SSI — несложный язык для динамической «сборки» веб-страниц на сервере из отдельных составных частей и выдачи клиенту полученного HTML-документа. Реализован в веб-сервере Apache при помощи модуля mod_include. Включённая в настройках по умолчанию веб-сервера возможность позволяет подключать HTML-файлы, поэтому для использования инструкций файл должен оканчиваться расширением .shtml
, .stm
или .shtm
Юнико́д — стандарт кодирования символов, включающий в себя знаки почти всех письменных языков мира. В настоящее время стандарт является преобладающим в Интернете.
UTF-8 — распространённый стандарт кодирования символов, позволяющий более компактно хранить и передавать символы Юникода, используя переменное количество байт, и обеспечивающий полную обратную совместимость с 7-битной кодировкой ASCII. Стандарт UTF-8 официально закреплён в документах RFC 3629 и ISO/IEC 10646 Annex D.
Формат файла, формат данных — спецификация структуры данных, записанных в компьютерном файле. Идентификатор формата файла, как правило, указывается в конце имени файла в виде «расширения». Расширение имени файла помогает идентифицировать формат данных, содержащихся в файле, программам, которые могут с ним работать. Иногда формат данных дополнительно указывается в начале содержимого файла.
Uniform Resource Locator, сокр. URL — адрес ресурса в сети Интернет. Стандарт URL регулируется организацией IETF. URL как формат адреса ресурса был изобретён Тимом Бернерсом-Ли в 1990 году в стенах Европейского совета по ядерным исследованиям, и стал фактической основой для создания Всемирной паутины. Сейчас URL позиционируется как часть более широкой системы адресации URI и регулируется документом, определяющим URI.
URI — унифицированный (единообразный) идентификатор ресурса. URI — последовательность символов, идентифицирующая абстрактный или физический ресурс. Ранее назывался Universal Resource Identifier — универсальный идентификатор ресурса.
IRI — интернационализированный идентификатор ресурса. По‐английски «IRI» произносится, по‐русски иногда произносят [и́ри]. IRI — это короткая последовательность символов, идентифицирующая абстрактный или физический ресурс на любом языке мира. Идентификаторы IRI призваны в будущем заменить URI.
Те́кстовый файл — компьютерный файл, содержащий текстовые данные. Текстовым файлам противопоставляются двоичные (бинарные) файлы, в которых содержатся данные, не рассчитанные на интерпретацию в качестве текстовых.
Арифметическое кодирование — один из алгоритмов энтропийного сжатия.
Base64 — стандарт кодирования двоичных данных при помощи только 64 символов ASCII. Алфавит кодирования содержит латинские символы A-Z, a-z, цифры 0-9 и 2 дополнительных символа, зависящих от системы реализации. Каждые 3 исходных байта кодируются четырьмя символами.
Rich Text Format, RTF — проприетарный межплатформенный формат хранения текстовых документов с форматированием, предложенный группами программистов, основавшими компании Microsoft и Adobe, как мета-теговый формат для редактора Word в 1982 году. С тех пор спецификация формата несколько раз изменялась. После разрыва отношений с Microsoft компания Adobe продолжила самостоятельное развитие метатэгового языка, заложенного в основу RTF, создав в 1985 году язык PostScript.
Truevision TGA (TGA) — растровый графический формат. Первоначально был создан компанией Truevision Inc. для графических адаптеров собственного производства ещё в 1984, но в дальнейшем стал популярен на самых разных платформах, особенно в области обработки видео, анимации.
Те́кстовые да́нные — представление информации строкового типа в вычислительной системе. В MIME закодированным таким образом данным соответствует тип text/plain
.
Code 39 — штрихкодовое обозначение, которым можно закодировать большие латинские буквы, цифры и некоторые специальные символы.
Стандарт штрихкода Code 128 существенно отличается от таких широко распространённых стандартов штрихового кода, как например, EAN. Отличия заключаются, прежде всего, в возможности кодирования не только цифр, но и букв латинского алфавита, а также специальных символов. Кроме того, цифровой код в формате Code 128 становится очень компактным, что достигается за счёт «двойной упаковки» данных, когда два числа записываются в один модуль штрихкода. Буквенные символы кодируются обычным — «одиночным» способом, что делает буквенный код в формате Code 128 вдвое длиннее цифрового.
FASTA — текстовый формат для нуклеотидных или полипептидных последовательностей, в котором нуклеотиды или аминокислоты обозначаются при помощи однобуквенных кодов. Из-за своей простоты и практичности в настоящее время используется большинством программ работы с биологическими последовательностями. Файлы данного формата могут содержать названия последовательностей, их идентификаторы в базах данных и комментарии. В зависимости от природы содержащихся в нем биологических последовательностей файл формата FASTA может иметь различные расширения.
UGENE — свободное биоинформационное программное обеспечение.
BWA — программный пакет для картирования коротких прочтений на большие референсные геномы, написанный китайским биоинформатиком Хенг Ли и англичанином Ричардом Дурбиным. Является одним из широкоиспользуемых алгоритмов выравнивания, а также рекомендуется для анализа данных производителями Illumina. BWA состоит из трёх основных алгоритмов: BWA-BackTrack, BWA-SW и BWA-MEM. В основе алгоритмов BWA лежит преобразование Барроуза—Уилера, суффиксные массивы и алгоритм выравнивания Смита—Ватермана. Программный пакет умеет работать с длинными последовательностями на порядок быстрее, чем MAQ при достижении аналогичной точности выравнивания.
yEnc — популярная схема кодирования двоичных файлов в текстовые, применяемая преимущественно пользователями Usenet. Также используется при отправке больших двоичных файлов по электронной почте. По сравнению с другими схемами кодирования двоичных данных в текстовые, более эффективна за счёт того, что использует не только символы из 7-битной таблицы ASCII, но и часть символов из расширенной таблицы ASCII. За счёт этого размер файлов, закодированных при помощи yEnc, превышает размер исходных всего на 1-2 %. Это — существенное преимущество по сравнению с 33 %-40 % дополнительного объёма для шестибитных методов кодирования, таких как uuencode и Base64. Первая версия yEnc была выпущена Jürgen Helbing в начале 2001. К 2003 yEnc получил широкое распространение, став стал стандартом де-факто для кодирования двоичных файлов в Usenet'е. Название yEncode — игра слов от «Why encode?» , — шутка, возникшая в связи с тем, что основной идеей yEnc было то, что кодировать нужно только те символы двоичного файла, для которых это безоговорочно требовалось, чтобы поместить их в текст письма, соответствующий техническим стандартам RFC.