
Сту́пинский райо́н — административно-территориальная единица (район) и одноимённое муниципальное образование, существовавшие до июня-июля 2017 года в Московской области России.

Ма́лино — посёлок городского типа в Ступинском районе Московской области России; крупнейший населённый пункт муниципального образования «Городское поселение Малино».

Мартыновское — село в городском округе Ступино Московской области России. До 2017 года входило в состав сельского поселения Аксиньинское, до 2006 года — в состав Большеалексеевского сельского округа).
Щапово — село в Ступинском районе Московской области в составе Аксиньинского сельского поселения. Щапово на 2015 год, фактически, дачный посёлок: при 85 жителях в селе 5 улиц, 1 переулок и 3 садовых товарищества. Через село проходит региональная автодорога Панино — Малино, Щапово связано автобусным сообщением с Москвой и соседними населёнными пунктами. В селе находится Троицкая церковь 1765 года постройки с колокольней 1900 года работы архитектора Струкова, памятник архитектуры федерального значения.

Верховлянь — село в Ступинском районе Московской области в составе Леонтьевского сельского поселения. В Верховляни на 2015 год одна улица и 2 переулка. В Верховляни находится полуразрушенная Церковь Рождества Пресвятой Богородицы конца XIX века постройки.
Ивановское — село в Ступинском районе Московской области в составе Семёновского сельского поселения. На 2015 год в Ивановском 14 улиц, 8 переулков и 2 садовых товарищества. Село известно с XVII века, в Ивановском находится церковь Рождества Иоанна Предтечи, 1829—1833 годов постройки архитектора Жилярди с прилегающими строениями, всё — памятники архитектуры федерального значения. Работает средняя школа, село связано автобусным сообщением с соседними населёнными пунктами.

Хатунь — село в Ступинском районе Московской области в составе Семёновского сельского поселения.
Каменищи — деревня в Ступинском районе Московской области в составе Семёновского сельского поселения. На 2016 год в Каменищах 4 улицы и 1 тупик. Впервые в исторических документах селение упоминается в 1339 году. В деревне, с XVII века, стояла церковь Рождества Христова, вначале деревянная, на месте которой в 1873—1882 годах была возведена каменная, закрытая в советские годы. В настоящее время восстанавливается, памятник архитектуры местного значения. На деревенском кладбище в конце XIX века был сооружён кирпичный часовенный столб.
Старая Ситня — село в Ступинском районе Московской области в составе Городского поселения Ступино. На 2016 год в Старой Ситне 14 улиц, 2 переулка и 7 садовых товариществ. Впервые в исторических документах упоминается в 1577 году, как половинка села Старого на речке Ситне, в 1627 году — как полсела Старого Ситны. В селе в середине XVIII века ротмистром Я. А. Татищевым была основана усадьба, от которой сохранились остатки регулярного парка, от которой сохранилась церковь Рождества Богородицы, в стиле елизаветинского барокко, построенная в 1767 году, памятник архитектуры федерального значения.
Кременье — село в Ступинском районе Московской области в составе Городского поселения Ступино. На 2016 год в Кременье 2 улицы и 1 переулок. Село связано автобусным сообщением с городами Ступино и Озёры. Впервые в исторических документах упоминается в 1578—1579 годах, как урочище Кременье. В селе, во 2-й половине XVIII века, была построена деревянная однокупольная церковь Рождества Пресвятой Богородицы в стиле классицизма, сгоревшая в 1970-е годы, с 2006 года восстанавливаемая и освящёная в 2012 году.

Вихорна — село в Ступинском районе Московской области в составе Городского поселения Ступино. На 2016 год в Вихорне 1 улица — Речная. Впервые в исторических документах упоминается в 1401 году. В Вихорне действует церковь Рождества Пресвятой Богородицы 1860-х — 1870-х годов постройки.
Девяткино — деревня в Ступинском районе Московской области в составе Городского поселения Малино. На 2016 год в Девяткино 6 улиц. До 2002 года Девяткино называлось деревней отделения совхоза 9-го Профсъезда.
Кошелевка — село в Ступинском районе Московской области в составе Городского поселения Малино.

Хонятино — село в Ступинском районе Московской области России в составе городского поселения Малино.

Бортниково — село в Ступинском районе Московской области в составе городского поселения Малино. На 2016 год в Бортниково 3 улицы и 1 садоводческое товарищество. Село связано автобусным сообщением с городами Малино, Михнево и соседними населёнными пунктами.
Васильевское — село в Ступинском районе Московской области в составе Городского поселения Малино. На 2016 год Васильевское, фактически, дачный посёлок — при 37 жителях в селе 5 улиц и 4 садовых товарищества. Село связано автобусным сообщением с городом Малино и соседними населёнными пунктами.
Дубнево — деревня в Ступинском районе Московской области в составе Городского поселения Малино. На 2016 год в Дубнево 4 улицы и 1 переулок. Впервые в исторических документах селение упоминается в 1577 году, как сельцо Дубнево на речке на Дубенке, деревня связана автобусным сообщением с райцентром и соседними населёнными пунктами.

Сотниково — село в Ступинском районе Московской области в составе Городского поселения Малино. На 2016 год в Сотниково 2 улицы — Железнодорожная и Просторная и 1 садовое товарищество, деревня связана автобусным сообщением с райцентром и соседними населёнными пунктами. Впервые в исторических документах селение упоминается в 1577 году.

Липитино — село в Ступинском районе Московской области в составе Городского поселения Малино. На 2016 год в Липитино 8 улиц, 2 переулка и 1 садовое товарищество. Село связано автобусным сообщением с городом Малино и соседними населёнными пунктами, впервые в исторических документах упоминается в писцовой книге 1577 года, уже как село Липетино.
Березнецовский сельский округ — упразднённая административно-территориальная единица, существовавшая на территории Ступинского района Московской области в 1994—2006 годах.