Rad50

Перейти к навигацииПерейти к поиску
RAD50 гомолог (S. cerevisiae)
Идентификаторы
СимволRAD50 ; NBSLD; RAD502; hRad50
Внешние IDOMIM: 604040 MGI: 109292 HomoloGene: 38092 GeneCards: Ген RAD50
Генная онтология
Функция• single-stranded DNA endodeoxyribonuclease activity

• DNA binding
• ATP-dependent DNA helicase activity
• protein binding
• ATP binding
• zinc ion binding
• 3'-5' exonuclease activity

• protein binding, bridging
Компонент клетки• nuclear chromosome, telomeric region

• nucleus
• nucleoplasm
• nucleolus
• membrane
• Mre11 complex
• site of double-strand break

• pronucleus
Биологический процесс• regulation of mitotic recombination

• telomere maintenance
• double-strand break repair via homologous recombination
• DNA catabolic process, endonucleolytic
• DNA repair
• double-strand break repair
• DNA recombination
• cellular response to DNA damage stimulus
• telomere maintenance via telomerase
• reciprocal meiotic recombination
• positive regulation of protein autophosphorylation
• DNA duplex unwinding
• positive regulation of kinase activity

• nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis
Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
Больше информации
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez1011119360
EnsemblENSG00000113522ENSMUSG00000020380
UniProtQ92878P70388
RefSeq (мРНК)NM_005732NM_009012
RefSeq (белок)NP_005723NP_033038
Локус (UCSC)Chr 5:
131.89 – 131.98 Mb		Chr 11:
53.65 – 53.71 Mb
Поиск в PubMedИскатьИскать

Белок репарации ДНК RAD50 (англ. DNA repair protein RAD50), также известный как RAD50 — белок, кодируемый у человека геном RAD50[1].

Функция

Белок, кодируемый этим геном очень похож на белок Rad50, Saccharomyces cerevisiae, участвующий в репарации двойных разрывов цепочки ДНК. Этот белок образует комплекс с MRE11 и NBS1 (также известный как Xrs2 в дрожжах). Этот комплекс MRN (комплекс MRX в дрожжах) связывается с повреждёнными концами ДНК и представляет многочисленные ферментативные активности, необходимые для репарации двойных разрывов нити присоединением негомологичного конца или гомологичной рекомбинацией. Исследования нокаутом гена мышиного гомолога Rad50 предполагают, что это важно для роста клеток и жизнеспособности. Было опубликовано два варианта транскрипта альтернативного сплайсинга Rad50, которые кодируют белки[1].

Структура

Rad50 является членом структурного семейства белков поддержания хромосом (SMC)[2]. Как и другие белки SMC, Rad50 содержит длинный внутренний биспиральных домен, который складывается обратно на себя, в результате чего N- и С-концы вместе образуют шаровидную ABC АТФазную голову домена. Rad50 может димеризовать как за счет своей головы домена, так и через цинко-связывающий димеризационный мотив на противоположном биспиральном конце, известном как «цинковый крючок»[3]. Результаты микроскопии атомных сил показывают, что в свободном комплексе NBS1 Mre11-Rad50, цинковые крючки одного димера Rad50 ассоциируются с образованием замкнутого контура, в то время как цинковые крючки оснастки, после связывания ДНК, подвергаются конформации, что, как полагают, позволяет цинковым трубкам опосредованное скрепление повреждённых концов ДНК[4].

Взаимодействия

Rad50, как было выявлено, взаимодействует с:

Эволюционная родословная

Белок Rad50 в основном изучали у эукариот. Тем не менее, недавняя работа показала, что ортологи белка Rad50 также сохраняется в дошедших до нас прокариотических архей, где они, вероятно, функционируют в гомологичной рекомбинационной репарации[16]. В гипертермофильной архее Sulfolobus acidocaldarius , белки Rad50 и Mre11 взаимодействуют и, кажется, играют активную роль в репарации повреждений ДНК, причинённых гамма-излучением[17]. Эти результаты показывают, что Rad50 эукариот может быть произошёл из наследственного белка Rad50 архей, который играл роль в гомологичной рекомбинационной репарации повреждений ДНК.

См. также

Примечания

  1. ↑ 1 2 Entrez Gene: RAD50 RAD50 homolog (S. cerevisiae). Дата обращения: 3 октября 2017. Архивировано 6 марта 2010 года.
  2. ↑ Kinoshita E., van der Linden E., Sanchez H., Wyman C. RAD50, an SMC family member with multiple roles in DNA break repair: how does ATP affect function? (англ.) // Chromosome Res. : journal. — 2009. — Vol. 17, no. 2. — P. 277—288. — doi:10.1007/s10577-008-9018-6. — PMID 19308707.
  3. ↑ Hopfner K.P., Craig L., Moncalian G., Zinkel R.A., Usui T., Owen B.A., Karcher A., Henderson B., Bodmer J.L., McMurray C.T., Carney J.P., Petrini J.H., Tainer J.A. The Rad50 zinc-hook is a structure joining Mre11 complexes in DNA recombination and repair (англ.) // Nature : journal. — 2002. — August (vol. 418, no. 6897). — P. 562—566. — doi:10.1038/nature00922. — PMID 12152085.
  4. ↑ Moreno-Herrero F., de Jager M., Dekker N.H., Kanaar R., Wyman C., Dekker C. Mesoscale conformational changes in the DNA-repair complex Rad50/Mre11/Nbs1 upon binding DNA (англ.) // Nature : journal. — 2005. — September (vol. 437, no. 7057). — P. 440—443. — doi:10.1038/nature03927. — PMID 16163361.
  5. ↑ 1 2 3 Wang Y., Cortez D., Yazdi P., Neff N., Elledge S.J., Qin J. BASC, a super complex of BRCA1-associated proteins involved in the recognition and repair of aberrant DNA structures (англ.) // Genes Dev. : journal. — 2000. — Vol. 14, no. 8. — P. 927—939. — PMID 10783165. — PMC 316544.
  6. ↑ 1 2 Chiba N., Parvin J.D. Redistribution of BRCA1 among four different protein complexes following replication blockage (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2001. — Vol. 276, no. 42. — P. 38549—38554. — doi:10.1074/jbc.M105227200. — PMID 11504724.
  7. ↑ Zhong Q., Chen C.F., Li S., Chen Y., Wang C.C., Xiao J., Chen P.L., Sharp Z.D., Lee W.H. Association of BRCA1 with the hRad50-hMre11-p95 complex and the DNA damage response (англ.) // Science : journal. — 1999. — Vol. 285, no. 5428. — P. 747—750. — doi:10.1126/science.285.5428.747. — PMID 10426999.
  8. ↑ Dolganov G.M., Maser R.S., Novikov A., Tosto L., Chong S., Bressan D.A., Petrini J.H. Human Rad50 is physically associated with human Mre11: identification of a conserved multiprotein complex implicated in recombinational DNA repair (англ.) // Mol. Cell. Biol. : journal. — 1996. — Vol. 16, no. 9. — P. 4832—4841. — PMID 8756642. — PMC 231485.
  9. ↑ 1 2 Trujillo K.M., Yuan S.S., Lee E.Y., Sung P. Nuclease activities in a complex of human recombination and DNA repair factors Rad50, Mre11, and p95 (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1998. — Vol. 273, no. 34. — P. 21447—21450. — doi:10.1074/jbc.273.34.21447. — PMID 9705271.
  10. ↑ Goedecke W., Eijpe M., Offenberg H.H., van Aalderen M., Heyting C. Mre11 and Ku70 interact in somatic cells, but are differentially expressed in early meiosis (англ.) // Nat. Genet. : journal. — 1999. — Vol. 23, no. 2. — P. 194—198. — doi:10.1038/13821. — PMID 10508516.
  11. ↑ Cerosaletti K.M., Concannon P. Nibrin forkhead-associated domain and breast cancer C-terminal domain are both required for nuclear focus formation and phosphorylation (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2003. — Vol. 278, no. 24. — P. 21944—21951. — doi:10.1074/jbc.M211689200. — PMID 12679336.
  12. ↑ Desai-Mehta A., Cerosaletti K.M., Concannon P. Distinct functional domains of nibrin mediate Mre11 binding, focus formation, and nuclear localization (англ.) // Mol. Cell. Biol. : journal. — 2001. — Vol. 21, no. 6. — P. 2184—2191. — doi:10.1128/MCB.21.6.2184-2191.2001. — PMID 11238951. — PMC 86852.
  13. ↑ Xiao J., Liu C.C., Chen P.L., Lee W.H. RINT-1, a novel Rad50-interacting protein, participates in radiation-induced G(2)/M checkpoint control (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2001. — Vol. 276, no. 9. — P. 6105—6111. — doi:10.1074/jbc.M008893200. — PMID 11096100.
  14. ↑ 1 2 O'Connor M.S., Safari A., Liu D., Qin J., Songyang Z. The human Rap1 protein complex and modulation of telomere length (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2004. — Vol. 279, no. 27. — P. 28585—28591. — doi:10.1074/jbc.M312913200. — PMID 15100233.
  15. ↑ Zhu X.D., Küster B., Mann M., Petrini J.H., de Lange T. Cell-cycle-regulated association of RAD50/MRE11/NBS1 with TRF2 and human telomeres (англ.) // Nat. Genet. : journal. — 2000. — Vol. 25, no. 3. — P. 347—352. — doi:10.1038/77139. — PMID 10888888.
  16. ↑ White M.F. Homologous recombination in the archaea: the means justify the ends (англ.) // Biochem. Soc. Trans.[англ.] : journal. — 2011. — January (vol. 39, no. 1). — P. 15—9. — doi:10.1042/BST0390015. — PMID 21265740.
  17. ↑ Quaiser A., Constantinesco F., White M.F., Forterre P., Elie C. The Mre11 protein interacts with both Rad50 and the HerA bipolar helicase and is recruited to DNA following gamma irradiation in the archaeon Sulfolobus acidocaldarius (англ.) // BMC Mol. Biol. : journal. — 2008. — Vol. 9. — P. 25. — doi:10.1186/1471-2199-9-25. — PMID 18294364. — PMC 2288612.

Литература