Ассе́мблер — транслятор программы из текста на языке ассемблера в программу на машинном языке.
Gentoo Linux — дистрибутив GNU/Linux с мощной и гибкой технологией Portage, совмещающей в себе возможности конфигурирования и настройки, а также автоматизированную систему управления пакетами. Последняя создавалась под влиянием системы управления пакетами FreeBSD. Отличительной особенностью Gentoo является возможность оптимизации под конкретное аппаратное обеспечение.
Метод молекулярной динамики — метод, в котором временная эволюция системы взаимодействующих атомов или частиц отслеживается интегрированием их уравнений движения
Windows NT — линейка операционных систем (ОС) производства корпорации Microsoft и название первых версий ОС.
Кроссплатформенность (межплатформенность) — способность программного обеспечения работать с несколькими аппаратными платформами или операционными системами. Обеспечивается благодаря использованию высокоуровневых языков программирования, сред разработки и выполнения, поддерживающих условную компиляцию, компоновку и выполнение кода для различных платформ. Типичным примером является программное обеспечение, предназначенное для работы в операционных системах Linux и Windows одновременно.
OpenSolaris — операционная система с открытым исходным кодом, созданная корпорацией Sun Microsystems на базе Solaris. Также термин OpenSolaris может использоваться по отношению к открытой кодовой базе Solaris и сообществу, которое её разрабатывает.
Порти́рование — в программировании — адаптация некоторой программы или её части так, чтобы она работала в другой среде, отличающейся от той среды, под которую она была изначально написана, с максимальным сохранением её пользовательских свойств. В этом основное отличие понятий порт и форк — в первом случае все пользовательские свойства пакета стараются сохранить, а во втором — это базирующаяся на общей основе самостоятельная разработка с новыми полезными свойствами.
Ab initio — обоснование какого-либо явления из естественных законов природы без привлечения дополнительных эмпирических предположений или специальных моделей.
LZMA — алгоритм сжатия данных, разрабатываемый с 1996 или 1998 года Игорем Павловым. Используется в архиваторе 7-Zip того же автора для создания сжатых архивов в формате 7z.
Arch Linux — независимый дистрибутив GNU/Linux для опытных пользователей, оптимизированный для архитектуры x86-64, который стремится предоставить последние «новейшие» версии программ, следуя модели rolling release. По умолчанию пользователю предоставляется минималистичная базовая система, в которую пользователь может добавить то, что ему требуется. Для установки, удаления и обновления пакетов используется пакетный менеджер Pacman.
Firefly (фа́йрфлай) в переводе с английского языка означает «светляк, светлячок». Используется в следующих значениях:
- Firefly — бюджетная авиакомпания Малайзии.
- Firefly — программа для квантовохимических расчётов, ранее называвшаяся PC GAMESS.
- «Firefly» — песня Христины Метаксы, представлявшая Кипр на конкурсе «Евровидение-2009».
- Firefly Studios — английская компания, разработчик компьютерных игр.
- «Firefly» — десятый студийный альбом группы Uriah Heep.
- Firefly — палубный истребитель фирмы Fairey.
- Firefly — британские танки «Шерман» модификаций М4А1 и М4А4, перевооружённые «17-фунтовой» (76,2-миллиметровой) противотанковой пушкой.
- Firefly — научно-фантастический сериал в жанре космического вестерна, выходивший в 2002 и 2003 годах.
Open Watcom — проект сообщества открытого кода по поддержке и развитию многоплатформных компиляторов Watcom C, C++ и Fortran и сопутствующих программ. Лицензия открытого ПО от Sybase позволяет лишь некоммерческое использование пакета Open Watcom частными лицами.
Коллекция портов FreeBSD, как и бинарные пакеты — технология установки программного обеспечения сторонних разработчиков в операционной системе FreeBSD. Порт FreeBSD для любого конкретно взятого приложения является набором файлов, предназначенных для автоматизации процесса компиляции приложения из исходного кода. В настоящее время коллекция портов насчитывает более 32 тыс. приложений самого разного назначения.
Вычисли́тельная хи́мия — раздел химии, в котором математические методы используются для расчёта молекулярных свойств, моделирования поведения молекул, планирования синтеза, поиска в базах данных и обработки комбинаторных библиотек. Вычислительная химия использует результаты классической и квантовой теоретической химии, реализованные в виде эффективных компьютерных программ, для вычисления свойств и определения структуры молекулярных систем. В квантовой химии компьютерное моделирование заменило не только традиционные аналитические методы расчета, но во многих случаях и сложный эксперимент. Вычислительная химия позволяет в некоторых случаях предсказать ранее ненаблюдаемые химические явления.
PearPC — эмулятор платформы PowerPC, способный к выполнению многих операционных систем PowerPC, включая Mac OS X, Darwin и Linux. Выпущен под лицензией GPL. Может выполняться на Microsoft Windows, Linux, FreeBSD и других системах, поддерживающих POSIX и X11.
Gaussian — программный пакет для расчета структуры и свойств молекулярных систем в газофазном и конденсированном состоянии, включающая большое разнообразие методов вычислительной химии, квантовой химии, молекулярного моделирования. Создана нобелевским лауреатом Джоном Поплом и его исследовательской группой и с тех пор постоянно обновляется. Программные пакеты серии «Gaussian» считаются специалистами одними из самых мощных в плане предоставляемых возможностей и распространенных в повседневном использовании.
GAMESS (US) — программа пакета вычислительной квантовой химии. Аббревиатура расшифровывается как General Atomic and Molecular Electronic Structure System. В 1981 году появилось две стабильных ветви GAMESS: GAMESS (US) и GAMESS (UK), с тех пор их развитие шло самостоятельно и на сегодняшний день эти две программы отличаются довольно существенно. Проект GAMESS поддерживается членами исследовательской группы Гордона в Государственном Университете штата Айова.
GROMACS пакет программ для моделирования физико-химических процессов в молекулярной динамике. Разработан командой Германа Берендсена, работающей в отделении биофизической химии университета Гронингена. В настоящее время развивается и поддерживается усилиями энтузиастов, в число которых входят представители университета Уппсалы и королевского технологического института. Пакет предназначен для моделирования биомолекул, имеющих много связанных взаимодействий между атомами. Обеспечивает высокую скорость расчётов для несвязанных взаимодействий. Считается одним из самых быстрых инструментов. Является свободным программным обеспечением с открытым исходным кодом. Исходный код доступен под лицензией GPL.
INRIA — национальный исследовательский институт во Франции, работающий в области компьютерных наук, теории управления и прикладной математики.
Александр Александрович Грановский — российсский квантовый химик, автор программного пакета для ab initio квантовохимических расчётов Firefly, ранее известного как PC GAMESS.