Митохо́ндрия — двумембранная сферическая или эллипсоидная органелла диаметром обычно около 1 микрометра. Характерна для большинства эукариотических клеток, как автотрофов, так и гетеротрофов. Энергетическая станция клетки; основная функция — окисление органических соединений и использование освобождающейся при их распаде энергии для генерации электрического потенциала, синтеза АТФ и термогенеза. Эти три процесса осуществляются за счёт движения электронов по электронно-транспортной цепи белков внутренней мембраны. Количество митохондрий в клетках различных организмов существенно отличается: так, одноклеточные зелёные водоросли и трипаносомы имеют лишь одну гигантскую митохондрию, тогда как ооцит и амёба Chaos chaos содержат 300 000 и 500 000 митохондрий соответственно; у кишечных анаэробных энтамёб и некоторых других паразитических простейших митохондрии отсутствуют. В специализированных клетках органов животных содержатся сотни и даже тысячи митохондрий.
Белки́ — высокомолекулярные органические вещества, состоящие из альфа-аминокислот, соединённых в цепочку пептидной связью. В живых организмах аминокислотный состав белков определяется генетическим кодом, при синтезе в большинстве случаев используется 20 стандартных аминокислот. Множество их комбинаций определяет большое разнообразие свойств молекул белков. Кроме того, аминокислотные остатки в составе белка часто подвергаются посттрансляционным модификациям, которые могут возникать и до того, как белок начинает выполнять свою функцию, и во время его «работы» в клетке. Часто в живых организмах несколько молекул разных белков образуют сложные комплексы, например фотосинтетический комплекс и другие комплексы.
Сери́н — гидроксиаминокислота, существует в виде двух оптических изомеров — L и D.
Пероксисо́ма — клеточная органелла, окружённая единственной мембраной и не содержащая ДНК и рибосом. Пероксисомы присутствуют во всех эукариотических клетках. Они содержат ферменты, которые при помощи молекулярного кислорода окисляют некоторые органические вещества. В пероксисомах также происходит β-окисление жирных кислот. В них также протекают первые этапы образования плазмалогенов. У растений пероксисомы клеток листьев участвуют в процессе фотодыхания. Импорт белков в пероксисомы происходит при участии короткой сигнальной последовательности.
5'АМФ-активируемая протеинкиназа — клеточная протеинкиназа, контролирующая энергетический баланс клетки. Активируется при значительном потреблении энергии клетки и нарастании внутриклеточного уровня АМФ. В результате активации АМФК клетка переходит в энергосберегающее состояние. АМФК представляет собой гетеротример, который включает 3 субъединицы: альфа, бета и гамма.
НАДФH-оксидаза, или NADPH-оксидаза (NOX) — клеточный мембрано-связанный мультимолекулярный ферментный комплекс, локализующийся на плазматической мембране и в некоторых органеллах. Особенно обогащены этим ферментом фагоцитарные клетки, такие как макрофаги. Эти оксидазы участвуют в клеточной противомикробной защитной системе, а также в клеточной пролиферации, дифференцировке и регуляции экспрессии генов. Существует целая группа НАДФH-оксидаз, которые различаются по составу субъединиц, клеточной специфичности, регуляции и другим параметрам.
Глюкозо-6-фосфатдегидрогеназа — цитозольный фермент, входящий в пентозофосфатный путь, метаболический путь, обеспечивающий образование клеточного НАДФ-H из НАДФ+. НАДФ-H необходим для поддержания уровня восстановленного глутатиона в клетке, синтеза жирных кислот и изопреноидов. У человека наследственное нарушение активности Г6ФД, или недостаточность глюкозо-6-фосфатдегидрогеназы, приводит к гемолитической анемии.
Цитохром b-245, альфа-полипептид, или p22-phox — трансмембранный белок, субъединица цитохрома b, состоящего из лёгкой цепи (альфа) и тяжёлой цепи (бета). Ген CYBA кодирует лёгкую альфа-субъединицу, необходимый компонент практически всех NADPH-оксидаз. Образует гетеродимер с тяжёлой цепью цитохрома, основным каталитическим компонентом NADPH-оксидаз, требующих, однако, для активации взаимодействия с несколькими регуляторными белками. Играет роль в продукции супероксидов и фагоцитозе.
NADPH-оксидаза 3 (NOX3) — тип NADPH-оксидазы, клеточной мембранной оксидоредуктазы, образующей супероксидный радикал при переносе электрона с НАДФ на кислород. Открыта в 2000 году, обладает сходством с NOX2, а также с NOX1.
NADPH-оксидаза 2, или gp91phox — основной фагоцитарный тип NADPH-оксидазы, клеточной мембранной оксидоредуктазы. Продуцирует супероксидный радикал, необходимый нейтрофилам и макрофагам для уничтожения микроорганизмов.
Цитозольный фактор нейтрофилов 1, или p47-phox — цитозольный регуляторный белок молекулярной массой 47-кДа комплекса NADPH-оксидазы 2. Цитохром b, состоящий из лёгкой цепи (альфа) и тяжёлой цепи (бета) требует связывание этого белка для своей каталитической активации.
Цитозольный фактор нейтрофилов 2, или p67-phox — цитозольный регуляторный белок, компонент комплекса NADPH-оксидазы 2. Цитохром b, состоящий из лёгкой цепи (альфа) и тяжёлой цепи (бета) требует связывание этого белка для своей каталитической активации.
PECAM-1, или CD31, — гликопротеин, мембранный белок из суперсемейства иммуноглобулинов, относится к классу молекул клеточной адгезии. Один из основных белков межклеточных контактов эндотелиальных клеток: одна клетка может содержать до 1 млн копий белка. Часто используется как маркёр эндотелия при иммуногистологическом анализе ткани. Обнаружен также в ме́ньших количествах на циркулирующих тромбоцитах, моноцитах, нейтрофилах и на некоторых типах Т-клеток. Он также относится к подгруппе белков с ингибиторным ITIM участком. Всего известно 30 ITIM-содержащих белков.
ADAM17 — фермент металлопротеаза, относящийся к семейству металлопротеаз ADAM. Основная роль фермента ADAM17 — отщепление мембранного фрагмента синтезированного фактора некроза опухоли и перевод этого цитокина в растворимое состояние.
Rac2 — цитозольный белок, Rho ГТФаза из суперсемейства ГТФаз, относится к «малым» G-белкам. Находится в двух состояниях: активном ГТФ-связанном и неактивном ГДФ-связанном состоянии. В своей активной форме связывается в клетке с целым рядом эффекторных белков и приводит к регулировке многих клеточных процессов, таких как секреция, фагоцитоз апоптозных клеток, поляризация эпителиальных клеток и индуцированное факторами роста образование мембранных складок и выростов. Участвует в активации NADPH-оксидазы NOX2.
CD9 — мембранный белок, гликопротеин из надсемейства тетраспанинов. Белок был открыт в 1981 году и стал первым представителем семейства белков тетраспанинов, включающим на настоящий момент 34 белка млекопитающих, из которых 33 найдены у человека. CD9 играет роль в клеточной миграции и адгезии.
Интегрин бета-3 (CD61) — мембранный белок, гликопротеин из надсемейства интегринов, продукт гена ITGB3. Компонент гликопротеина IIb/IIIa, обеспечивающего агрегацию тромбоцитов.
CD46 — мембранный белок, ингибирующий рецептор комплемента, продукт гена CD46.
Цинковый палец-2 семейства FEZ, сокращённо FEZF2 или FEZF-2 — это белок, который у человека кодируется геном FEZF2, расположенным на З-й хромосоме человеческого генома. Длина аминокислотной последовательности этого белка составляет 459 аминокислот. Молекулярная масса этого белка составляет 48 811 дальтон.
CD70, также лиганд CD27LG, или TNFSF7 — цитокин семейства факторов некроза опухоли, в основном, локализующийся на активированных T- и B-лимфоцитах. Лиганд рецептора CD27, участвующего в долговременном выживании активированных T-лимфоцитов. Продукт гена человека CD70.