SNTA1

Перейти к навигацииПерейти к поиску
SNTA1
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

1QAV, 1Z86, 1Z87, 2ADZ, 2PDZ, 4HOP

Идентификаторы
ПсевдонимыSNTA1, LQT12, SNT1, TACIP1, dJ1187J4.5, Syntrophin, alpha 1, syntrophin alpha 1
Внешние IDOMIM: 601017 MGI: 101772 HomoloGene: 2331 GeneCards: SNTA1
Расположение гена (человек)
20-я хромосома человека
Хр.20-я хромосома человека[1]
20-я хромосома человека
Расположение в геноме SNTA1
Расположение в геноме SNTA1
Локус20q11.21Начало33,407,957 bp[1]
Конец33,443,763 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
2-я хромосома мыши
Хр.2-я хромосома мыши[2]
2-я хромосома мыши
Расположение в геноме SNTA1
Расположение в геноме SNTA1
Локус2 H1|2 76.52 cMНачало154,218,233 bp[2]
Конец154,250,019 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
Наибольшая экспрессия в
Дополнительные справочные данные
BioGPS
Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

6640

20648

Ensembl

ENSG00000101400

ENSMUSG00000027488

UniProt

Q13424

Q61234

RefSeq (мРНК)

NM_003098

NM_009228

RefSeq (белок)

NP_003089

NP_033254

Локус (UCSC)Chr 20: 33.41 – 33.44 MbChr 2: 154.22 – 154.25 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

SNTA1 (англ. Syntrophin alpha 1) — белок, который кодируется одноимённым геном, расположенным у людей на коротком плече 20-й хромосомы.[5] Длина полипептидной цепи белка составляет 505 аминокислот, а молекулярная масса — 53 895[6].

Кодируемый геном белок по функции принадлежит к фосфопротеинам. Задействован в таком биологическом процессе как альтернативный сплайсинг. Белок имеет сайт для связывания с молекулой актина, молекулой кальмодулина, ионом кальция. Локализован в клеточной мембране, цитоплазме, цитоскелете, мембране, клеточных контактах.

Литература

  • Castello A., Brocheriou V., Chafey P., Kahn A., Gilgenkrantz H. Characterization of the dystrophin-syntrophin interaction using the two-hybrid system in yeast. FEBS Lett. 1996 г., стр. 124—128; volume=383. PMID 8612778 doi:10.1016/0014-5793(96)00214-1
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 2004 г., стр. 2121—2127; volume=14. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
  • Fernandez-Larrea J., Merlos-Suarez A., Urena J.M., Baselga J., Arribas J. A role for a PDZ protein in the early secretory pathway for the targeting of proTGF-alpha to the cell surface. Mol. Cell. 1999 г., стр. 423—433; volume=3. PMID 10230395 doi:10.1016/S1097-2765(00)80470-0
  • Olalla L., Aledo J.C., Bannenberg G., Marquez J. The C-terminus of human glutaminase L mediates association with PDZ domain-containing proteins. FEBS Lett. 2001 г., стр. 116—122; volume=488. PMID 11163757 doi:10.1016/S0014-5793(00)02373-5

Примечания

  1. ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000101400 - Ensembl, May 2017
  2. ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000027488 - Ensembl, May 2017
  3. ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11167 (англ.). Дата обращения: 12 сентября 2017. Архивировано 27 июля 2018 года.
  6. ↑ UniProt, Q13424 (англ.). Дата обращения: 12 сентября 2017. Архивировано 26 сентября 2017 года.

См. также