Поша́говая страте́гия — поджанр стратегических игр, в которых игровой процесс состоит из последовательности фиксированных моментов времени, именуемых ходами, во время которых игроки совершают свои действия.
Биоинформа́тика — междисциплинарная область, объединяющая общую биологию, молекулярную биологию, кибернетику, генетику, химию, компьютерные науки, математику и статистику. Крупномасштабные биологические проблемы, требующие анализа больших объёмов данных, решаются биоинформатикой с вычислительной точки зрения. Биоинформатика главным образом включает в себя изучение и разработку компьютерных методов и направлена на получение, анализ, хранение, организацию и визуализацию биологических данных.
Сэр Чарльз Э́нтони Ри́чард Хо́ар — английский учёный, специализирующийся в области информатики и вычислительной техники. Наиболее известен как разработчик алгоритма «быстрой сортировки» (1960), на сегодняшний день являющегося наиболее популярным алгоритмом сортировки.
ДНК-компьютер — вычислительная система, использующая вычислительные возможности молекул ДНК.
BLAST — семейство компьютерных программ, служащих для поиска гомологов белков или нуклеиновых кислот, для которых известна первичная структура (последовательность) или её фрагмент. Используя BLAST, исследователь может сравнить имеющуюся у него последовательность с последовательностями из базы данных и найти последовательности предполагаемых гомологов. Является важнейшим инструментом для молекулярных биологов, биоинформатиков и систематиков. Программа BLAST была разработана группой учёных: Стивен Альтшуль, Уоррен Гиш, Вебб Миллер, Юджин Майерс и Дэвид Липман в системе Национальных институтов здравоохранения США. Первая публикация с описанием программы вышла в Журнале молекулярной биологии в 1990 году.
4X — жанр компьютерных и настольных игр, в которых игровой процесс строится согласно 4X модели — «изучай, расширяй, эксплуатируй, уничтожай». 4X является поджанром стратегических компьютерных игр. Впервые термин был введён Аланом Эмрихом в сентябре 1993 года при анонсировании Master of Orion в журнале Computer Gaming World. Впоследствии термин был адаптирован для описания похожих по своей концепции игр.
Computer Gaming World — американский журнал, посвящённый компьютерным играм, выходивший с 1981 по 2006 годы. Один из первых журналов, посвященных исключительно компьютерным играм и игровой индустрии.
Мно́жественное выра́внивание после́довательностей — выравнивание трёх и более биологических последовательностей, обычно белков, ДНК или РНК. В большинстве случаев предполагается, что входной набор последовательностей имеет эволюционную связь. Используя множественное выравнивание, можно оценить эволюционное происхождение последовательностей, проведя филогенетический анализ.
Выра́внивание после́довательностей — биоинформатический метод, основанный на размещении двух или более последовательностей мономеров ДНК, РНК или белков друг под другом таким образом, чтобы легко увидеть сходные участки в этих последовательностях. Сходство первичных структур двух молекул может отражать их функциональные, структурные или эволюционные взаимосвязи. Выровненные последовательности оснований нуклеотидов или аминокислот обычно представляются в виде строк матрицы. Добавляются разрывы между основаниями таким образом, чтобы одинаковые или похожие элементы были расположены в следующих друг за другом столбцах матрицы.
Spacewar! — одна из первых известных цифровых компьютерных игр. Создана Стивом Расселом при участии Мартина Греца и Уэйна Витенена, которые объединились в неформальную творческую группу под названием Hingham Institute. Эта группа в 1961 году задумала разработать игру на платформе мини-компьютера DEC PDP-1 в Массачусетском технологическом институте (МТИ). После того, как знакомый Рассела Алан Коток получил несколько подпрограмм от компании Digital Equipment Corporation (DEC) по расчёту траектории полёта космического аппарата, Рассел занялся программированием игры, а к февралю 1962 года у него была готова первая версия Spacewar!, и на это ушло примерно 200 человеко-часов работы.
UGENE — свободное биоинформационное программное обеспечение.
Система компьютерной алгебры — это прикладная программа для символьных вычислений, то есть выполнения преобразований и работы с математическими выражениями в аналитической (символьной) форме.
Михаи́л Серге́евич Гельфа́нд — российский биоинформатик. Доктор биологических наук, кандидат физико-математических наук (биофизика). Член Европейской Академии. Профессор, вице-президент по биомедицинским исследованиям Сколковского института науки и технологий. Заведовал Учебно-научным центром «Биоинформатика» в Институте проблем передачи информации имени Харкевича (ИППИ). Заместитель главного редактора газеты «Троицкий вариант — наука». Один из основателей вольного сетевого сообщества «Диссернет». Член Совета Общества научных работников. Входит в совет просветительского фонда «Эволюция». Бывший член Общественного совета при Министерстве образования и науки РФ.
Clustal — одна из самых широко используемых компьютерных программ для множественного выравнивания нуклеотидных и аминокислотных последовательностей.
Па́вел Арка́дьевич Пе́взнер — советский и американский биоинформатик, специалист в области вычислительной биологии, системной биологии, кандидат физико-математических наук, профессор Калифорнийского университета в Сан-Диего. Является членом Научного консультативного совета Института генома (Сингапур) и членом редакционной коллегии журнала PLOS Computational Biology, победителем первого конкурса мегагрантов (2010).
UniProt — открытая база данных последовательностей белков. Консорциум UniProt действует с 2003 года. Единая база данных UniProt была создана путём объединения нескольких баз. UniProt состоит из четырёх крупных баз данных и охватывает различные аспекты анализа белковых последовательностей. Многие из последовательностей стали известны в результате реализации проектов секвенирования геномов последних лет. Кроме того, база данных UniProt содержит большое количество информации о биологических функциях белков, полученной из научной литературы.
Логотип последовательностей — метод графического представления консервативности нуклеотидов или аминокислот. Логотип строится по набору выровненных последовательностей. Этот метод позволяет на одном графике отразить следующие характеристики анализируемого участка:
- консенсусную последовательность выравнивания;
- относительные частоты встречаемости элементов в каждой позиции последовательности;
- информационное содержание каждой позиции в последовательности ;
- наличие специфического локуса.
Предсказа́ние ге́нов — это определение кодирующих и регуляторных последовательностей ДНК в геноме: белковых генов и генов некодирующих РНК, промоторов, энхансеров и прочее.
Джон Коза — учёный и бывший профессор Стэнфордского университета. Пионер в использовании генетического программирования для оптимизации сложных проблем.
BioPerl — большая коллекция модулей Perl, которые облегчают разработку скриптов Perl для задач биоинформатики. BioPerl сыграл важную роль в Проекте «Геном человека».
