
Gentoo Linux — дистрибутив GNU/Linux с мощной и гибкой технологией Portage, совмещающей в себе возможности конфигурирования и настройки, а также автоматизированную систему управления пакетами. Последняя создавалась под влиянием системы управления пакетами FreeBSD. Отличительной особенностью Gentoo является возможность оптимизации под конкретное аппаратное обеспечение.

FAR Manager — консольный файловый менеджер для операционных систем семейства Microsoft Windows и Linux.

AROS — проект по созданию независимой, одноимённой, переносимой и свободной операционной системы (ОС), совместимой на уровне исходного кода с AmigaOS 3.1 на уровне API, при этом превосходя её во многих областях. Исполняемые файлы для одной платформы совместимы для различных версий AROS, для переноса их на другую платформу потребуется перекомпиляция.

Subversion — свободная централизованная система управления версиями, официально выпущенная в 2004 году компанией CollabNet. С 2010 года Subversion является одним из проектов Apache Software Foundation и официально называется Apache Subversion.

Total Commander — файловый менеджер с закрытым исходным кодом, работающий на платформах Microsoft Windows и Android.

Thunar — файловый менеджер для рабочей среды Xfce, с версии Xfce 4.4 заменивший ранее использовавшийся Xffm. Интерфейс Thunar очень похож на интерфейс Nautilus — стандартного файлового менеджера среды GNOME. Ранее Thunar имел название Filer, но он был переименован в «Thunar» из-за конфликтов названия. Thunar разрабатывается с расчётом на высокую производительность и удобство в использовании, а также на поддержку стандартов, заявленных на freedesktop.org. Функциональность Thunar может быть расширена за счёт развитой системы плагинов.
ZFS — файловая система с деревом Меркла и поддержкой копирования при записи с функциями менеджера томов, созданная Sun Microsystems в 2004—2005 годах для операционной системы Solaris. Поддерживает большие объёмы данных, позволяет создавать RAID-массивы. Существуют открытые реализации ZFS, в частности, OpenZFS лицензируется под CDDL. По состоянию на 2024 год OpenZFS активно развивается.

Directory Opus — коммерческий файловый менеджер. Directory Opus был впервые выпущен в 1990 году как простой двухпанельный файловый менеджер для компьютеров Commodore AMIGA. Разработчиком программы является компания GPSoftware. Последняя версия Directory Opus совместима со всеми версиями Windows — Windows ХР, Windows 7 и Windows 8 в 32 и 64-битных версиях. Последняя версия стоит около $49 долларов США за минимальную версию, и $89 за полную.

Dolphin — файловый менеджер и часть проекта KDE SC. Используется как файловый менеджер по умолчанию в среде KDE, начиная с версии 4.0, вышедшей 11 января 2008 года. Простота и практичность использования являются основными целями разработчиков, благодаря чему Dolphin полностью соответствует HIG.

Unreal Commander — бесплатный двухпанельный файловый менеджер с закрытым исходным кодом, работающий под управлением Microsoft Windows.

GoboLinux — это свободная операционная система семейства Linux, выделяющаяся отходом от принятых в этом семействе стандартов в пользу упрощения управления и использования системы. Ключевые решения — это изменённая иерархия файлов, способ загрузки системы и управление пакетами, отчасти схожее с решениями Gentoo.

PhotoRec — свободная программа для восстановления данных, предназначенная для восстановления потерянных файлов в памяти цифровой камеры, на жестких дисках и компакт-дисках. Она восстанавливает большинство основных форматов изображений, включая JPEG, а также аудиофайлы, включая MP3, документы таких форматов как Microsoft Office, PDF, и HTML, и форматы архивов, включая ZIP.

FreeArc — это свободный файловый архиватор с высокой степенью сжатия данных, разработанный Булатом Зиганшиным для 32-разрядных операционных систем Microsoft Windows и Linux. По состоянию на 2017 год, Булат Зиганшин вновь возобновил работу над архиватором под новым названием FreeArc 'Next, архиватор переписан с нуля, добавлена поддержка 64-разрядных версий и алгоритм сжатия Zstandard.

RISC OS — операционная система, разработанная компанией Acorn Computers для серии своих настольных компьютеров, использующих центральный процессор архитектуры ARM. Впервые RISC OS была выпущена в 1988 году как RISC OS 2.00 и являлась усовершенствованной версией операционной системы Arthur также от Acorn, с добавлением многозадачности. Название операционной системы происходит от RISC—архитектуры микропроцессоров, на которых она применялась.

Tracker — файловый менеджер в операционных системах BeOS, Zeta и Haiku. Трекерами именуется класс программ в BeOS, предназначенных для управления файлами. Традиционно они состоят из двух модулей — Deskbar и Tracker. Уникальность данного файл-менеджера в том, что благодаря файловой системе BeOS, он может брать часть функций медиа-органайзера, почтовой программы, мессенджера, просмотрщика картинок и так далее.

FreeCommander XE — двухпанельный файловый менеджер для Microsoft Windows, с поддержкой просмотра архивов, сравнением и синхронизацией каталогов, встроенным FTP-клиентом и инструментом группового переименования файлов.

Net Transport — это условно-бесплатный менеджер закачек для Microsoft Windows с закрытым исходным кодом, разработанный «Xi Software». Как и все другие программы подобного рода Net Transport предназначен для загрузки файлов из Интернета или локальной сети.

FileCommander — это бесплатный двухпанельный файловый менеджер с закрытым исходным кодом. Утилита не требует установки и работает под управлением операционной системы Microsoft Windows.

TEA Text Editor — текстовый редактор. Отличается большим количеством функций и несколько необычным интерфейсом. В частности выполняет многие функции файлового менеджера и программы для просмотра изображений.

IBM HandShaker — файловый менеджер для операционной системы DOS, разработанный в 1991 году. Имел русский и английский пользовательский интерфейс, встроенный скринсейвер, использовался как замена DOS Shell профессиональными программистами, ввиду многочисленных дополнительных возможностей программы.