IRF5

Регуляторный фактор интерферона 5
Регуляторный фактор интерферона 5
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe, RCSB
	Список идентификаторов PDB 3DSH
Идентификаторы
Символ	IRF5 ; SLEB10
Внешние ID	OMIM: 607218 MGI: 1350924 HomoloGene: 8088 GeneCards: Ген IRF5
Функция	• regulatory region DNA binding; • sequence-specific DNA binding transcription factor activity; • protein binding;
Компонент клетки	• nucleus; • cytoplasm; • cytosol;
Биологический процесс	• transcription, DNA-templated; • cytokine-mediated signaling pathway; • response to peptidoglycan; • response to muramyl dipeptide; • positive regulation of interferon-alpha production; • positive regulation of interferon-beta production; • positive regulation of interleukin-12 production; • positive regulation of apoptotic process; • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter; • defense response to virus; • interferon-gamma-mediated signaling pathway; • type I interferon signaling pathway;
	Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
	Больше информации
Ортологи

Регуляторный фактор интерферона 5 — белок, который у человека кодируется геном IRF5.^[1]

Функция

IRF5 является членом семейства регуляторных факторов интерферона (МАФ), группы транскрипционных факторов с различными ролями, в том числе вирус-опосредованной активации интерферона и модуляции роста клеток, их дифференциации, апоптоза и активности иммунной системы. Члены семьи IRF характеризуются консервативным N-концевым^[англ.] ДНК-связывающим доменом^[англ.], содержащим повторяющийся триптофан (W). Существуют альтернативные варианты сплайсинга, кодирующих различные изоформы.^[1]

Клиническое значение

IRF5 действует как молекулярный переключатель, который управляет макрофагами, будут ли они способствовать или препятствовать воспалению. Блокирование производства IRF5 в макрофагах может помочь в лечении широкого спектра аутоиммунных заболеваний, и повышение уровня IRF5 может помочь в лечении людей, чья иммунная система слаба, неэффективна или повреждена. IRF5 похоже работает «либо взаимодействуя с ДНК непосредственно, либо путём взаимодействия с другими белками, которые сами управляют, какие гены переключать».^[2]

См. также

Интерферон
IRF1, IRF2, IRF3, IRF4, IRF6, IRF7, IRF8 и IRF9

Примечания

↑ ¹ ² Entrez Gene: IRF5 interferon regulatory factor 5 (неопр.). Архивировано 8 марта 2010 года.
↑ Krausgruber T., Blazek K., Smallie T., Alzabin S., Lockstone H., Sahgal N., Hussell T., Feldmann M., Udalova I.A. IRF5 promotes inflammatory macrophage polarization and T(H)1-T(H)17 responses (англ.) // Nature Immunology : journal. — 2011. — January (vol. 12, no. 3). — P. 231—238. — doi:10.1038/ni.1990. — PMID 21240265.

Литература

Pitha P.M., Au W.C., Lowther W., et al. Role of the interferon regulatory factors (IRFs) in virus-mediated signaling and regulation of cell growth (англ.) // Biochimie^[англ.] : journal. — 1999. — Vol. 80, no. 8—9. — P. 651—658. — doi:10.1016/S0300-9084(99)80018-2. — PMID 9865487.
Barnes B., Lubyova B., Pitha P.M. On the role of IRF in host defense (неопр.) // J. Interferon Cytokine Res.. — 2002. — Т. 22, № 1. — С. 59—71. — doi:10.1089/107999002753452665. — PMID 11846976.
Barnes B.J., Moore P.A., Pitha P.M. Virus-specific activation of a novel interferon regulatory factor, IRF-5, results in the induction of distinct interferon alpha genes (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2001. — Vol. 276, no. 26. — P. 23382—23390. — doi:10.1074/jbc.M101216200. — PMID 11303025.
Nehyba J., Hrdlicková R., Burnside J., Bose H.R. A novel interferon regulatory factor (IRF), IRF-10, has a unique role in immune defense and is induced by the v-Rel oncoprotein (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 2002. — Vol. 22, no. 11. — P. 3942—3957. — doi:10.1128/MCB.22.11.3942-3957.2002. — PMID 11997525. — PMC 133824.
Barnes B.J., Kellum M.J., Field A.E., Pitha P.M. Multiple regulatory domains of IRF-5 control activation, cellular localization, and induction of chemokines that mediate recruitment of T lymphocytes (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 2002. — Vol. 22, no. 16. — P. 5721—5740. — doi:10.1128/MCB.22.16.5721-5740.2002. — PMID 12138184. — PMC 133975.
Strausberg R.L., Feingold E.A., Grouse L.H., et al. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
Barnes B.J., Field A.E., Pitha-Rowe P.M. Virus-induced heterodimer formation between IRF-5 and IRF-7 modulates assembly of the IFNA enhanceosome in vivo and transcriptional activity of IFNA genes (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2003. — Vol. 278, no. 19. — P. 16630—16641. — doi:10.1074/jbc.M212609200. — PMID 12600985.
Scherer S.W., Cheung J., MacDonald J.R., et al. Human chromosome 7: DNA sequence and biology (англ.) // Science. — 2003. — Vol. 300, no. 5620. — P. 767—772. — doi:10.1126/science.1083423. — PMID 12690205. — PMC 2882961.
Barnes B.J., Kellum M.J., Pinder K.E., et al. Interferon regulatory factor 5, a novel mediator of cell cycle arrest and cell death (англ.) // Cancer Research^[англ.] : journal. — American Association for Cancer Research^[англ.], 2003. — Vol. 63, no. 19. — P. 6424—6431. — PMID 14559832.
Barnes B.J., Richards J., Mancl M., et al. Global and distinct targets of IRF-5 and IRF-7 during innate response to viral infection (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2004. — Vol. 279, no. 43. — P. 45194—45207. — doi:10.1074/jbc.M400726200. — PMID 15308637.
Gerhard D.S., Wagner L., Feingold E.A., et al. The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC) (англ.) // Genome Research : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334. — PMC 528928.
Lin R., Yang L., Arguello M., et al. A CRM1-dependent nuclear export pathway is involved in the regulation of IRF-5 subcellular localization (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2005. — Vol. 280, no. 4. — P. 3088—3095. — doi:10.1074/jbc.M408452200. — PMID 15556946.
Sigurdsson S., Nordmark G., Göring H.H., et al. Polymorphisms in the tyrosine kinase 2 and interferon regulatory factor 5 genes are associated with systemic lupus erythematosus (англ.) // American Journal of Human Genetics^[англ.] : journal. — 2005. — Vol. 76, no. 3. — P. 528—537. — doi:10.1086/428480. — PMID 15657875. — PMC 1196404.
Takaoka A., Yanai H., Kondo S., et al. Integral role of IRF-5 in the gene induction programme activated by Toll-like receptors (англ.) // Nature : journal. — 2005. — Vol. 434, no. 7030. — P. 243—249. — doi:10.1038/nature03308. — PMID 15665823.
Schoenemeyer A., Barnes B.J., Mancl M.E., et al. The interferon regulatory factor, IRF5, is a central mediator of toll-like receptor 7 signaling (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2005. — Vol. 280, no. 17. — P. 17005—17012. — doi:10.1074/jbc.M412584200. — PMID 15695821.
Mancl M.E., Hu G., Sangster-Guity N., Olshalsky S.L., Hoops K., Fitzgerald-Bocarsly P., Pitha P.M., Pinder K., Barnes B.J. Two discrete promoters regulate the alternatively spliced human interferon regulatory factor-5 isoforms. Multiple isoforms with distinct cell type-specific expression, localization, regulation, and function (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2005. — June (vol. 280, no. 22). — P. 21078—21090. — doi:10.1074/jbc.M500543200. — PMID 15805103.
Rual J.F., Venkatesan K., Hao T., et al. Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network (англ.) // Nature : journal. — 2005. — Vol. 437, no. 7062. — P. 1173—1178. — doi:10.1038/nature04209. — PMID 16189514.
Graham R.R., Kozyrev S.V., Baechler E.C., et al. A common haplotype of interferon regulatory factor 5 (IRF5) regulates splicing and expression and is associated with increased risk of systemic lupus erythematosus (англ.) // Nature Genetics : journal. — 2006. — Vol. 38, no. 5. — P. 550—555. — doi:10.1038/ng1782. — PMID 16642019.

[entrez-1] ¹ ² Entrez Gene: IRF5 interferon regulatory factor 5 (неопр.). Архивировано 8 марта 2010 года.

[pmid21240265-2] Krausgruber T., Blazek K., Smallie T., Alzabin S., Lockstone H., Sahgal N., Hussell T., Feldmann M., Udalova I.A. IRF5 promotes inflammatory macrophage polarization and T(H)1-T(H)17 responses (англ.) // Nature Immunology : journal. — 2011. — January (vol. 12, no. 3). — P. 231—238. — doi:10.1038/ni.1990. — PMID 21240265.

[1]

[2]