Вирус гепатита С — вирус-возбудитель гепатита С у человека и шимпанзе. РНК-содержащий вирус, относящийся к семейству Flaviviridae. Открыт в 1989 г. методом клонирования ДНК-копии вируса, вызывавшего парентеральный гепатит «ни А ни В» у инфицированных шимпанзе. Это первый вирус, идентифицированный на основании расшифровки последовательности нуклеотидов задолго до его электронно-микроскопической визуализации. Согласно классификации вирусов по Балтимору относится к классу IV. К настоящему времени этим вирусом инфицировано не менее 3 % населения Земли.
Кореце́птор — находящийся на поверхности клетки дополнительный рецептор, который связывается с сигнальной молекулой (лигандом) в дополнение к первичному рецептору. Корецепторы Т-лимфоцитов усиливают взаимодействие T-клеточного рецептора с комплексом пептид + молекула главного комплекса гистосовместимости (MHC). Корецепторы нередко используются вирусами для проникновения в клетку.
Myc, или протоонкогенный белок Myc, — фактор транскрипции, который у человека кодируется геном MYC. Myc регулирует экспрессию до 15 % всех генов, связывается с энхансерными последовательностями в ДНК (E-boxes) и усиливает активность ацетилтрансфераз гистонов. Таким образом, Myc не только является классическим примером фактора транскрипции, но и регулирует структуру хроматина, изменяя ацетилирование гистонов в участках, богатых генами, а также в некодирующих районах.
Те́терин, или костномозговой стромальный клеточный антиген 2, — мембранный белок, фактор рестрикции (ингибитор) вирусных инфекций, включая ВИЧ. Продукт гена человека BST2.
CD81 — мембранный белок из надсемейства тетраспанинов, продукт гена человека TSPAN28.
Субъединица RPABC1 ДНК-зависимой РНК-полимеразы I, II и III — белок, кодируемый у человека геном POLR2E .
Асунапревир — ингибитор фермента сериновой протеазы NS3 вируса гепатита C, II волны I поколения.
Неструктурный белок 5A, сокращённо NS5A — связывающий цинк богатый пролином гидрофильный фосфопротеин, играющий ключевую роль в репликации РНК вируса гепатита C (ВГС). Является димером без трансмембранных спиралей.
Протеаза ВИЧ-1 — ретровирусная аспартатная протеаза (ретропепсин), фермент, играющий важную роль в жизненном цикле вируса иммунодефицита человека (ВИЧ). Протеаза разрезает синтезируемые полипротеины в нужных местах, благодаря чему образуются зрелые белки вириона ВИЧ. Без протеазы вирионы ВИЧ остаются неинфективными. Таким образом, мутации в активном центре фермента или ингибирование его активности нарушают способность ВИЧ реплицировать и заражать клетки, что делает поиск ингибиторов протеазы целью множества исследований.
Белки́, зая́коренные липи́дами, или липидосвя́занные белки́ — белки клеточной мембраны, ковалентно связанные с липидами клеточной мембраны. Эти липиды вставлены в мембрану бок о бок с хвостами жирных кислот. Белки, заякоренные липидами, могут находиться с любой стороны клеточной мембраны. Таким образом, липид служит своего рода якорем, закрепляющим белок вблизи клеточной мембраны.
Ингибиторы белка NS5A относятся к классу противовирусных препаратов прямого действия. Они направлены на белок NS5A вируса гепатита C. Их развитие является кульминацией более глубокого понимания жизненного цикла вируса. Однако, их механизм действия сложен и не полностью изучен.
Неструктурный белок 3 (NS3), также известный как p-70 — неструктурный вирусный белок массой около 70 кДа. Продукт расщепления полипротеина вируса гепатита С. Треть белка близкая к N-концу действует как сериновая протеаза, остальные две трети (С-конец) — как РНК-Хеликаза (DexH/D-box) и НТФаза. N-концевая часть NS3 может являться регуляторным кофактором белка NS2.
Неструктурный белок 5B (NS5B) — белок вируса гепатита С (ВГС). Представляет собой РНК-полимеразу, его ключевая функция репликация вирусной РНК из вирусной РНК положительный нити в качестве шаблона, чтобы катализировать полимеризацию rNTP во время репликации РНК.
Неструктурный белок 4А (NS4A) — белок вируса гепатита C. Он действует как кофактор для фермента NS3. Имеет размер в 54 аминокислоты.
Неструктурный белок 4B, сокращённо NS4B — одна из разновидностей неструктурированных белков, получающихся вследствие воздействия на полипептид, состоящего из 3010 аминокислот (NCV), вирусными протеазами, вследствие которых вырабатываются антитела на белки. Размер белка 27 кДа. Белок способствует формированию мембранозной сети в процессе репликации вируса, регулирует клеточный цикл и иммунный ответ, активирует клеточные белки.
AIP — AHR-взаимодействующий белок, также известный как гомолог иммунофилина ARA9, или Х-ассоциированный белок 2 вируса гепатита В (XAP-2), который кодируется одноимённым геном AIP, локализованный на коротком плече (p-плече) 11-ой хромосомы. Белок состоит из последовательности 330 аминокислотных остатков и имеет молекулярную массу равную 37 636 Да. Относится к семейству FKBP.
Nonstop-деграда́ция — механизм контроля качества мРНК, направленный на выявление мРНК, лишённых стоп-кодона, и предотвращение их трансляции. В ходе nonstop-деградации рибосома, которая успела значительно продвинуться в сторону 3'-конца мРНК, диссоциирует, и мРНК направляется в экзосомный комплекс или к РНКазе R для дальнейшего разрушения.
Frizzled-9 (CD349) — мембранный белок из семейства рецепторов, сопряжённых с G-белком. Продукт гена человека FZD9.Относится к группе рецепторов Frizzled.
CLEC4M, или L-SIGN, — мембранный белок, лектин типа С. Продукт гена человека CLEC4M.
HAVCR1, или TIM-1 — мембранный белок, продукт гена HAVCR1. Член семейства белков TIM, которые играют критическую роль в регулировании активности иммунных клеток, в особенности в ответ на вирусную инфекцию. Семейство включает 8 генов, из которых у человека присутствуют 3: TIM-1, TIM-3 и TIM-4. Кроме этого, белок участвует в процессах аллергического ответа, астмы и толерантности к транспланту.
