Метод молекулярной динамики — метод, в котором временная эволюция системы взаимодействующих атомов или частиц отслеживается интегрированием их уравнений движения
Афроте́рии (лат. Afrotheria, буквально: африканские звери) — ветвь плацентарных млекопитающих, выделенная в результате молекулярно-генетических исследований. Согласно молекулярным данным, древнейшие афротерии возникли в позднем мелу на территории Афро-Аравии во время изоляции континента от других частей Гондваны. Изоляция Афро-Аравии окончилась в конце олигоцена — начале миоцена, около 24 миллионов лет назад, когда между Афро-Аравией и Евразией образовался сухопутный мост.
Копы́тные (лат. Euungulata, в ФилоКоде — Ungulata) — грандотряд плацентарных млекопитающих из надотряда лавразиатерий, в современной фауне представленный отрядами непарнокопытных и китопарнокопытных. Название дано по признаку наличия у большинства представителей копыт, возможно, унаследованных от общего предка; китообразные, хотя и не обладают копытами, в эволюционном смысле относятся к копытным, поскольку произошли от вымерших наземных копытных.
Китопарнокопытные (лат. Cetartiodactyla) — отряд плацентарных млекопитающих, объединяющий парнокопытных и китообразных. Включает четыре подотряда: жвачные (Ruminantia), мозоленогие (Tylopoda), свинообразные (Suina) и Whippomorpha, из которых наиболее разнообразен первый. Китопарнокопытные являются одной из наиболее эволюционно успешных групп млекопитающих; по данным Американского общества маммалогов, к отряду относится 359 современных видов в 131 роде и 23 семействах, а также не менее 5 видов, вымерших после 1500 года.
Хемоинформатика — применение методов информатики для решения химических проблем.
Молекулярное моделирование (ММ) — собирательное название методов исследования структуры и свойств молекул вычислительными методами с последующей визуализацией результатов, обеспечивающие их трехмерное представления при заданных в расчете условиях.
Поиск количественных соотношений структура-свойство — процедура построения моделей, позволяющих по структурам химических соединений предсказывать их разнообразные свойства. За моделями, позволяющими прогнозировать количественные характеристики биологической активности, исторически закрепилось англоязычное название Quantitative Structure-Activity Relationship (QSAR). Аббревиатура QSAR часто трактуется расширенно для обозначения любых моделей структура-свойство. За моделями, позволяющими прогнозировать физические и физикохимические свойства органических соединений, закрепилось англоязычное название Quantitative Structure-Property Relationship (QSPR). При качественном описании соотношений между структурами химических соединений и их биологической активностью употребляют англоязычный термин Structure-Activity Relationship (SAR).
Понятие молекулярного подобия является одной из ключевых концепций хемоинформатики. Оно играет важную роль в современных подходах к прогнозированию свойств химических соединений, дизайну новых соединений с заранее заданными свойствами и, в особенности, при поиске новых лекарственных препаратов путём проведения скрининга больших баз данных по доступным химическим соединениям. Подобный поиск основан на принципе подобия свойств, сформулированном Johnson и Maggiora: подобные химические соединения обладают подобными свойствами.
Формикоидеа (лат. Formicoidea) — надсемейство из отряда перепончатокрылых насекомых, родственное осам и пчёлам. В него включают единственное семейство муравьёв и более 12000 видов.
Бореоэуте́рии — таксон млекопитающих, выделенный недавно на основе молекулярных исследований. Название происходит от греческих слов: βόρειο ‘север’ + θεριό ‘зверь’. Магнотряд бореоэутерии состоит из двух сестринских таксонов: Laurasiatheria (лавразиатерии) и Euarchontoglires (эуархонтоглиры); в последний, в частности, входит и человек.
Молекуля́рный до́кинг — метод молекулярного моделирования, позволяющий предсказать наиболее выгодную для образования устойчивого комплекса ориентацию и конформацию одной молекулы (лиганда) в сайте связывания другой (рецептора). Данные о положении и конформации партнеров используются для предсказания силы взаимодействия посредством так называемых оценочных функций. В случае, если лиганд является макромолекулой, докинг называют макромолекулярным.
Никола́й Серафи́мович Зефи́ров — советский и российский химик-органик; академик РАН. Специалист в области синтеза органических соединений, стереохимии, механизмов органических реакций скелетных перегруппировок, применения ЭВМ для решения структурных проблем. Лауреат Государственной премии СССР.
Nature Biotechnology — научный журнал, издаваемый Nature Publishing Group с 1983 года, посвящённый научным и прикладным исследованиям в области биотехнологии. До 1996 года носил название Nature Bio/technology.
Nature Structural & Molecular Biology — научный журнал, издаваемый Nature Publishing Group с 1994 года и посвящённый последним достижениям в области структурной и молекулярной биологии.
Арье Варшель — израильский и американский биохимик и биофизик, лауреат Нобелевской премии по химии за 2013 год совместно с Майклом Левиттом и Мартином Карплусом с формулировкой за «компьютерное моделирование химических систем».
ChemSpider — база данных химических соединений и смесей, принадлежащая королевскому химическому обществу Великобритании .
Молекулярная машина — отдельная молекула или молекулярный комплекс, которая способна осуществлять квазимеханические движения, направленные на совершение полезной работы. Такой термин обычно применяется к молекулам, которые в той или иной мере имитируют работу макромашин. Название широко распространено в нанотехнологии, в которой с целью создания наноассемблера был предложен целый ряд сложных молекулярных машин. В общем случае молекулярные машины можно разделить на две большие категории: искусственные и биологические.
Cellular and Molecular Life Sciences — рецензируемый научный журнал, охватывающий клеточную и молекулярную биологию. Он был основан в 1945 году с названием Experientia, в 1994 году был переименован в действующее на данный момент название. Главный редактор журнала — Клаус Эйхман. Согласно Journal Citation Reports журнал на 2016 имел импакт-фактор 5.788.
Ферунгуля́ты (лат. Ferungulata, буквально — дикие звери и копытные) — клада плацентарных млекопитающих из надотряда лавразиатерий (Laurasiatheria), в современной фауне представленная двумя грандотрядами — Ferae и копытными ; последний грандотряд в некоторых источниках объединяется вместе с ископаемым семейством Protungulatidae в кладу Pan-Euungulata. Ферунгуляты представляют собой сестринскую по отношению к отряду рукокрылых (Chiroptera) группу, с которыми они вместе составляют внеранговую кладу Scrotifera.
Scrotifera — клада плацентарных млекопитающих, объединяющяя рукокрылых и ферунгулятов.
