Прокарио́ты, или доя́дерные — одноклеточные живые организмы, не обладающие оформленным клеточным ядром и другими внутренними мембранными органеллами.
Бакте́рии — домен прокариотических микроорганизмов. Бактерии обычно достигают нескольких микрометров в длину, их клетки могут иметь разнообразную форму: от шарообразной до палочковидной и спиралевидной. Бактерии — одна из первых форм жизни на Земле и встречаются почти во всех земных местообитаниях. Они населяют почву, пресные и морские водоёмы, кислые горячие источники, радиоактивные отходы и глубинные слои земной коры. Бактерии часто являются симбионтами и паразитами растений и животных. Большинство бактерий к настоящему времени не описано, и представители лишь половины отделов бактерий могут быть выращены в лаборатории. Бактерии изучает наука бактериология — раздел микробиологии.
Грамотрица́тельные бакте́рии — бактерии, которые не окрашиваются кристаллическим фиолетовым при использовании окраски микроорганизмов по методу окрашивания по Граму. В отличие от грамположительных бактерий, которые сохраняют фиолетовую окраску даже после промывания обесцвечивающим растворителем (спирт), грамотрицательные полностью обесцвечиваются. После промывания растворителем при окрашивании по Граму добавляется контрастный краситель, который окрашивает все грамотрицательные бактерии в красный или розовый цвет. Это происходит из-за относительно небольшой толщины клеточной стенки. Сам по себе тест полезен при классификации бактерий и разделении их на две группы относительно строения их клеточной стенки. Из-за своей более мощной и непроницаемой клеточной стенки грамотрицательные бактерии более устойчивы к антителам, чем грамположительные.
Лактобаци́ллы — род грамположительных факультативно анаэробных или микроаэрофильных бактерий семейства Lactobacillaceae.
Протеобактерии — наиболее многочисленная группа бактерий — 1534 вида или примерно треть от всех известных видов бактерий.
Deinococcus-Thermus (лат.) — малочисленный тип бактерий, единственный класс которого, Deinococci, включает два порядка: Deinococcales, куда входит один из самых радиорезистентных организмов в мире Deinococcus radiodurans, и Thermales, куда входит Thermus aquaticus, известный своей Taq-полимеразой, использующейся в ПЦР, и другими термостабильными ферментами.
Болезнь Уиппла — редкое заболевание кишечника инфекционной природы с разнообразными клиническими проявлениями. Впервые описано американским патологоанатомом Джорджем Уипплом в 1907 году, наблюдавшим в аутопсийном материале выраженное увеличение мезентериальных лимфатических узлов в сочетании с воспалением серозных оболочек. При гистологическом исследовании кишечника и лимфоузлов им были выявлены множественные отложения липидов и большое количество макрофагов, содержащих аргирофильные палочкообразные структуры. Автор предположил, что в основе заболевания лежит нарушение метаболизма жира, которое он предложил назвать «интестинальной липодистрофией».
Лак-де-Мело́ — ледниковое озеро во Франции, на острове Корсика. Находится в центральной части острова, в десяти километрах от города Корте.
Экскаваты — большая группа протистов. К данной группе принадлежит множество разнообразных видов: свободно живущих, симбиотических и паразитических, в том числе некоторые важные виды паразитов человека.
Neomura — клада, состоящая из двух доменов: Archaea и Eukaryota.
Bradyrhizobium jicamae (лат.) — грамотрицательная, строго аэробная бактерия из рода Bradyrhizobium, были выделены из клубеньков растения Pachyrhizus erosus в Гондурасе, название происходит от ацтекского названия этого растения.
Пангено́м, также супрагеном — совокупность всех генов рассматриваемой группы организмов, для которой возможно генетическое разнообразие между близкородственными штаммами или экотипами. Пангеном объединяет набор генов всех штаммов, составляющих кладу: вид, род или таксон более высокого порядка. Традиционно понятие пангенома применяется к видам бактерий и архей.
Aeromicrobium (лат.) — род актинобактерий из семейства Nocardioidaceae порядка Propionibacteriales. Это грамположительные хемоорганотрофные аэробные мелкие бактерии формой от бацилл до кокков со средним диаметром в 0,3—0,6 мкм. У представителей рода наблюдается выраженный цикл роста от бациллы до кокка. Не образуют эндоспор. Aeromicrobium бывают как неподвижными, так и подвижными. Обмен веществ данных бактерий преимущественно дыхательный. Колонии непигментированные, их цвет варьирует от жёлтого или бежевого до янтарно-бежевого. В основном каталазоположительные, но иногда может встречаться каталазоотрицательная реакция. Вырабатывают кислоты из некоторых углеводов окислительным путём. Встречаются в наземных и водных средах и могут быть связаны с растениями и животными, в том числе с людьми.
Aeromicrobium alkaliterrae (лат.) — вид неподвижных грамположительных хемоорганотрофных аэробных бактерий из семейства Nocardioidaceae порядка актиномицетов. Типовой штамм KSL-107ᵀ был извлечён из щелочной почвы в Кванчуне, Корея.
Aeromicrobium camelliae (лат.) — вид неподвижных грамположительных хемоорганотрофных аэробных бактерий из семейства Nocardioidaceae порядка актиномицетов. Типовой штамм YS17T был выделен из созревшего образца чая пуэр, полученного от производителя из провинции Юньнань, Китай. Достигают в длину 0,9—1,6 мкм и 0,3—0,5 мкм в ширину. Являются оскидазоположительными и каталазоположительными бактериями. Колонии становятся выпуклыми, округлыми, гладкими, цельными и жёлто-пигментированными, диаметром около 1 мм, после культивирования на триптиказном соевом агаре при 30 °С в течение 48 часов. Рост происходит между 15 и 50 °C и при водородном показателе, соответствующем 5,5—10,5, при концентрации хлорида натрия в диапазоне от 0 до 11 % на единицу объёма.
Aeromicrobium choanae (лат.) — вид неподвижных грамположительных хемоорганотрофных аэробных бактерий из семейства Nocardioidaceae порядка актиномицетов. Типовой штамм 9H-4T был выделен из хоаны птицы садовой славки. Представляют собой кокки размером 1,5 мкм. Являются оскидазоположительными и каталазоположительными бактериями. Не образуют спор. Через 4 дня культивирования на агар-агаровой среде LB клетки образуют круглые тёмно-желтые колонии, диаметр которых составляет 1,8—2 мм. Рост происходит при 8—39 °C и водородном показателе, соответствующем 6—10, оптимальный рост — при 29—31 °С и водородном показателе, соответствующем 7. Выдерживают до 5 % хлорида натрия на единицу объёма.
Aeromicrobium ginsengisoli (лат.) — вид неподвижных грамположительных хемоорганотрофных аэробных бактерий формы кокков из семейства Nocardioidaceae порядка актиномицетов. Типовой штамм Gsoil 098T был выделен из женьшеньевой почвы из Тэджона, Республика Корея. После культивирования на питательном агаре R2A (Difco) в течение 5 дней при 30 °С достигают размера 0,5–1,2×0,3—0,4 мкм, колонии белые и округлые. Являются оксидазоположительными и каталазоотрицательными бактериями. Оптимальный рост происходит при 30 °C и pH = 7, с диапазоном роста водородного показателя в 5—8,5. Оптимальная для роста концентрация соли составляет 3 %, причём при концентрация выше 4 % рост идёт слабо.
Cutibacterium acnes (лат.) — вид актинобактерий из семейства Propionibacteriaceae порядка Propionibacteriales.
Thiothrix (лат.) — это род нитчатых сероокисляющих бактерий, родственный родам Beggiatoa и Thioploca. Они обычно грамотрицательные, клетки их палочковидной формы. Они образуют прикрепленные к субстрату многоклеточные нити с гонидиями на свободном конце. Вершинные гонидии обладают скользящей подвижностью. Розетки филаментов образуются не всегда, но являются типичными. Сера откладывается в складках клеточной мембраны.
Faecalibacterium (лат.) — род бактерий из семейства Oscillospiraceae порядка Eubacteriales. Одна из наиболее многочисленных и важных комменсальных групп бактерий микрофлоры кишечника человека. Эти бактерии не образуют спор и неподвижны.