Hoechst (краситель)
Красители Hoechst являются частью семейства синих флуоресцентных красителей, используемых для окрашивания ДНК[1][2]. Эти бис-бензимиды были первоначально разработаны компанией Hoechst AG, которая пронумеровала все свои соединения так, что краситель Hoechst 33342 является 33342-м соединением, произведенным компанией. Есть три родственных красителя Hoechst: Hoechst 33258, Hoechst 33342 и Hoechst 34580. Красители Hoechst 33258 и Hoechst 33342 являются наиболее часто используемыми и имеют схожие спектры возбуждения-испускания.
Молекулярные характеристики
Оба красителя возбуждаются ультрафиолетовым светом при длине волны около 350 нм, и оба излучают сине-голубой флуоресцентный свет вокруг максимума спектра излучения при 461 нм. Несвязанный краситель имеет максимальную эмиссию флуоресценции в диапазоне 510—540 нм. Краски Hoechst можно возбудить ксеноновой или ртутной дуговой лампой или ультрафиолетовым лазером. Существует значительный стоксов сдвиг между спектрами возбуждения и испускания, что делает красители Hoechst полезными в экспериментах, в которых используются несколько флуорофоров. Интенсивность флуоресценции красителей Hoechst также увеличивается с pH растворителя[3].
Красители Hoechst растворимы в воде и в органических растворителях, таких как диметилформамид или диметилсульфоксид . Концентрации могут быть достигнуты до 10 мг/мл. Водные растворы стабильны при 2-6 °C не менее шести месяцев в защищенном от света месте. Для длительного хранения растворы вместо этого замораживают при −20 °С или ниже[3].
Красители связываются с малой бороздкой двухцепочечной ДНК с предпочтением последовательностей, богатых аденином и тимином . Хотя красители могут связываться со всеми нуклеиновыми кислотами, двухцепочечные ДНК, богатые AT, значительно усиливают флуоресценцию[4]. Красители Hoechst проникают в клетки и могут связываться с ДНК в живых или фиксированных клетках . Таким образом, эти пятна часто называют суправитальными, что означает, что живые клетки выживают при обработке этими соединениями. Клетки, экспрессирующие специфические АТФ-связывающие кассетные белки-транспортеры, также могут активно транспортировать эти пятна из своей цитоплазмы.
Приложения
Концентрация 0,1-12 мкг/мл обычно используется для окрашивания ДНК в клетках бактерий или эукариот. Клетки окрашивают в течение 1-30 мин при комнатной температуре или 37 °C, а затем промывают для удаления несвязавшегося красителя. Зелёная флуоресценция несвязанного красителя Hoechst может наблюдаться на образцах, окрашенных слишком большим количеством красителя или частично промытых[3] Красители Hoechst часто используются в качестве заменителей другого красителя нуклеиновой кислоты, называемого DAPI.
Основные различия между красителями Hoechst и DAPI:
- Красители Hoechst менее токсичны, чем DAPI, что обеспечивает более высокую жизнеспособность окрашенных клеток[5].
- Дополнительная этильная группа в некоторых красителях Hoechst (Hoechst 33342) делает их более проницаемыми для клеток[6].
- Существуют красители для окрашивания ядер, которые обеспечивают жизнеспособность клеток после окрашивания.
Hoechst 33342 и 33258 гасятся бромдезоксиуридином (BrdU), который обычно используется для обнаружения делящихся клеток. Hoechst 33342 обладает в 10 раз большей проницаемостью для клеток, чем H 33258. Клетки могут интегрировать BrdU во вновь синтезированную ДНК в качестве замены тимидина. Когда BrdU интегрируется в ДНК, предполагается, что бром деформирует малую бороздку, так что красители Hoechst не могут достичь своего оптимального сайта связывания. Связывание красителей Hoechst ещё сильнее с BrdU-замещенной ДНК; однако никакой флуоресценции не происходит. Красители Hoechst можно использовать с BrdU для мониторинга прогрессирования клеточного цикла[7][8].
Красители Hoechst обычно используются для окрашивания геномной ДНК в следующих случаях:
- Флуоресцентная микроскопия и иммуногистохимия, часто с другими флуорофорами[9]
- Проточная цитометрия для подсчета или сортировки клеток. Примером может служить использование красителей Hoechst для анализа того, сколько клеток популяции находится в какой фазе клеточного цикла[10].
- Обнаружение ДНК в присутствии РНК в агарозных гелях[11]
- Автоматическое определение ДНК[12]
- Хромосомная сортировка[11]
Выделение Hoechst также используется для изучения гемопоэтических и эмбриональных стволовых клеток. Поскольку эти клетки способны эффективно выделять краситель, их можно обнаружить с помощью проточной цитометрии в так называемой боковой популяции. Это делается путем пропускания флуоресценции, испускаемой возбужденным Hoechst, через красный и синий фильтры и нанесения красного и синего Hoechst друг на друга.
Токсичность и безопасность
Поскольку красители Hoechst связываются с ДНК, они мешают репликации ДНК во время клеточного деления. Следовательно, они являются потенциально мутагенными и канцерогенными, поэтому при обращении с ними и их утилизации следует соблюдать осторожность. Окрашивание красителями Hoechst используется для сортировки спермы у домашнего скота и людей. Его безопасность обсуждалась[13][14].
См. также
Примечания
- ↑ Latt, SA (July 1975). "Recent developments in the detection of deoxyribonucleic acid synthesis by 33258 Hoechst fluorescence". Journal of Histochemistry and Cytochemistry. 23 (7): 493—505. doi:10.1177/23.7.1095650. PMID 1095650.
- ↑ Latt, SA (January 1976). "Spectral studies on 33258 Hoechst and related bisbenzimidazole dyes useful for fluorescent detection of deoxyribonucleic acid synthesis". Journal of Histochemistry and Cytochemistry. 24 (1): 24—33. doi:10.1177/24.1.943439. PMID 943439.
- ↑ 1 2 3 Hoechst Stains . Invitrogren (Molecular Probes). Архивировано из оригинала 19 апреля 2009 года.
- ↑ Portugal, J (Feb 28, 1988). "Assignment of DNA binding sites for 4′,6-diamidine-2-phenylindole and bisbenzimide (Hoechst 33258). A comparative footprinting study". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Gene Structure and Expression. 949 (2): 158—68. doi:10.1016/0167-4781(88)90079-6. PMID 2449244.
- ↑ BD Bioscience. Techniques for Immune Function Analysis. — 2. — Becton, Dickinson and Company, 2009. Архивная копия от 22 марта 2012 на Wayback Machine
- ↑ Bucevičius, Jonas (2018-04-18). "The Use of Hoechst Dyes for DNA Staining and beyond". Chemosensors (англ.). 6 (2): 18. doi:10.3390/chemosensors6020018. ISSN 2227-9040. Архивировано 22 сентября 2022. Дата обращения: 16 сентября 2022.
{{cite journal}}
: Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка) - ↑ Kubbies, M (January 1983). "Flow cytometric analysis of factors which influence the BrdUrd-Hoechst quenching effect in cultivated human fibroblasts and lymphocytes". Cytometry. 3 (4): 276—81. doi:10.1002/cyto.990030408. PMID 6185287.
- ↑ Breusegem, SY (Feb 1, 2002). "Base-sequence specificity of Hoechst 33258 and DAPI binding to five (A/T)4 DNA sites with kinetic evidence for more than one high-affinity Hoechst 33258-AATT complex". Journal of Molecular Biology. 315 (5): 1049—61. doi:10.1006/jmbi.2001.5301. PMID 11827475.
- ↑ Molecular Probes Handbook: A Guide to Fluorescent Probes and Labeling Technologies. — Invitrogen, 2010-07-21. — ISBN 978-0-9829279-1-5.
- ↑ Kubbies, M (1990). "Flow cytometric recognition of clastogen induced chromatin damage in G0/G1 lymphocytes by non-stoichiometric Hoechst fluorochrome binding". Cytometry. 11 (3): 386—94. doi:10.1002/cyto.990110309. PMID 1692786.
- ↑ 1 2 Mocharla, R (Dec 23, 1987). "A novel, sensitive fluorometric staining technique for the detection of DNA in RNA preparations". Nucleic Acids Research. 15 (24): 10589. doi:10.1093/nar/15.24.10589. PMID 2447564.
- ↑ Sterzel, W (June 1985). "Automated determination of DNA using the fluorochrome Hoechst 33258". Analytical Biochemistry. 147 (2): 462—7. doi:10.1016/0003-2697(85)90299-4. PMID 2409841.
- ↑ Ashwood-Smith, M.J. (1994). "Safety of human sperm selection by flow cytometry". Human Reproduction. 9 (5). Oxford University Press: 757—759. doi:10.1093/oxfordjournals.humrep.a138589. PMID 7929716.
- ↑ Parrilla, I (2004). "Hoechst 33342 stain and u.v. laser exposure do not induce genotoxic effects in flow-sorted boar spermatozoa". Reproduction. 128 (5): 615—621. doi:10.1530/rep.1.00288. PMID 15509707.