IRF3

Регуляторный фактор интерферона 3
Регуляторный фактор интерферона 3
	PDB в комплексе с 1j2f.
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe, RCSB
	Список идентификаторов PDB 1J2F, 1QWT, 1T2K, 1ZOQ, 2O61, 2O6G, 2PI0, 3A77, 3QU6
Идентификаторы
Символ	IRF3
Внешние ID	OMIM: 603734 MGI: 1859179 HomoloGene: 1208 GeneCards: Ген IRF3
Функция	• DNA binding; • sequence-specific DNA binding transcription factor activity; • transcription cofactor activity; • protein binding; • identical protein binding; • protein homodimerization activity; • transcription regulatory region DNA binding;
Компонент клетки	• nucleus; • nucleoplasm; • cytoplasm; • cytosol;
Биологический процесс	• negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter; • toll-like receptor signaling pathway; • MyD88-independent toll-like receptor signaling pathway; • transcription from RNA polymerase II promoter; • apoptotic process; • cellular response to DNA damage stimulus; • viral process; • cytokine-mediated signaling pathway; • lipopolysaccharide-mediated signaling pathway; • negative regulation of type I interferon production; • positive regulation of type I interferon production; • positive regulation of interferon-alpha production; • positive regulation of interferon-beta production; • toll-like receptor 3 signaling pathway; • toll-like receptor 4 signaling pathway; • TRIF-dependent toll-like receptor signaling pathway; • MDA-5 signaling pathway; • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • response to exogenous dsRNA; • innate immune response; • type I interferon biosynthetic process; • negative regulation of interferon-beta biosynthetic process; • negative regulation of defense response to virus by host; • positive regulation of cytokine secretion; • defense response to virus; • interferon-gamma-mediated signaling pathway; • type I interferon signaling pathway; • positive regulation of type I interferon-mediated signaling pathway; • cellular response to dsRNA; • macrophage apoptotic process;
	Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
	Больше информации
Ортологи

Регуляторный фактор интерферона 3, известный также как IRF3 — один из регуляторных факторов интерферонов.^[1]

Функция

IRF3 является членом семейства регуляторных факторов транскрипции (IRF) интерферонов.^[1] IRF3 был первоначально обнаружен в гомологах IRF1 и IRF2. IRF3 был дополнительно охарактеризован и, как было выявлено, содержит несколько функциональных доменов, в том числе домен ядерного экспорта сигнала, ДНК-связывающий домен, ассоциацию с С-концевой областью МАФ и несколько регуляторных фосфорилированных сайтов.^[2] IRF3 находится в неактивной цитоплазматической форме, при серин/ треонин-фосфорилировании образует комплекс с CREBBP^[3] Этот комплекс транслоцируется в ядро и активирует транскрипцию интерферонов альфа и бета, а также других интерферон-индуцированной генов.^[4]

IRF3 играет важную роль в системе врожденного иммунного отклика на вирусную инфекцию.^[5] Были найдены агрегатированные MAVS^[англ.], чтобы активировать димеризацию IRF3.^[6]

Взаимодействия

IRF3 было показано, взаимодействуют с IRF7.^[7]

См. также

Интерферон
IRF1, IRF2, IRF4, IRF5, IRF6, IRF7, IRF8 и IRF9

Примечания

↑ ¹ ² Hiscott J., Pitha P., Genin P., Nguyen H., Heylbroeck C., Mamane Y., Algarte M., Lin R. Triggering the interferon response: the role of IRF-3 transcription factor (англ.) // J. Interferon Cytokine Res. : journal. — 1999. — Vol. 19, no. 1. — P. 1—13. — doi:10.1089/107999099314360. — PMID 10048763.
↑ Lin R., Heylbroeck C., Genin P., Pitha P.M., Hiscott J. Essential Role of Interferon Regulatory Factor 3 in Direct Activation of RANTES Chemokine Transcription (англ.) // Mol Cell Biol : journal. — 1999. — February (vol. 19, no. 2). — P. 959—966. — PMID 9891032. — PMC 116027.
↑ Yoneyama M., Suhara W., Fujita T. Control of IRF-3 activation by phosphorylation (неопр.) // J. Interferon Cytokine Res.. — 2002. — Т. 22, № 1. — С. 73—6. — doi:10.1089/107999002753452674. — PMID 11846977.
↑ Entrez Gene: IRF3 interferon regulatory factor 3 (неопр.).
↑ Collins S.E., Noyce R.S., Mossman K.L. Innate Cellular Response to Virus Particle Entry Requires IRF3 but Not Virus Replication (англ.) // J Virol^[англ.] : journal. — 2004. — February (vol. 78, no. 4). — P. 1706—1717. — doi:10.1128/JVI.78.4.1706-1717.2004. — PMID 14747536. — PMC 369475.
↑ Hou F., Sun L., Zheng H., Skaug B., Jiang Q.X., Chen Z.J. MAVS Forms Functional Prion-Like Aggregates To Activate and Propagate Antiviral Innate Immune Response (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 2011. — 5 August (vol. 146, no. 3). — P. 448—461. — doi:10.1016/j.cell.2011.06.041. — PMID 21782231. — PMC 3179916.
↑ Au W.C., Yeow W.S., Pitha P.M. Analysis of functional domains of interferon regulatory factor 7 and its association with IRF-3 (англ.) // Virology : journal. — 2001. — February (vol. 280, no. 2). — P. 273—282. — doi:10.1006/viro.2000.0782. — PMID 11162841.

Литература

Pitha P.M., Au W.C., Lowther W., Juang Y.T., Schafer S.L., Burysek L., Hiscott J., Moore P.A. Role of the interferon regulatory factors (IRFs) in virus-mediated signaling and regulation of cell growth (англ.) // Biochimie^[англ.] : journal. — 1999. — Vol. 80, no. 8—9. — P. 651—658. — doi:10.1016/S0300-9084(99)80018-2. — PMID 9865487.
Yoneyama M., Suhara W., Fujita T. Control of IRF-3 activation by phosphorylation (неопр.) // J. Interferon Cytokine Res.. — 2002. — Т. 22, № 1. — С. 73—6. — doi:10.1089/107999002753452674. — PMID 11846977.
Au W.C., Moore P.A., Lowther W., Juang Y.T., Pitha P.M. Identification of a member of the interferon regulatory factor family that binds to the interferon-stimulated response element and activates expression of interferon-induced genes (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1996. — Vol. 92, no. 25. — P. 11657—11661. — doi:10.1073/pnas.92.25.11657. — PMID 8524823. — PMC 40461.
Yoneyama M., Suhara W., Fukuhara Y., Fukuda M., Nishida E., Fujita T. Direct triggering of the type I interferon system by virus infection: activation of a transcription factor complex containing IRF-3 and CBP/p300 (англ.) // EMBO J. : journal. — 1998. — Vol. 17, no. 4. — P. 1087—1095. — doi:10.1093/emboj/17.4.1087. — PMID 9463386. — PMC 1170457.
Weaver B.K., Kumar K.P., Reich N.C. Interferon Regulatory Factor 3 and CREB-Binding Protein/p300 Are Subunits of Double-Stranded RNA-Activated Transcription Factor DRAF1 (англ.) // Mol. Cell. Biol. : journal. — 1998. — Vol. 18, no. 3. — P. 1359—1368. — PMID 9488451. — PMC 108849.
Lin R., Heylbroeck C., Pitha P.M., Hiscott J. Virus-Dependent Phosphorylation of the IRF-3 Transcription Factor Regulates Nuclear Translocation, Transactivation Potential, and Proteasome-Mediated Degradation (англ.) // Mol. Cell. Biol. : journal. — 1998. — Vol. 18, no. 5. — P. 2986—2996. — PMID 9566918. — PMC 110678.
Ronco L.V., Karpova A.Y., Vidal M., Howley P.M. Human papillomavirus 16 E6 oncoprotein binds to interferon regulatory factor-3 and inhibits its transcriptional activity (англ.) // Genes Dev. : journal. — 1998. — Vol. 12, no. 13. — P. 2061—2072. — doi:10.1101/gad.12.13.2061. — PMID 9649509. — PMC 316980.
Bellingham J., Gregory-Evans K., Gregory-Evans C.Y. Mapping of human interferon regulatory factor 3 (IRF3) to chromosome 19q13.3-13.4 by an intragenic polymorphic marker (англ.) // Annals of Human Genetics^[англ.] : journal. — 1999. — Vol. 62, no. Pt 3. — P. 231—234. — doi:10.1046/j.1469-1809.1998.6230231.x. — PMID 9803267.
Lowther W.J., Moore P.A., Carter K.C., Pitha P.M. Cloning and functional analysis of the human IRF-3 promoter (англ.) // DNA Cell Biol.^[англ.] : journal. — 1999. — Vol. 18, no. 9. — P. 685—692. — doi:10.1089/104454999314962. — PMID 10492399.
Kim T., Kim T.Y., Song Y.H., Min I.M., Yim J., Kim T.K. Activation of interferon regulatory factor 3 in response to DNA-damaging agents (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1999. — Vol. 274, no. 43. — P. 30686—30689. — doi:10.1074/jbc.274.43.30686. — PMID 10521456.
Kumar K.P., McBride K.M., Weaver B.K., Dingwall C., Reich N.C. Regulated Nuclear-Cytoplasmic Localization of Interferon Regulatory Factor 3, a Subunit of Double-Stranded RNA-Activated Factor 1 (англ.) // Mol. Cell. Biol. : journal. — 2000. — Vol. 20, no. 11. — P. 4159—4168. — doi:10.1128/MCB.20.11.4159-4168.2000. — PMID 10805757. — PMC 85785.
Suhara W., Yoneyama M., Iwamura T., Yoshimura S., Tamura K., Namiki H., Aimoto S., Fujita T. Analyses of virus-induced homomeric and heteromeric protein associations between IRF-3 and coactivator CBP/p300 (англ.) // J. Biochem.^[англ.] : journal. — 2000. — Vol. 128, no. 2. — P. 301—307. — doi:10.1093/oxfordjournals.jbchem.a022753. — PMID 10920266.
Servant M.J., ten Oever B., LePage C., Conti L., Gessani S., Julkunen I., Lin R., Hiscott J. Identification of distinct signaling pathways leading to the phosphorylation of interferon regulatory factor 3 (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2001. — Vol. 276, no. 1. — P. 355—363. — doi:10.1074/jbc.M007790200. — PMID 11035028.
Smith E.J., Marié I., Prakash A., García-Sastre A., Levy D.E. IRF3 and IRF7 phosphorylation in virus-infected cells does not require double-stranded RNA-dependent protein kinase R or Ikappa B kinase but is blocked by Vaccinia virus E3L protein (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2001. — Vol. 276, no. 12. — P. 8951—8957. — doi:10.1074/jbc.M008717200. — PMID 11124948.
Au W.C., Yeow W.S., Pitha P.M. Analysis of functional domains of interferon regulatory factor 7 and its association with IRF-3 (англ.) // Virology : journal. — 2001. — Vol. 280, no. 2. — P. 273—282. — doi:10.1006/viro.2000.0782. — PMID 11162841.
Barnes B.J., Moore P.A., Pitha P.M. Virus-specific activation of a novel interferon regulatory factor, IRF-5, results in the induction of distinct interferon alpha genes (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2001. — Vol. 276, no. 26. — P. 23382—23390. — doi:10.1074/jbc.M101216200. — PMID 11303025.
Mach C.M., Hargrove B.W., Kunkel G.R. The Small RNA gene activator protein, SphI postoctamer homology-binding factor/selenocysteine tRNA gene transcription activating factor, stimulates transcription of the human interferon regulatory factor-3 gene (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2002. — Vol. 277, no. 7. — P. 4853—4858. — doi:10.1074/jbc.M108308200. — PMID 11724783.
Morin P., Bragança J., Bandu M.T., Lin R., Hiscott J., Doly J., Civas A. Preferential binding sites for interferon regulatory factors 3 and 7 involved in interferon-A gene transcription (англ.) // J. Mol. Biol.^[англ.] : journal. — 2002. — Vol. 316, no. 5. — P. 1009—1022. — doi:10.1006/jmbi.2001.5401. — PMID 11884139.
Dang O., Navarro L., Anderson K., David M. Cutting edge: anthrax lethal toxin inhibits activation of IFN-regulatory factor 3 by lipopolysaccharide (англ.) // J. Immunology : journal. — 2004. — Vol. 172, no. 2. — P. 747—751. — doi:10.4049/jimmunol.172.2.747. — PMID 14707042.

[pmid10048763-1] ¹ ² Hiscott J., Pitha P., Genin P., Nguyen H., Heylbroeck C., Mamane Y., Algarte M., Lin R. Triggering the interferon response: the role of IRF-3 transcription factor (англ.) // J. Interferon Cytokine Res. : journal. — 1999. — Vol. 19, no. 1. — P. 1—13. — doi:10.1089/107999099314360. — PMID 10048763.

[Lin-1999-2] Lin R., Heylbroeck C., Genin P., Pitha P.M., Hiscott J. Essential Role of Interferon Regulatory Factor 3 in Direct Activation of RANTES Chemokine Transcription (англ.) // Mol Cell Biol : journal. — 1999. — February (vol. 19, no. 2). — P. 959—966. — PMID 9891032. — PMC 116027.

[pmid11846977-3] Yoneyama M., Suhara W., Fujita T. Control of IRF-3 activation by phosphorylation (неопр.) // J. Interferon Cytokine Res.. — 2002. — Т. 22, № 1. — С. 73—6. — doi:10.1089/107999002753452674. — PMID 11846977.

[4] Entrez Gene: IRF3 interferon regulatory factor 3 (неопр.).

[Collins-2004-5] Collins S.E., Noyce R.S., Mossman K.L. Innate Cellular Response to Virus Particle Entry Requires IRF3 but Not Virus Replication (англ.) // J Virol^[англ.] : journal. — 2004. — February (vol. 78, no. 4). — P. 1706—1717. — doi:10.1128/JVI.78.4.1706-1717.2004. — PMID 14747536. — PMC 369475.

[6] Hou F., Sun L., Zheng H., Skaug B., Jiang Q.X., Chen Z.J. MAVS Forms Functional Prion-Like Aggregates To Activate and Propagate Antiviral Innate Immune Response (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 2011. — 5 August (vol. 146, no. 3). — P. 448—461. — doi:10.1016/j.cell.2011.06.041. — PMID 21782231. — PMC 3179916.

[pmid11162841-7] Au W.C., Yeow W.S., Pitha P.M. Analysis of functional domains of interferon regulatory factor 7 and its association with IRF-3 (англ.) // Virology : journal. — 2001. — February (vol. 280, no. 2). — P. 273—282. — doi:10.1006/viro.2000.0782. — PMID 11162841.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]