Факторы транскрипции — белки́, контролирующие процесс синтеза мРНК, а также других видов РНК на матрице ДНК (транскрипцию) путём связывания со специфичными участками ДНК. Транскрипционные факторы выполняют свою функцию либо самостоятельно, либо в комплексе с другими белками. Они обеспечивают снижение (репрессоры) или повышение (активаторы) константы связывания РНК-полимеразы с регуляторными последовательностями регулируемого гена.
NANOG — транскрипционный фактор, участвующий в самообновлении недифференцированных эмбриональных стволовых клеток.
Oct-4 — это транскрипционный фактор, содержащий гомеобокс, из семейства POU. Данный белок участвует в самообновлении недифференцированных эмбриональных стволовых клеток. Широко используется как маркёр для недифференцированных клеток. Экспрессия Oct-4 очень тонко регулируется, так как повышение или понижение может приводить к дифференцировке клеток.
Резухови́дка Та́ля, или Резу́шка Та́ля — небольшое цветковое растение, вид рода Резуховидка (Arabidopsis) семейства Капустные (Brassicaceae). Его исходный ареал включает Европу, Азию и север Африки, а в наше время резуховидка Таля распространилась по всем континентам, кроме Антарктиды.
TNFRSF17 — мембранный белок, рецептор из надсемейства рецепторов фактора некроза опухоли. Продукт гена человека TNFRSF17. Играет роль в регуляции B-лимфоцитов.
TNFRSF12A, или Tweak-рецептор — мембранный белок, рецептор из надсемейства рецепторов факторов некроза опухоли. Продукт гена человека TNFRSF12A.
TNFRSF13C, или рецептор фактора, активирующего B-лимфоциты — мембранный белок, рецептор из надсемейства рецепторов факторов некроза опухоли, играет важную роль в регуляции иммунного ответа. Продукт гена человека TNFRSF13C.
TNFRSF10D — мембранный белок, рецептор из надсемейства рецепторов факторов некроза опухоли. Продукт гена человека TNFRSF10D.
TNFRSF10B — мембранный белок, рецептор из надсемейства рецепторов факторов некроза опухоли. Продукт гена человека TNFRSF10B.
TNFRSF10A — мембранный белок, рецептор из надсемейства рецепторов факторов некроза опухоли. Участвует в активации апоптоза. Продукт гена человека TNFRSF10A.
TNFRSF10C — мембранный белок, рецептор из надсемейства рецепторов факторов некроза опухоли. Продукт гена человека TNFRSF10C.
Транс-активи́рующие ма́лые интерфери́рующие РНК, tasiРНК, TAS РНК — группа малых некодирующих РНК наземных растений, подавляющие экспрессию генов путём пост-трансляционного сайленсинга. TasiРНК транскрибируются в геноме в форме двуцепочечных полиаденилированных РНК, которые в дальнейшем процессируются и превращаются во фрагменты РНК длиной 21 нуклеотид. Эти фрагменты включаются в РНК-индуцируемый комплекс выключения гена (RISC). tasiРНК часто относят к малым интерферирующим РНК (siРНК) ввиду того, что обе этих группы малых РНК транскрибируются в форме двуцепочечных РНК и подвергаются схожему процессингу. Впрочем, tasiРНК отличаются от других siРНК тем, что они связывают свои последовательности-мишени с меньшей специфичностью. В этом их механизм более схож с механизмом действия микроРНК, так как они не нуждаются в полной комплементарности последовательностей со своей мишенью, чтобы направлять её распад.
Регуляторный фактор интерферона 5 — белок, который у человека кодируется геном IRF5.
Е-бокс — ДНК-последовательность, найденная в некоторых промоторных областях у эукариот, которые действует в качестве связывающего сайта белка и, как было установлено, регулируют экспрессию генов в нейронах, мышцах и других тканях. Спецификация такой ДНК-последовательности — CANNTG, с палиндромной канонической последовательностью. CACGTG распознаётся и связывается факторами транскрипции для инициации транскрипции генов. После того, как факторы транскрипции связываются с промоторами через E-бокс, другие ферменты могут связываться с промотором и облегчать транскрипцию мРНК из ДНК.
MADS-box (MADS-бокс) — консервативная последовательность нуклеотидов, кодирующая MADS-домен, при помощи которого белки связываются с ДНК. MADS-домен белков связывается с ДНК, в которой есть последовательность CC[A/T]6GG, коротко обозначаемая как CArG-box. Большинство белков, содержащих этот домен, являются транскрипционными факторами и влияют на экспрессию генов. Разные исследователи приводят разные данные относительно длины MADS-box, но обычно она составляет около 168—180 пар оснований, то есть закодированный в ней MADS-домен состоит из 56—60 аминокислот. Существуют данные, согласно которым MADS-домен эволюционировал из последовательности белка топоизомераза второго типа, который, как полагают, был у общего предка всех ныне живущих эукариот.
AGAMOUS (AG) — ген, кодирующий MADS-бокс содержащий транскрипционный фактор растения Arabidopsis thaliana. Номер гена в базе данных The Arabidopsis Information Resource — AT4G18960. В дословном переводе с английского agamous означает «бесполый». При мутации по этому гену, происходит нарушения развития цветка, когда на месте тычинок развиваются лепестки, а на месте плодолистиков — чашелистики.
Развитие цветка — это процесс, посредством которого цветковые растения запускают каскад экспрессии генов в меристеме, который приводит к образованию органа полового размножения — цветка. Чтобы это произошло, растение должно пройти три стадии развития и сопутствующие им физиологические изменения: во-первых, оно должно достичь половой зрелости и стать половозрелой особью ; во-вторых, должно произойти преобразование апикальной меристемы из вегетативной во флоральную меристему ; и, наконец, рост и развитие индивидуальных органов цветка. Для объяснения механизма последней стадии была придумана модель ABC, которая пытается описать биологическую основу процесса с точки зрения молекулярной генетики и биологии развития.
Superman — ген растения резуховидка Таля, обеспечивает связь развития тычинок и плодолистиков. Ген назван в честь героя комиксов — Супермена, поэтому связанные гены kryptonite (ген) и clark kent были названы соответственно. Он кодирует транскрипционный фактор. При мутации по этому гену у резуховидки происходит снижение количества плодолистиков в цветке и увеличение числа тычинок. Гомологичные гены известны у петунии и львиного зева, где они тоже участвуют в развитии цветка, хотя в обоих случаях есть существенные отличия в их функциях от функции superman в Arabidopsis. Superman начинает экспрессироваться уже на ранних этапах развития цветка, продукт гена обнаруживается в мутовке тычинок, смежной с мутовкой плодолистиков. Ген взаимодействует с гомеозисными генами из модели ABC и даёт множество необычных фенотипов.
Флориген, или гормон цветения — гипотетическая гормоноподобная молекула, ответственная за контроль или инициирование цветения растений. Флориген образуется в листьях и действует в меристемах почек и растущих побегов. Известно, что он передаётся прививанием и даже функционирует между видами. Однако, несмотря на поиски с 1930-х годов, точная природа флоригена до сих пор не выяснена.
Белки позднего эмбриогенеза (LEA-белки, от англ. Late Embryogenesis Abundant) группа животных и растительных белков, защищающих другие клеточные белки от агрегации при дегидратации или осмотическом стрессе, связанном с низкими температурами.
