
Лизосо́ма — окружённая мембраной клеточная органелла, в полости которой поддерживается кислая среда и находится множество растворимых гидролитических ферментов. Лизосома отвечает за внутриклеточное переваривание макромолекул, в том числе при аутофагии; лизосома способна к секреции своего содержимого во время экзоцитоза; также лизосома участвует в некоторых внутриклеточных сигнальных путях, связанных с метаболизмом и ростом клетки.

Эндосома — мембранная внутриклеточная органелла, один из типов везикул, образующаяся при слиянии и созревании эндоцитозных пузырьков. Зрелые эндосомы представляют собой образования размером 300-400 нм.

SNAP25 — мембранный белок, компонент белкового комплекса SNARE, осуществляющего стыковку синаптической везикулы с пресинаптической мембраной нейрона и их слияние с последующим высвобождением нейромедиатора.

LAMP2 — один из важнейших гликопротеинов лизосомальной мембраны. Вместе с другим гомологичным белком LAMP1 составляет около 50 % от всех белков мембраны лизосом. Наличие этих белков считается структурным определением лизосом как внутриклеточных органелл.

TLR3 — мембранный белок, относится к группе толл-подобных рецепторов, обеспечивающих функционирование врождённого иммунитета. TLR3 связывает двухцепочечную РНК вирусов и, таким образом, играет важную роль в противовирусной защите организма. Обнаружен в 2001 году.

TLR6 — мембранный белок, входящий в группу толл-подобных рецепторов, обеспечивающих функционирование врождённого иммунитета. Образует гетеродимерный комплекс с TLR2, поэтому его вместе с TLR1 относят к подгруппе «TLR2». Рецептор распознаёт патоген-связанные молекулярные структуры грам-положительных бактерий и грибков. Рецептор был открыт в 1999 году. Обнаружен на поверхности моноцитов, эндотелиальных клеток кожных капилляров и некоторых других клеток.
Внутриклеточная сортировка белков — процессы мечения и последующего транспорта белков в живых клетках, которые приводят к попаданию белков в определённые компартменты клетки.

Толл-подобный рецептор 9 — мембранный белок, входящий в группу толл-подобных рецепторов, обеспечивающих функционирование врождённого иммунитета. Продукт гена TLR9. TLR9 экспрессирован на клетках иммунной системы, включая дендритные клетки, макрофаги, естественные киллеры и другие антигенпредставляющие клетки. Распознаёт CpG-участки на молекуле ДНК, которые встречаются относительно редко (~1%) в ДНК позвоночных по сравнению с бактериальной или вирусной ДНК. Это внутриклеточный белок, локализующийся в эндосомах.

ADAM17 — фермент металлопротеаза, относящийся к семейству металлопротеаз ADAM. Основная роль фермента ADAM17 — отщепление мембранного фрагмента синтезированного фактора некроза опухоли и перевод этого цитокина в растворимое состояние.

Rac1 — внутриклеточный белок из суперсемейства ГТФаз, относится к «малым» G-белкам. Находится в двух состояниях: активном ГТФ-связанном и неактивном ГДФ-связанном состоянии. В своей активной форме Rac1 связывается в клетке с целым рядом эффекторных белков и приводит к регулировке многих клеточных процессов, таких как секреция, фагоцитоз апоптозных клеток, поляризация эпителиальных клеток и индуцированное факторами роста образование мембранных складок и выростов.

LAMP3 — гликопротеин лизосомальной мембраны из семейства белков LAMP. Представлен в лимфоидных органах и в дендритных клетках.
CD68 — гликопротеин из семейства LAMP. Экспрессирован на поверхности моноцитов и макрофагов и используется в качестве маркёра макрофагов.

Эндомембра́нная систе́ма — система разнообразных мембран, располагающихся в цитоплазме эукариотической клетки. Эти мембраны делят клетку на функциональные компартменты, или органеллы. К компонентам эндомембранной системы относят ядерную оболочку, эндоплазматический ретикулум, аппарат Гольджи, лизосомы, везикулы, вакуоли и клеточную мембрану. Мембраны эндомембранной системы составляют единую функциональную единицу и либо непосредственно соединяются друг с другом, либо обмениваются материалом посредством везикулярного транспорта. В эндомембранную систему не входят мембраны митохондрий, пероксисом и хлоропластов, хотя, возможно, она произошла от митохондриальных мембран.

CLEC10A — мембранный белок, лектин типа С. Продукт гена человека CLEC10A.

CLEC4C — мембранный белок, экспрессирован на плазмацитоидных дендритных клетках. Продукт гена человека CLEC4C.

SLAMF8 — мембранный белок, продукт гена человека SLAMF8. Входит в семейство сигнальных лимфоцитарных молекул активации.

Мембранный гликопротеин OX-2 — мембранный белок суперсемейства иммуноглобулинов, продукт гена CD200. Является лигандом для рецептора CD200R1.

CLEC9A — мембранный белок, экспрессирован на подтипе дендритных клеток и моноцитов. Продукт гена человека CLEC9A.

CD146, это белок с массой 113kDa, называемый также MCAM или MUC18, который был впервые обнаружен в 1987 году как опухолевый антиген гликопротеин MUC18. В связи с высокой гомологией последовательности MUC18 с молекулами клеточной адгезии (CAM), этому антигену было дано название — Mel-CAM или MCAM. CD146 является белковым маркером эндотелиальных клеток, которыми выстланы сосуды. Продемонстрировано участие CD146 в регуляции ангиогенеза, проницаемости сосудов и трансмиграции лейкоцитов. Обнаружен этот белок и в некоторых других клетках, например в мезенхимальных стволовых клетках.

Нектин-3 — мембранный белок, молекула клеточной адгезии, участвующая в образовании межклеточных адгезивных контактов. Входит в суперсемейство иммуноглобулинов, продукт гена человека NECTIN3.