
Linux — семейство Unix-подобных операционных систем на базе ядра Linux, включающих тот или иной набор утилит и программ проекта GNU, и, возможно, другие компоненты. Как и ядро Linux, системы на его основе, создаются и распространяются в соответствии с моделью разработки свободного и открытого программного обеспечения. Linux-системы распространяются в основном бесплатно в виде различных дистрибутивов — в форме, готовой для установки и удобной для сопровождения и обновлений, и имеющих свой набор системных и прикладных компонентов, как свободных, так и проприетарных.

Mono — проект по созданию полноценного воплощения системы .NET Framework на базе свободного программного обеспечения. Основной разработчик проекта Mono — корпорация Xamarin, ранее - Novell. Проект возглавляет Мигель де Икаса, известный разработчик, основатель проекта GNOME. Реализации Mono существуют для следующих операционных систем: Windows, Linux, BSD, Solaris, macOS, Apple iOS, Wii. Поддерживаются платформы: s390, SPARC, PowerPC, x86/x86-64, IA-64, ARM, Alpha, MIPS, HP PA.

Mozilla Thunderbird — бесплатная кроссплатформенная свободно распространяемая с открытым кодом программа для работы с электронной почтой и группами новостей, а при установке расширения Lightning, и с календарём. Является составной частью проекта Mozilla. Поддерживает протоколы: SMTP, POP3, IMAP, NNTP, RSS. Предоставляются официальные сборки для Microsoft Windows, macOS, Linux, причём набор возможностей на всех платформах одинаков. Существуют также сторонние сборки для FreeBSD, Solaris, OpenSolaris, OS/2. Входит в установку по умолчанию в ряд дистрибутивов Linux. Поддерживает смену тем и установку расширений. Обладает функцией обучаемой фильтрации спама с использованием механизма байесовской фильтрации.

FAR Manager — консольный файловый менеджер для операционных систем семейства Microsoft Windows и Linux.

Embarcadero Delphi [дэ́лф’и], ранее Borland Delphi и CodeGear Delphi, — интегрированная среда разработки ПО для Microsoft Windows, Mac OS, iOS и Android на языке Delphi, созданная первоначально фирмой Borland и на данный момент принадлежащая и разрабатываемая Embarcadero Technologies. Embarcadero Delphi является частью пакета Embarcadero RAD Studio и поставляется в пяти редакциях: Community, Professional, Enterprise и Architect. Координирующий офис Embarcadero, ответственный за разработку Delphi, находится в Торонто, тогда как сама разработка сконцентрирована главным образом в Канаде и Испании.

Wine — свободное программное обеспечение, позволяющее пользователям UNIX-подобных операционных систем, например GNU/Linux, Apple macOS и других UNIX-подобных с поддержкой архитектур CPU x86, AMD64 исполнять 16-, 32- и 64-битные приложения, в том числе игры, созданные исключительно для Microsoft Windows, без наличия при этом установленной Microsoft Windows. Wine также предоставляет программистам библиотеку программ Winelib, при помощи которой они могут компилировать Windows-приложения для портирования их в UNIX-подобные операционные системы. Название W.I.N.E. — рекурсивный акроним и расшифровывается «Wine Is Not Emulator» — «W.I.N.E. — это не эмулятор». Имеется в виду, что Wine — это не эмулятор компьютера или виртуальная машина, как, например, qemu, VirtualBox и другие подобные им. Вместо этого Wine — это альтернативная, свободная реализация Windows API.

CrossOver — программа, позволяющая запускать многие приложения, написанные для ОС Microsoft Windows в ОС Linux и macOS, при этом наличие установленной Windows не требуется.

Cedega — коммерческий продукт, основанный на исходном коде проекта Wine, позволяющего запускать Windows-приложения в Unix-системах. Создаётся компанией TransGaming Technologies. Cedega отличается от Wine своей нацеленностью на запуск игр, написанных для Microsoft Windows, в Linux. В частности, для этого была добавлена улучшенная поддержка API DirectX. Также имеется поддержка некоторых защит от копирования, применяемых в играх. В последних версиях Cedega имеет простой графический интерфейс, позволяющий устанавливать и запускать Windows-игры, производить конфигурирование программы.

MinGW (англ. Minimalist GNU for Windows), ранее mingw32 — набор инструментов разработки программного обеспечения для создания приложений под Windows. Включает в себя компилятор, родной программный порт GNU Compiler Collection (GCC) под Windows вместе с набором свободно распространяемых библиотек импорта и заголовочных файлов для Windows API. В MinGW включены расширения для библиотеки времени выполнения Microsoft Visual C++ для поддержки функциональности C99. Поддерживает стандарт C++11.

Amarok — программа для проигрывания аудиофайлов для Linux, Mac OS X, других Unix-подобных операционных систем и Microsoft Windows. Для своей работы использует KDE (kdelibs), однако официально не входит ни в один из компонентов KDE и выпускается независимо от него.

Damn Small Linux — дистрибутив Linux на основе Debian для архитектуры x86, загружаемый с LiveCD-«визитки». Также он может быть установлен на жёсткий диск, USB Flash Drive и т. п. Создавался для использования на старых компьютерах, поэтому имеет низкие требования к процессору и оперативной памяти и маленький размер. Минимальные системные требования: ЦП — 486DX, ОЗУ — 16 МБ.

Linux XP — линейка коммерческих дистрибутивов Linux.

id Tech 3 — игровой движок, разработанный компанией id Software.
Parallels Desktop для Mac — программный продукт компании Parallels, представляющий собой решение в области виртуализации для macOS, позволяющее пользователям запускать Windows, Linux и другие операционные системы, а также программное обеспечение, написанное для этих операционных систем.

WINE@Etersoft — программный продукт, основанный на исходном коде свободного проекта Wine, предназначенный для запуска Windows-приложений на операционных системах семейства Linux и на ОС FreeBSD. Разрабатывается петербургской компанией Etersoft. WINE@Etersoft ориентирован на работу таких популярных российских приложений для бизнеса, как 1С:Предприятие, КонсультантПлюс, Гарант, КОМПАС-3D, система сдачи отчётности в электронном виде СБиС++. В отличие от обычного Wine, в нём реализована поддержка ключей защиты и работа в многопользовательском режиме.
GameMaker — один из самых популярных игровых движков, позволяющий разрабатывать приложения под множество платформ. GameMaker является серьёзным развитием его предшественника — Game Maker и главным отличием является добавление кроссплатформенности, благодаря которой, а также другим существенным доработкам, GameMaker стал мощным инструментом для профессиональной разработки. Создатель и главный разработчик первых шести версий оригинального конструктора Game Maker — Марк Овермарс, последующие версии, включая GameMaker, разрабатываются компанией YoYo Games.
Слой совместимости — программная или аппаратная прослойка (интерфейс?) для перевода системных вызовов между конкретной системой и не совместимым с ней компонентом, который изначально был создан для другой, отличающейся от данной системы.

Sega Mega Drive Classics, или Sega Genesis Classics — сборник игр для консоли Sega Mega Drive/Genesis, выпущенный Sega 1 июня 2010 года в Steam для платформ Linux, macOS и Windows. Поддерживаемые игры разделены на пять «выпусков», которые выпускались на физических носителях и через цифровую дистрибуцию.
Proton — программное обеспечение, которое позволяет программам, разработанным для Microsoft Windows, работать в операционных системах семейства Linux. Proton разработан Valve и является форком Wine. Он включает в себя множество патчей и дополнительных библиотек для улучшения производительности и совместимости с играми Windows. Сам Proton предназначен для интеграции в клиент Steam как «Steam Play», что обеспечивает бесперебойную работу Windows-игр и программного обеспечения в Steam, но его можно использовать как отдельное приложение.
Ниже представлен список известных систем управления пакетами программного обеспечения, классифицированный сперва по формату пакета, а затем по семейству операционных систем.