NECTIN1

Перейти к навигацииПерейти к поиску
NECTIN1
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

3ALP, 3SKU, 3U83, 4FMF, 4MYW

Идентификаторы
ПсевдонимыNECTIN1, CD111, CLPED1, ED4, HIgR, HV1S, HVEC, OFC7, PRR, PRR1, PVRR, PVRR1, SK-12, nectin-1, PVRL1, nectin cell adhesion molecule 1
Внешние IDOMIM: 600644 MGI: 1926483 HomoloGene: 2138 GeneCards: NECTIN1
Расположение гена (человек)
11-я хромосома человека
Хр.11-я хромосома человека[1]
11-я хромосома человека
Расположение в геноме NECTIN1
Расположение в геноме NECTIN1
Локус11q23.3Начало119,623,408 bp[1]
Конец119,729,200 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
9-я хромосома мыши
Хр.9-я хромосома мыши[2]
9-я хромосома мыши
Расположение в геноме NECTIN1
Расположение в геноме NECTIN1
Локус9|9 A5.1Начало43,655,281 bp[2]
Конец43,743,955 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
Наибольшая экспрессия в
Дополнительные справочные данные
BioGPS




Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_203286
NM_002855
NM_032767
NM_203285

NM_021424

RefSeq (белок)

NP_002846
NP_976030
NP_976031

NP_067399

Локус (UCSC)Chr 11: 119.62 – 119.73 MbChr 9: 43.66 – 43.74 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Нектин-1 (PVRL1; CD111) — мембранный белок, нектин группы молекул клеточной адгезии, гликопротеин суперсемейства иммуноглобулинов, продукт гена человека NECTIN1[5].

Структура

Нектин-1 состоит из 517 аминокислот, молекулярная масса белковой части 57 158 Да. Нектин-1 содержит 3 внеклеточных иммуноглобулиновых доменов, трансмембранный фрагмент и цитоплазматический домен. Белок опосредует Ca2+-зависимую клеточную адгезию[5].

Функции

Нектин-1 — молекула адезии, обнаруженная в широком спектре тканей, в которых она локализуется в участках межклеточных контактов, таких как адгезивные контакты в эпителии или химические синапсы в нейронах. Цитоплазматический участок белка связывается с белком афадином, связанным с актином.

В синапсах нектин-1 взаимодействует с нектином-3, причём оба белка экспрессированы в нервной ткани как на ранних этапах развития, так и в стареющем мозге. В синапсе эти белки расположены асимметрично: нектин-1 в первую очередь локализован на аксоне, а нектин-3 — на дендрите.

Нектин-1 играет ключевую роль как рецептор в опосредовании входа в клетку вируса герпеса ВПГ-1 за счёт взаимодействия с вирусным гликопротеином D (gD)[6].

Взаимодействия

Нектин-1 взаимодействует с MLLT4.[7].

Примечания

  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000110400 - Ensembl, May 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000032012 - Ensembl, May 2017
  3. Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. 1 2 Entrez Gene: PVRL1 poliovirus receptor-related 1 (herpesvirus entry mediator C; nectin). Дата обращения: 24 января 2022. Архивировано 7 марта 2010 года.
  6. Cocchi F, Lopez M, Menotti L, Aoubala M, Dubreuil P, Campadelli-Fiume G (1999). "The V domain of herpesvirus Ig-like receptor (HIgR) contains a major functional region in herpes simplex virus-1 entry into cells and interacts physically with the viral glycoprotein D". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95 (26): 15700—5. doi:10.1073/pnas.95.26.15700. PMC 28107. PMID 9861033.
  7. Takahashi K, Nakanishi H, Miyahara M, Mandai K, Satoh K, Satoh A, Nishioka H, Aoki J, Nomoto A, Mizoguchi A, Takai Y (May 1999). "Nectin/PRR: An Immunoglobulin-like Cell Adhesion Molecule Recruited to Cadherin-based Adherens Junctions through Interaction with Afadin, a PDZ Domain–containing Protein". J. Cell Biol. 145 (3): 539—49. doi:10.1083/jcb.145.3.539. PMC 2185068. PMID 10225955.

Литература