Шифр КФ, или код фермента, англ. EC number — классификационный номер фермента по международной иерархической классификации. Принятая система классифицирует ферменты по группам и индексирует индивидуальные ферменты, что важно для стандартизации исследований.
Подсемейство Астровые — одно из двух или одно примерно из двенадцати подсемейств семейства Астровые (Asteraceae).
Raoultella planticola (лат.) — вид бактерий из семейства энтеробактерий, типовой в роде Raoultella. Типовым штаммом является V-236 = ATCC 33531= CCUG 15718 = CDC 4245-72 = CIP 100751 = DSM 3069 = IFO 14939 = JCM 7251 = NCTC 12998. Это грамотрицательная факультативно анаэробная палочковидная бактерия, образующая капсулу, благодаря которой длительно сохраняется в окружающей среде и устойчива к внешним воздействием.
Зелёные растения — подцарство эукариот из царства растений.
Rhodospirillum (лат.) — род бактерий из семейства Rhodospirillaceae класса альфа-протобактерий.
LAMP3 — гликопротеин лизосомальной мембраны из семейства белков LAMP. Представлен в лимфоидных органах и в дендритных клетках.
Zavarzinia compransoris (лат.) — вид грамотрицательных почвенных бактерий из семейства Acetobacteraceae класса альфа-протобактерий, типовой и единственный в роде Zavarzinia. Род назван в честь русского микробиолога Георгия Александровича Заварзина.
CD48 — мембранный белок, который у человека кодируется геном CD48. CD48 относится к подсемейству CD2 иммуноглобулинового суперсемейства и является лигандом иммунорецепторов CD84, CD150, CD229 и CD244. Этот белок присутствует на поверхности некоторых гемопоэтических клеток, в частности B-лимфобластов. CD48 принимает участие в реакциях врождённого иммунитета и аллергического воспаления.
UniProt — открытая база данных последовательностей белков. Консорциум UniProt действует с 2003 года. Единая база данных UniProt была создана путём объединения нескольких баз. UniProt состоит из четырёх крупных баз данных и охватывает различные аспекты анализа белковых последовательностей. Многие из последовательностей стали известны в результате реализации проектов секвенирования геномов последних лет. Кроме того, база данных UniProt содержит большое количество информации о биологических функциях белков, полученной из научной литературы.
Pfam — база данных семейств белковых доменов. Каждое семейство в ней представлено множественным выравниванием фрагментов белковых последовательностей и скрытой марковской моделью (HMM). На март 2021 года в Pfam содержалось 19 179 записей (семейств), объединённых в 645 кланов.
Rhodopseudomonas (лат.) — род грамотрицательных фототрофных бактерий из семейства Bradyrhizobiaceae. Встречаются в различных водных и наземных экосистемах: почве рисовых чеков, пресноводных континентальных и морских водоёмах. Вещества, выделяемые бактериями этого рада, способны повышать устойчивость к токсинам и стимулировать ростовые процессы у растений. Продуктами метаболизма являются также водород и полигидроксибутират
Blastobácter henrícii (лат.) — вид бактерий из семейства Bradyrhizobiaceae, типовой для рода Blastobacter. Видовой эпитет дан в честь американского микробиолога Артура Тротвайна Хенрици, который, возможно, был первым учёным, увидевшим бактерии этого рода.
Afipia (лат.) — род бактерий из семейства Bradyrhizobiaceae.
Bosea (лат.) — род бактерий из семейства Bradyrhizobiaceae.
Microvirga (лат.) — род бактерий из семейства Methylobacteriaceae. Сюда же был переклассифцирован род Balneimonas.
Salinarimonas (лат.) — род бактерий из семейства Bradyrhizobiaceae
Pacmanvirus A23 (лат.), также известный как Pacmanvirus — гигантский вирус, который морфологически и генетически близок к двум другим гигантским вирусам, Faustovirus и Kaumoebavirus, а также вирусам семейства Asfarviridae. Свое название эти вирусы получили за форму капсида, наблюдаемую при негативном окрашивании в электронный микроскоп: он похож на главного героя одноимённой видеоигры Pac-Man.
Кодирующая область, или кодирующая последовательность — последовательность нуклеотидов в ДНК или РНК, которая соответствует последовательности аминокислот в белке. Типичная CDS начинается со старт-кодона ATG и заканчивается одним из стоп-кодонов. CDS может быть подмножеством открытой рамки считывания (ORF). У эукариот предсказание областей CDS в геномной последовательности затруднено из-за низкого процента генома, отведённого под CDS, и прерывания областей CDS интронами.
Gluconacetobacter diazotrophicus (лат.) — вид бактерий из семейства Acetobacteraceae, первоначально изолированный из тканей корней и стеблей сахарного тростника. Считается, что этот вид отвечают за фиксацию атмосферного азота у сахарного тростника. Бактерия была найдена и на других богатых сахарозoй растениях, размножающихся вегетативным путём, таких как сладкий картофель и слоновая трава, а также на различных насекомых, обитающих на этих растениях.
THADA – белок, кодируемый одноименным геном, расположенным у людей на коротком плече 2-й хромосомы. Длина полипептидной цепи белка составляет 1 953 аминокислот, а молекулярная масса — 219 607.