NME2

Перейти к навигацииПерейти к поиску
NME/NM23 нуклеозидная дифосфаткиназа 2
PDB представлено на примере 1be4.PDB представлено на примере 1be4.
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe, RCSB
Список идентификаторов PDB

1NSK, 1NUE, 3BBB, 3BBC, 3BBF

Идентификаторы
СимволNME2 ; NDKB; NDPK-B; NDPKB; NM23-H2; NM23B; PUF
Внешние IDOMIM: 156491 MGI: 97356 HomoloGene: 133879 ChEMBL: 2160 GeneCards: Ген NME2
номер EC2.7.13.3, 2.7.4.6
Генная онтология
Функция• DNA binding

• sequence-specific DNA binding transcription factor activity
• nucleoside diphosphate kinase activity
• protein histidine kinase activity
• protein binding
• ATP binding

• metal ion binding
Компонент клетки• ruffle

• nucleus
• cytoplasm
• cytosol
• focal adhesion
• lamellipodium
• extracellular vesicular exosome

• cell periphery
Биологический процесс• nucleoside diphosphate phosphorylation

• GTP biosynthetic process
• UTP biosynthetic process
• CTP biosynthetic process
• transcription, DNA-templated
• regulation of transcription, DNA-templated
• cell adhesion
• integrin-mediated signaling pathway
• nucleoside triphosphate biosynthetic process
• nucleobase-containing small molecule interconversion
• peptidyl-histidine phosphorylation
• negative regulation of apoptotic process
• small molecule metabolic process
• positive regulation of keratinocyte differentiation
• regulation of epidermis development
• positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
• positive regulation of epithelial cell proliferation

• nucleobase-containing small molecule metabolic process
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez483118103
EnsemblENSG00000011052ENSMUSG00000020857
UniProtP22392Q01768
RefSeq (мРНК)NM_001018137NM_001077529
RefSeq (белок)NP_001018147NP_001070997
Локус (UCSC)Chr 17:
49.23 – 49.25 Mb		Chr 11:
93.95 – 93.96 Mb
Поиск в PubMedИскатьИскать

Нуклеозидная дифосфаткиназа B — фермент, кодируемый у человека геном NMe2[1][2].

Функция

Нуклеозидные дифосфаткиназы (NDK) существуют в виде гексамеров, состоящих из 'A' (кодируемого NME1) и 'B' (кодируемого этим геном) изоформ. Были найдены для этого гена несколько вариантов транскриптов альтернативного сплайсинга, кодирующих одни и те же изоформы. Совместные транскрипции этого гена и соседнего, расположенного выше, гена (NME1) формируют обычно встречающиеся транскрипты (NME1-NMe2), которые кодируют слитый белок, состоящий из идентичных последовательностей каждого отдельного продукта гена[2].

Взаимодействия

NME2, как было выявлено, взаимодействует с NME3[3][4] и HERC5[5].

Примечания

  1. ↑ Stahl J.A., Leone A., Rosengard A.M., Porter L., King C.R., Steeg P.S. Identification of a second human nm23 gene, nm23-H2 (англ.) // Cancer Research[англ.] : journal. — 1991. — February (vol. 51, no. 1). — P. 445—449. — PMID 1988104.
  2. ↑ 1 2 Entrez Gene: NME2 non-metastatic cells 2, protein (NM23B) expressed in.
  3. ↑ Stelzl U., Worm U., Lalowski M., Haenig C., Brembeck F.H., Goehler H., Stroedicke M., Zenkner M., Schoenherr A., Koeppen S., Timm J., Mintzlaff S., Abraham C., Bock N., Kietzmann S., Goedde A., Toksöz E., Droege A., Krobitsch S., Korn B., Birchmeier W., Lehrach H., Wanker E.E. A human protein-protein interaction network: a resource for annotating the proteome (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 2005. — September (vol. 122, no. 6). — P. 957—968. — doi:10.1016/j.cell.2005.08.029. — PMID 16169070.
  4. ↑ Negroni A., Venturelli D., Tanno B., Amendola R., Ransac S., Cesi V., Calabretta B., Raschellà G. Neuroblastoma specific effects of DR-nm23 and its mutant forms on differentiation and apoptosis (англ.) // Cell Death & Differentiation : journal. — 2000. — September (vol. 7, no. 9). — P. 843—850. — doi:10.1038/sj.cdd.4400720. — PMID 11042679.
  5. ↑ Hochrainer K., Kroismayr R., Baranyi U., Binder B.R., Lipp J. Highly homologous HERC proteins localize to endosomes and exhibit specific interactions with hPLIC and Nm23B (англ.) // Cellular and Molecular Life Sciences : journal. — 2008. — July (vol. 65, no. 13). — P. 2105—2117. — doi:10.1007/s00018-008-8148-5. — PMID 18535780.

Литература

  • Thakur R.K., Kumar P., Halder K., Verma A., Kar A., Parent J.L., Basundra R., Kumar A., Chowdhury S. Metastases suppressor NM23-H2 interaction with G-quadruplex DNA within c-MYC promoter nuclease hypersensitive element induces c-MYC expression (англ.) // Nucleic Acids Research : journal. — 2009. — Vol. 37, no. 1. — P. 172—183. — doi:10.1093/nar/gkn919. — PMID 19033359. — PMC 2615625.
  • Gilles A.M., Presecan E., Vonica A., Lascu I. Nucleoside diphosphate kinase from human erythrocytes. Structural characterization of the two polypeptide chains responsible for heterogeneity of the hexameric enzyme (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1991. — Vol. 266, no. 14. — P. 8784—8789. — PMID 1851158.
  • Rosengard A.M., Krutzsch H.C., Shearn A., Biggs J.R., Barker E., Margulies I.M., King C.R., Liotta L.A., Steeg P.S. Reduced Nm23/Awd protein in tumour metastasis and aberrant Drosophila development (англ.) // Nature : journal. — 1989. — Vol. 342, no. 6246. — P. 177—180. — doi:10.1038/342177a0. — PMID 2509941.
  • Webb P.A., Perisic O., Mendola C.E., Backer J.M., Williams R.L. The crystal structure of a human nucleoside diphosphate kinase, NM23-H2 (англ.) // Journal of Molecular Biology[англ.] : journal. — 1995. — Vol. 251, no. 4. — P. 574—587. — doi:10.1006/jmbi.1995.0457. — PMID 7658474.
  • Chandrasekharappa S.C., Gross L.A., King S.E., Collins F.S. The human NME2 gene lies within 18kb of NME1 in chromosome 17 (англ.) // Genes, Chromosomes and Cancer[англ.] : journal. — 1993. — Vol. 6, no. 4. — P. 245—248. — doi:10.1002/gcc.2870060411. — PMID 7685630.
  • Ji L., Arcinas M., Boxer L.M. The transcription factor, Nm23H2, binds to and activates the translocated c-myc allele in Burkitt's lymphoma (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1995. — Vol. 270, no. 22. — P. 13392—13398. — doi:10.1074/jbc.270.22.13392. — PMID 7768941.
  • MacDonald N.J., De la Rosa A., Benedict M.A., Freije J.M., Krutsch H., Steeg P.S. A serine phosphorylation of Nm23, and not its nucleoside diphosphate kinase activity, correlates with suppression of tumor metastatic potential (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1993. — Vol. 268, no. 34. — P. 25780—25789. — PMID 8245015.
  • Backer J.M., Mendola C.E., Kovesdi I., Fairhurst J.L., O'Hara B., Eddy R.L., Shows T.B., Mathew S., Murty V.V., Chaganti R.S. Chromosomal localization and nucleoside diphosphate kinase activity of human metastasis-suppressor genes NM23-1 and NM23-2 (англ.) // Oncogene : journal. — 1993. — Vol. 8, no. 2. — P. 497—502. — PMID 8381224.
  • Postel E.H., Berberich S.J., Flint S.J., Ferrone C.A. Human c-myc transcription factor PuF identified as nm23-H2 nucleoside diphosphate kinase, a candidate suppressor of tumor metastasis (англ.) // Science : journal. — 1993. — Vol. 261, no. 5120. — P. 478—480. — doi:10.1126/science.8392752. — PMID 8392752.
  • Kelsell D.P., Black D.M., Solomon E., Spurr N.K. Localization of a second NM23 gene, NME2, to chromosome 17q21-q22 (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press, 1993. — Vol. 17, no. 2. — P. 522—524. — doi:10.1006/geno.1993.1362. — PMID 8406509.
  • Engel M., Véron M., Theisinger B., Lacombe M.L., Seib T., Dooley S., Welter C. A novel serine/threonine-specific protein phosphotransferase activity of Nm23/nucleoside-diphosphate kinase (англ.) // FEBS Journal[англ.] : journal. — 1995. — Vol. 234, no. 1. — P. 200—207. — doi:10.1111/j.1432-1033.1995.200_c.x. — PMID 8529641.
  • Guignard F., Markert M. The nucleoside diphosphate kinase of human neutrophils (англ.) // Biochemical Journal[англ.] : journal. — 1996. — Vol. 316 ( Pt 1), no. 1. — P. 233—238. — PMID 8645210. — PMC 1217327.
  • Moréra S., Lacombe M.L., Xu Y., LeBras G., Janin J. X-ray structure of human nucleoside diphosphate kinase B complexed with GDP at 2 A resolution (англ.) // Structure : journal. — 1995. — Vol. 3, no. 12. — P. 1307—1314. — doi:10.1016/S0969-2126(01)00268-4. — PMID 8747457.
  • Paravicini G., Steinmayr M., André E., Becker-André M. The metastasis suppressor candidate nucleotide diphosphate kinase NM23 specifically interacts with members of the ROR/RZR nuclear orphan receptor subfamily (англ.) // Biochemical and Biophysical Research Communications[англ.] : journal. — 1996. — Vol. 227, no. 1. — P. 82—7. — doi:10.1006/bbrc.1996.1471. — PMID 8858107.
  • Nosaka K., Kawahara M., Masuda M., Satomi Y., Nishino H. Association of nucleoside diphosphate kinase nm23-H2 with human telomeres (англ.) // Biochemical and Biophysical Research Communications[англ.] : journal. — 1998. — Vol. 243, no. 2. — P. 342—348. — doi:10.1006/bbrc.1997.8097. — PMID 9480811.
  • Pinon V.P., Millot G., Munier A., Vassy J., Linares-Cruz G., Capeau J., Calvo F., Lacombe M.L. Cytoskeletal association of the A and B nucleoside diphosphate kinases of interphasic but not mitotic human carcinoma cell lines: specific nuclear localization of the B subunit (англ.) // Experimental Cell Research[англ.] : journal. — 1999. — Vol. 246, no. 2. — P. 355—367. — doi:10.1006/excr.1998.4318. — PMID 9925751.
  • Negroni A., Venturelli D., Tanno B., Amendola R., Ransac S., Cesi V., Calabretta B., Raschellà G. Neuroblastoma specific effects of DR-nm23 and its mutant forms on differentiation and apoptosis (англ.) // Cell Death & Differentiation : journal. — 2000. — Vol. 7, no. 9. — P. 843—850. — doi:10.1038/sj.cdd.4400720. — PMID 11042679.
  • Roymans D., Willems R., Vissenberg K., De Jonghe C., Grobben B., Claes P., Lascu I., Van Bockstaele D., Verbelen J.P., Van Broeckhoven C., Slegers H. Nucleoside diphosphate kinase beta (Nm23-R1/NDPKbeta) is associated with intermediate filaments and becomes upregulated upon cAMP-induced differentiation of rat C6 glioma (англ.) // Experimental Cell Research[англ.] : journal. — 2000. — Vol. 261, no. 1. — P. 127—138. — doi:10.1006/excr.2000.5037. — PMID 11082283.
  • Baillat G., Gaillard S., Castets F., Monneron A. Interactions of phocein with nucleoside-diphosphate kinase, Eps15, and Dynamin I (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2002. — Vol. 277, no. 21. — P. 18961—18966. — doi:10.1074/jbc.M108818200. — PMID 11872741.
  • Fournier H.N., Dupé-Manet S., Bouvard D., Lacombe M.L., Marie C., Block M.R., Albiges-Rizo C. Integrin cytoplasmic domain-associated protein 1alpha (ICAP-1alpha ) interacts directly with the metastasis suppressor nm23-H2, and both proteins are targeted to newly formed cell adhesion sites upon integrin engagement (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2002. — Vol. 277, no. 23. — P. 20895—20902. — doi:10.1074/jbc.M200200200. — PMID 11919189.