FABP1

Перейти к навигацииПерейти к поиску
FABP1
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

2F73, 2L67, 2L68, 2LKK, 2PY1, 3B2H, 3B2I, 3B2J, 3B2K, 3B2L, 3STK, 3STM, 3STN, 3VG2, 3VG3, 3VG4, 3VG5, 3VG6, 3VG7

Идентификаторы
ПсевдонимыFABP1, FABPL, L-FABP, fatty acid binding protein 1
Внешние IDOMIM: 134650 MGI: 95479 HomoloGene: 1106 GeneCards: FABP1
Расположение гена (человек)
2-я хромосома человека
Хр.2-я хромосома человека[1]
2-я хромосома человека
Расположение в геноме FABP1
Расположение в геноме FABP1
Локус2p11.2Начало88,122,982 bp[1]
Конец88,128,062 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
6-я хромосома мыши
Хр.6-я хромосома мыши[2]
6-я хромосома мыши
Расположение в геноме FABP1
Расположение в геноме FABP1
Локус6 C1|6 32.14 cMНачало71,176,811 bp[2]
Конец71,182,007 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
Наибольшая экспрессия в
Дополнительные справочные данные
BioGPS
Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

2168

14080

Ensembl

ENSG00000163586

ENSMUSG00000054422

UniProt

P07148

P12710

RefSeq (мРНК)

NM_001443

NM_017399

RefSeq (белок)

NP_001434

NP_059095

Локус (UCSC)Chr 2: 88.12 – 88.13 MbChr 6: 71.18 – 71.18 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

FABP1 (англ. fatty acid binding protein 1) — внутриклеточный белок из семейства белков, связывающий жирные кислоты (FABP). Продукт гена человека FABP1. FABP1 в основном экспрессирован в печени, где белок участвует в связывании, транспорте и метаболизме длинноцепочечных жирных кислот, эндоканнабиноидов и фитоканнабиноидов и других гидрофобных молекул[5][6][7][8]. Нарушенние в экспрессии белка коррелирует с метаболическими заболевания, включая ожирение[9].

Открытие

Белки семейства FABP были открыты в 1972 году в экспериментах с олеиновой кислотой, меченой изотопом 14C, напправленных на идентификацию переносчика растворимых жирных кислот в энтероцитах, которые отвечают за кишечную абсорбцию длинноцепочечных жирных кислот[10]. С тех пор было найдено 10 белков-транспортёров: FABP1-9 и FABP12[7]. Каждый белок семейства FABP соответсквует определённому органу или определённой ткани, где он играет важную роль в захвате, транспорте и метаболизме жирных кислот[10].

Ген

Ген человека FABP1 локализован на коротком плече p 2-и хромосомы от основания 88 122 982 до основания 88 128 131[11].

Структура белка

Структура белка FABP1 уникальна по сравнению с другими белками семейства и позволяет связывать несколько лигандов одновременно[12]. Кроме этого, более крупная внутренняя сердцевина белка позволяет связывать широкий ассортимент лигандов[7]. Предполагается, что жирные кислоты входят в гидрофобную часть белка через подвижный регион, включающий α-спираль II и повороты между петлями βC-βD и βE-βF[13]. После этого жирная кислота связывается с гидрофобным карманом белка для транспортировки[13].

Функции

Переносчик жирных кислот, который преимущественно экспрессирован на адипоцитах и макрофагах. Связывает длинноцепочечные жирные кислоты и ретиноевую кислоту и доставляет их к соответствующим рецепторам в ядре.

Белки семейства FABP — небольшие высококонсервативные цитоплазматические белки, которые вовлечены в перенос длинноцепочечных жирных кислот. FABP1 наиболее представлен в пчени человека, где он составляет 7-11 % от всех белков цитозоля. Белок также экспрессирован в кишечнике, почках, поджелудочной железе, желудке и лёгких[7][14]. FABP1 обладает широким спектром гидрофобных лигандов, включая билирубин, моноглицериды и ацил-CoA[15][16][17][18]. Считается, что белок играет важную роль в предотвращении токсичности, связывая гем, жирные кислоты и другие молекулы. которые являются токсичными в свободном виде[12].

Мутации

У человека была идентифицирована мутация, заменяющая треонин на аланин T94A[19]. У носителей этой мутации высокий базовый уровень жирных кислот плазмы, пониженные индекс массы тела и размер талии[19]. Мутация T94A была ассоциирована с метаболическим синдромом, сердечно-сосудистыми заболеваниями и диабетом 2-го типа[19].

См. также

Примечания

  1. ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000163586 - Ensembl, May 2017
  2. ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000054422 - Ensembl, May 2017
  3. ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ↑ Schroeder F., McIntosh A. L., Martin G. G., Huang H., Landrock D., Chung S., Landrock K. K., Dangott L. J., Li S., Kaczocha M., Murphy E. J., Atshaves B. P., Kier A. B. Fatty Acid Binding Protein-1 (FABP1) and the Human FABP1 T94A Variant: Roles in the Endocannabinoid System and Dyslipidemias (англ.) // Lipids : journal. — 2016. — June (vol. 51, no. 6). — P. 655—676. — doi:10.1007/s11745-016-4155-8. — PMID 27117865. — PMC 5408584.
  6. ↑ Huang H., McIntosh A. L., Martin G. G., Landrock D., Chung S., Landrock K. K., Dangott L. J., Li S., Kier A. B., Schroeder F. FABP1: A Novel Hepatic Endocannabinoid and Cannabinoid Binding Protein (англ.) // Biochemistry : journal. — 2016. — September (vol. 55, no. 37). — P. 5243—5255. — doi:10.1021/acs.biochem.6b00446. — PMID 27552286. — PMC 5322802.
  7. ↑ 1 2 3 4 Smathers R. L., Petersen D. R. The human fatty acid-binding protein family: evolutionary divergences and functions (англ.) // Human Genomics : journal. — 2011. — March (vol. 5, no. 3). — P. 170—191. — doi:10.1186/1479-7364-5-3-170. — PMID 21504868. — PMC 3500171.
  8. ↑ Huang, Huan; McIntosh, Avery L.; Martin, Gregory G.; Landrock, Danilo; Chung, Sarah; Landrock, Kerstin K.; Dangott, Lawrence J.; Li, Shengrong; Kier, Ann B. FABP1: A Novel Hepatic Endocannabinoid and Cannabinoid Binding Protein (англ.) // Biochemistry : journal. — 2016. — 20 September (vol. 55, no. 37). — P. 5243—5255. — ISSN 1520-4995. — doi:10.1021/acs.biochem.6b00446. — PMID 27552286. — PMC 5322802.
  9. ↑ Shi J., Zhang Y., Gu W., Cui B., Xu M., Yan Q., Wang W., Ning G., Hong J. Serum liver fatty acid binding protein levels correlate positively with obesity and insulin resistance in Chinese young adults (англ.) // PLOS One : journal. — Public Library of Science, 2012. — 7 November (vol. 7, no. 11). — P. e48777. — doi:10.1371/journal.pone.0048777. — PMID 23144966. — PMC 3492433.
  10. ↑ 1 2 Ockner R. K. Historic overview of studies on fatty acid-binding proteins (англ.) // Molecular and Cellular Biochemistry[англ.] : journal. — 1990. — Vol. 98, no. 1—2. — P. 3—9. — doi:10.1007/bf00231361. — PMID 2266967.
  11. ↑ FABP 1. Gene Cards. Дата обращения: 16 октября 2016. Архивировано 18 октября 2016 года.
  12. ↑ 1 2 Wang G., Bonkovsky H. L., de Lemos A., Burczynski F. J. Recent insights into the biological functions of liver fatty acid binding protein 1 (англ.) // Journal of Lipid Research[англ.] : journal. — 2015. — December (vol. 56, no. 12). — P. 2238—2247. — doi:10.1194/jlr.R056705. — PMID 26443794. — PMC 4655993.
  13. ↑ 1 2 Sacchettini J. C., Gordon J. I., Banaszak L. J. Crystal structure of rat intestinal fatty-acid-binding protein. Refinement and analysis of the Escherichia coli-derived protein with bound palmitate (англ.) // Journal of Molecular Biology[англ.] : journal. — 1989. — July (vol. 208, no. 2). — P. 327—339. — doi:10.1016/0022-2836(89)90392-6. — PMID 2671390.
  14. ↑ Vergani L., Fanin M., Martinuzzi A., Galassi A., Appi A., Carrozzo R., Rosa M., Angelini C. Liver fatty acid-binding protein in two cases of human lipid storage (англ.) // Molecular and Cellular Biochemistry[англ.] : journal. — 1990. — Vol. 98, no. 1—2. — P. 225—230. — doi:10.1007/bf00231388. — PMID 2266963.
  15. ↑ Levi A. J., Gatmaitan Z., Arias I. M. Two hepatic cytoplasmic protein fractions, Y and Z, and their possible role in the hepatic uptake of bilirubin, sulfobromophthalein, and other anions (англ.) // Journal of Clinical Investigation : journal. — 1969. — November (vol. 48, no. 11). — P. 2156—2167. — doi:10.1172/jci106182. — PMID 4980931. — PMC 297469.
  16. ↑ Storch J. Diversity of fatty acid-binding protein structure and function: studies with fluorescent ligands (англ.) // Molecular and Cellular Biochemistry[англ.] : journal. — 1993. — Vol. 123, no. 1—2. — P. 45—53. — doi:10.1007/BF01076474. — PMID 8232268.
  17. ↑ Thumser A. E., Wilton D. C. The binding of cholesterol and bile salts to recombinant rat liver fatty acid-binding protein (англ.) // Biochemical Journal[англ.] : journal. — 1996. — December (vol. 320, no. 3). — P. 729—733. — doi:10.1042/bj3200729. — PMID 9003356. — PMC 1217991.
  18. ↑ Mishkin S., Turcotte R. The binding of long chain fatty acid CoA to Z, a cytoplasmic protein present in liver and other tissues of the rat (англ.) // Biochemical and Biophysical Research Communications[англ.] : journal. — 1974. — April (vol. 57, no. 3). — P. 918—926. — doi:10.1016/0006-291X(74)90633-0. — PMID 4827841.
  19. ↑ 1 2 3 Brouillette C., Bossé Y., Pérusse L., Gaudet D., Vohl M. C. Effect of liver fatty acid binding protein (FABP) T94A missense mutation on plasma lipoprotein responsiveness to treatment with fenofibrate (англ.) // Journal of Human Genetics[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 49, no. 8. — P. 424—432. — doi:10.1007/s10038-004-0171-2. — PMID 15249972.

Литература

  • Glatz J. F., Börchers T., Spener F., van der Vusse G. J. Fatty acids in cell signalling: modulation by lipid binding proteins (англ.) // Prostaglandins, Leukotrienes, and Essential Fatty Acids : journal. — 1995. — Vol. 52, no. 2—3. — P. 121—127. — doi:10.1016/0952-3278(95)90010-1. — PMID 7784447.
  • Kaikaus R. M., Chan W. K., Ortiz de Montellano P. R., Bass N. M. Mechanisms of regulation of liver fatty acid-binding protein (англ.) // Molecular and Cellular Biochemistry[англ.] : journal. — 1993. — Vol. 123, no. 1—2. — P. 93—100. — doi:10.1007/BF01076479. — PMID 8232272.
  • Londraville R. L. Intracellular fatty acid-binding proteins: putting lower vertebrates in perspective (англ.) // Brazilian Journal of Medical and Biological Research[англ.] : journal. — 1996. — June (vol. 29, no. 6). — P. 707—720. — PMID 9070383.
  • Börchers T., Hohoff C., Buhlmann C., Spener F. Heart-type fatty acid binding protein - involvement in growth inhibition and differentiation (англ.) // Prostaglandins, Leukotrienes, and Essential Fatty Acids : journal. — 1997. — July (vol. 57, no. 1). — P. 77—84. — doi:10.1016/S0952-3278(97)90496-8. — PMID 9250612.
  • Carroll S. L., Roth K. A., Gordon J. I. Liver fatty acid-binding protein: a marker for studying cellular differentiation in gut epithelial neoplasms (англ.) // Gastroenterology : journal. — 1990. — December (vol. 99, no. 6). — P. 1727—1735. — PMID 1699834.
  • Sweetser D. A., Birkenmeier E. H., Klisak I. J., Zollman S., Sparkes R. S., Mohandas T., Lusis A. J., Gordon J. I. The human and rodent intestinal fatty acid binding protein genes. A comparative analysis of their structure, expression, and linkage relationships (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1987. — November (vol. 262, no. 33). — P. 16060—16071. — PMID 2824476.
  • Chan L., Wei C. F., Li W. H., Yang C. Y., Ratner P., Pownall H., Gotto A. M., Smith L. C. Human liver fatty acid binding protein cDNA and amino acid sequence. Functional and evolutionary implications (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1985. — March (vol. 260, no. 5). — P. 2629—2632. — PMID 3838309.
  • Lowe J. B., Boguski M. S., Sweetser D. A., Elshourbagy N. A., Taylor J. M., Gordon J. I. Human liver fatty acid binding protein. Isolation of a full length cDNA and comparative sequence analyses of orthologous and paralogous proteins (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1985. — March (vol. 260, no. 6). — P. 3413—3417. — PMID 3838313.
  • Murphy E. J. L-FABP and I-FABP expression increase NBD-stearate uptake and cytoplasmic diffusion in L cells (англ.) // American Physiological Society[англ.] : journal. — 1998. — August (vol. 275, no. 2 Pt 1). — P. G244-9. — PMID 9688651.
  • Wolfrum C., Börchers T., Sacchettini J. C., Spener F. Binding of fatty acids and peroxisome proliferators to orthologous fatty acid binding proteins from human, murine, and bovine liver (англ.) // Biochemistry : journal. — 2000. — February (vol. 39, no. 6). — P. 1469—1474. — doi:10.1021/bi991638u. — PMID 10684629.
  • Wolfrum C., Borrmann C. M., Borchers T., Spener F. Fatty acids and hypolipidemic drugs regulate peroxisome proliferator-activated receptors alpha - and gamma-mediated gene expression via liver fatty acid binding protein: a signaling path to the nucleus (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2001. — February (vol. 98, no. 5). — P. 2323—2328. — doi:10.1073/pnas.051619898. — PMID 11226238. — PMC 30137.
  • Schroeder F., Atshaves B. P., Starodub O., Boedeker A. L., Smith R. R., Roths J. B., Foxworth W. B., Kier A. B. Expression of liver fatty acid binding protein alters growth and differentiation of embryonic stem cells (англ.) // Molecular and Cellular Biochemistry[англ.] : journal. — 2001. — March (vol. 219, no. 1—2). — P. 127—138. — doi:10.1023/A:1010851130136. — PMID 11354243.
  • Zimmerman A. W., van Moerkerk H. T., Veerkamp J. H. Ligand specificity and conformational stability of human fatty acid-binding proteins (англ.) // The International Journal of Biochemistry & Cell Biology[англ.] : journal. — 2001. — September (vol. 33, no. 9). — P. 865—876. — doi:10.1016/S1357-2725(01)00070-X. — PMID 11461829.
  • Mésange F., Sebbar M., Capdevielle J., Guillemot J. C., Ferrara P., Bayard F., Poirot M., Faye J. C. Identification of two tamoxifen target proteins by photolabeling with 4-(2-morpholinoethoxy)benzophenone (англ.) // Bioconjugate Chemistry[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 13, no. 4. — P. 766—772. — doi:10.1021/bc015588t. — PMID 12121132.