК неактивной X-хромосомы при этом формирует факультативный гетерохроматин.
NoSQL — обозначение широкого класса разнородных систем управления базами данных (СУБД), появившихся в конце 2000-х — начале 2010-х годов и существенно отличающихся от традиционных реляционных СУБД с доступом к данным средствами языка SQL. Применяется к системам, в которых делается попытка решить проблемы масштабируемости и доступности за счёт полного или частичного отказа от требований атомарности и согласованности данных.
Altova — компания, основанная в 1992 году, разработчик коммерческого ПО с штаб-квартирами в Beverly, MA (США) и Вене (Австрия). Компания разрабатывает интегрированные средства разработки для работы с XML, базами данных, UML и управления данными.
BaseX — компактная система управления базами данных XML, разрабатываемая в рамках коллективного проекта на платформе GitHub. Эта система преимущественно применяется для сохранения, запроса и визуализации объёмных XML-документов и XML-коллекций.. BaseX может быть использован в различных операционных системах, на основании свободной Open-Source-лицензии.
Документоориентированная СУБД — СУБД, специально предназначенная для хранения иерархических структур данных (документов) и обычно реализуемая с помощью подхода NoSQL. В основе документоориентированных СУБД лежат документные хранилища, имеющие структуру дерева. Структура дерева начинается с корневого узла и может содержать несколько внутренних и листовых узлов. Листовые узлы содержат данные, которые при добавлении документа заносятся в индексы, что позволяет даже при достаточно сложной структуре находить место (путь) искомых данных. API для поиска позволяет находить по запросу документы и части документов. В отличие от хранилищ типа ключ-значение, выборка по запросу к документному хранилищу может содержать части большого количества документов без полной загрузки этих документов в оперативную память.
GeneCards — база данных человеческих генов, что обеспечивает геномную, протеомную, транскриптомную, генетическую и функциональную информацию о всех известных и предсказанных генов человека. Она разрабатывается и поддерживается Коронным центром человеческого генома в Институте науки им. Вейцмана.
Выразительность языка программирования — качество языка, показывающее, насколько разнообразны идеи, которые можно реализовать на этом языке, и насколько легко они читаются.
Консервация базы данных обычно включает в себя преобразование информации, хранящейся в базе данных, в форму, доступную в долгосрочной перспективе по мере изменения технологии, без потери первоначальных характеристик данных. Консервацию базы данных не следует путать с резервным копированием. В то время как цель резервного копирования — сохранить версию базы данных, актуальную на конкретный момент времени, чтобы, в случае каких-то проблем иметь возможность быстро восстановить её и продолжить работу с ней, в том числе изменяя её, цель консервации — обеспечить доступ к неизменяемому содержимому базы данных на относительно долгий срок, в течение которого могли бы поменяться технические свойства СУБД, в которой эта база данных была создана, а прикладной ПО, использованное для создания консервируемой базы данных могло бы исчезнуть из доступа. Консервация не подразумевает оперативности восстановления, но направлена на максимально точное воспроизведение состояния в БД, в том числе в будущих системах, о которых нам на момент консервации БД ничего не известно.
Медиафайлы на Викискладе