«Let It Be… Naked» — альтернативный вариант альбома «Let It Be» 1970 года, созданный из оригинальных записей «The Beatles». Диск издан в ноябре 2003 года. В новом альбоме изменён трек-лист, а новые версии песен включают как исправление ошибок в цифровом виде, так и новые аранжировки некоторых песен. «Maggie Mae» и «Dig It» были заменены песней «Don’t Let Me Down». Бонус-диск «Fly on the Wall» содержит 20-минутную запись рабочих дублей и диалогов, записанных во время работы в студии. Автором идеи выступил Пол Маккартни; Джордж Харрисон успел выразить проекту своё одобрение.
«Hold Me Tight» — песня группы «Битлз», вошедшая в альбом With the Beatles. Изначально песня записывалась ещё для альбома Please Please Me, но в итоге не была для него отобрана; при работе над вторым альбомом группа записала песню заново.
«I’m a Loser» — песня группы «Битлз», вошедшая в четвёртый британский альбом группы Beatles for Sale и в американский альбом Beatles '65. Песня была написана Джоном Ленноном, авторство приписано Ленонну и Маккартни. До того, как Леннон написал композицию «I Feel Fine», песню «I’m a Loser» намеревались выпустить в виде сингла.
«Baby’s in Black» — песня группы «Битлз», написанная совместно Джоном Ленноном и Полом Маккартни и вошедшая в альбомы Beatles for Sale и Beatles '65.
«Every Little Thing» — песня, написанная Полом Маккартни и вышедшая на четвёртом британском альбоме «Битлз» Beatles for Sale. В США песня вышла на альбоме Beatles VI.
«Getting Better» — песня, написанная большей частью Полом Маккартни с небольшой помощью Джона Леннона при работе над текстом. Композиция вошла в альбом Sgt. Pepper’s Lonely Hearts Club Band.
«This Boy» — песня группы The Beatles. Выпущена 29 ноября 1963 лейблом Parlophone на стороне «Б» сингла «I Want to Hold Your Hand». The Beatles впервые исполнили песню на концерте 16 февраля 1964, во время своего второго выступления в США на «Шоу Эда Салливана». Вошла как третий трек на первой стороне выпущенного в Америке альбома Meet The Beatles!. После ремастеринга, проведённого звукорежиссёром и продюсером The Beatles Джорджем Мартином для издания на CD-диске, «This Boy» была выпущена в 1988 на сборнике Past Masters, Volume One. 9 сентября 2009 была переиздана на комплекте из двух CD Past Masters, как часть ремастированного лейблом EMI полного издания всего каталога записей The Beatles; вошла в соответствующих версиях в бокс-сеты этого издания — The Beatles Stereo Box Set и The Beatles in Mono.
«Why Don’t We Do It in the Road?» — песня группы «Битлз» из их одноимённого двойного альбома. Песня была написана и исполнена Полом Маккартни.
«Only a Northern Song» — песня, написанная Джорджем Харрисоном и исполненная группой «Битлз». Песня была записана во время сессий, посвящённых альбому Sgt. Pepper's Lonely Hearts Club Band, однако была выпущена на альбоме Yellow Submarine.
«Mean Mr. Mustard» — песня группы «Битлз», написанная Джоном Ленноном. Песня была записана как единое целое с песней «Sun King», вместе с которой она входит в состав длинного попурри на второй стороне альбома Abbey Road.
«She Came In Through the Bathroom Window» — песня группы «Битлз», написанная Полом Маккартни. Песня входит в состав длинного попурри со второй стороны альбома Abbey Road и звучит сразу после предыдущей композиции «Polythene Pam». Песня является заключительной в череде композиций, звучащих на альбоме без перерыва ; по её окончании имеется небольшая пауза, после которой звучит следующая песня попурри, «Golden Slumbers».
«Carry That Weight» — песня группы «Битлз», написанная Полом Маккартни, и часть длинной музыкальной «эстафеты» со второй стороны альбома Abbey Road. Песня является одной из немногих песен «Битлз», вокальные партии в которой исполняли все четыре участника группы. Композиция записывалась единым фрагментом вместе с предшествующей песней «Golden Slumbers».
«Two of Us» — песня группы «Битлз», написанная Полом Маккартни. Песня была выпущена на альбоме Let It Be; несколько по-другому аранжированные или смикшированные версии песни позднее вошли в альбомы-сборники Anthology 3 и Let It Be… Naked. Название песни было использовано в названии фильма «Двое из нас» о вымышленном воссоединении Маккартни и Леннона в 1976 году.
«One After 909» — песня группы «Битлз», вышедшая на альбоме Let It Be. Песня была написана в основном Джоном Ленноном при небольшом участии Пола Маккартни и является одной из самых первых совместных композиций этих авторов. Версия песни, вошедшая в альбом, была записана во время живого концерта группы на крыше «Apple Studios» 30 января 1969 года, хотя попытки записать эту песню предпринимались и раньше, в связи с чем существует множество различных вариантов песни.
«If You’ve Got Trouble» — песня группы «Битлз», написанная Ленноном и Маккартни и записанная группой 18 февраля 1965 года. Изначально планировалось, что песня войдёт в альбом Help!, однако группа осталась неудовлетворена записью, и в альбом в результате вошла песня «Act Naturally». Песня «If You’ve Got Trouble» оставалась неопубликованной до 1996 года, когда она была выпущена на альбоме-сборнике Anthology 2.
«Come and Get It» — песня, написанная Полом Маккартни для фильма «Чудотворец» (1969) и ставшая известной благодаря её исполнению группой Badfinger.
«Not Guilty» — песня, написанная Джорджем Харрисоном и выпущенная на его сольном альбоме George Harrison в 1979 году. Песня также известна в исполнении группы «Битлз»; версия, записанная группой, вошла в состав альбома Anthology 3 (1996).
«Junk» — песня, написанная в 1968 году Полом Маккартни во время его пребывания в Индии. Несмотря на то, что группа рассматривала возможность записи этой песни для «Белого альбома», в итоге песня была впервые опубликована на дебютном сольном альбоме Маккартни в 1970 году.
«What’s the New Mary Jane» — песня, написанная Джоном Ленноном и записанная группой «Битлз». Изначально песня планировалась к включению в «Белый альбом» группы, однако не вошла в него и была впервые официально опубликована лишь в 1996 году на альбоме-сборнике Anthology 3.
«Step Inside Love» — песня, написанная Полом Маккартни в 1967 году для Силлы Блэк в качестве музыкальной темы для её телевизионного шоу Cilla, впервые вышедшего в эфир 30 января 1968 года.