
Котло́вка — река в Юго-Западном административном округе Москвы, третий по величине в городе правый приток Москвы-реки. Частично заключена в подземный коллектор, в открытом русле протекает в среднем течении. По правому берегу Котловки довольно далеко от верховья располагалось село Зюзино, возле устья — село Котёл, а позднее — деревни Верхние- и Нижние Котлы. С 1991 года фрагмент долины Котловки, который примыкает к Коробковскому саду, имеет статус памятника природы регионального значения.
Купание в реке запрещено. Котловка и такие реки, как Яуза, Филька и Пресня, относятся к одним из самых загрязнённых рек Москвы, так как в них многократно превышены предельно допустимые концентрации содержания нефтепродуктов, фенолов, хлоридов и солей тяжёлых металлов.

Ка́менка — река в Северо-Восточном административном округе Москвы, правый приток Яузы. Частично заключена в подземный коллектор. Название Каменка характерно для рек с каменистым руслом. К югу от улицы Академика Комарова по правому берегу реки находился Кашёнкин луг, от которого Каменка получила название Кашенка. Приустьевый участок Каменки является прежним руслом Яузы.

Ра́менка — река в Юго-Западном административном округе Москвы, крупнейший правый приток Сетуни. Частично заключена в подземный коллектор. Часть долины реки от Парка 50-летия Октября до улицы Раменки и от Мичуринского проспекта до устья в 1991 году получила статус особо охраняемой природной территории и была объявлена памятником природы. На берегах реки находились деревни Раменки, Матвеевское, Гладышево и Каменная Плотина, село Воронцово, сельцо Шатилово, а также группы курганов вятичей. Вода Раменки загрязнена хлоридами и нефтепродуктами.

Жу́жа — река в районах Нагатино-Садовники и Нагатинский Затон Южного административного округа Москвы, правый приток Москвы-реки. Речное русло канализировано более чем на 90 %. Правым притоком реки является ручей Савкин овраг.
Нижний Богоро́дский ручей — малая река в районе Богородское Восточного административного округа города Москвы, левый приток реки Яузы. По состоянию на начало 2018 года заключена в подземный коллектор. Длина реки с временным водотоком в верховьях составляет 1,7 км, площадь водосборного бассейна — 1,5 км².
Бояко́в овра́г (Буяков овраг) — ручей в Южном административном округе Москвы, правый приток реки Городни. Своё название получил от фамилии Буяков.
Большой Носков ручей (Носко́вка) — малая река в районе Капотня Юго-Восточного административного округа Москвы, левый приток Москвы-реки. Его длина составляет 2 км, в открытом русле — 0,4 км. Площадь водосборного бассейна — 2 км². По состоянию на начало 2018 года заключен в подземный коллектор, верховья засыпаны. Название реки происходит от фамилии Носков.
Богоя́вленский руче́й — малая река в районе Марфино Северо-восточного административного округа Москвы, нижний правый приток реки Лихоборки. Заключён в подземный коллектор диаметром 1,5 метра.
Воро́нинский овраг (Воронинский ручей) — малая река в районе Тёплый Стан Юго-Западного административного округа Москвы, левый приток Очаковки. Своё название получил от близлежащей деревни Воронино.
Дани́ловский ручей (Дани́ловка, Худе́ница) — малая река Южного административного округа Москвы в бывшей Даниловской слободе, правый приток Москвы-реки. Своё название получил от Данилова монастыря, вдоль которого проходил водоток. Гидроним «Худеница» возник по урочищу, которое располагалось на этой территории. По состоянию на начало 2018 года заключён в подземный коллектор.
Давы́дковский ручей — малая река в районе Фили-Давыдково Западного административного округа Москвы, левый приток Сетуни. Назван в честь деревни Давыдково, которая находилась на правом берегу ручья. На левом берегу расположена Кунцевская дача.
Заха́рковский овраг — бывшая малая река в районе Южное Тушино Северо-Западного административного округа Москвы, правый приток Химки на южной границе Захарковского сада. По состоянию на начало 2018 года ручей сохранился в виде небольшого залива Химкинского водохранилища напротив Северного речного вокзала. Вдоль Химкинского бульвара заключён в подземный коллектор. Своё название получил от деревни Захарково.
Ко́птевский ручей — малая река в районах Коптево и Тимирязевский Северного административного округа Москвы, левый приток Жабенки. Устье расположено в Петровско-Разумовском заказнике. Название происходит от деревни Коптево. По состоянию на начало 2018 года заключён в подземный коллектор, низовья сохранились в виде залива Большого Садового пруда.
Котляко́вский ручей — малая река в районе Москворечье-Сабурово Южного административного округа Москвы, левый приток Чертановки. Название происходит от деревни Котляково. По состоянию на начало 2018 года ручей заключён в подземный коллектор, его долина засыпана, местность застроена промышленной зоной.
Лео́новский ручей — малая река в районах Свиблово и Ростокино Северо-Восточного административного округа Москвы, левый приток Яузы. Длина реки составляет 2,6 км. Первый гидроним произошёл от села и усадьбы Леоново, второй — от урочища Высково. Леоновским ручьём ошибочно называли реку Будайку и слив с Капустянского пруда. По состоянию на начало 2018 года почти целиком заключён в подземный коллектор.
Миха́йловский овраг — малая река в Москве и Московской области, левый приток Битцы. Верховья реки засыпаны, речное русло южнее МКАД трансформировано и заключено в подземный коллектор. На территории Аннинского лесопарка сохранился в открытом течении на протяжении 350 метров. Название антропонимическое.

Ону́чин овра́г — малая река в районе Раменки Западного административного округа Москвы, правый приток Раменки. Своё название получила от антропонима Онуча, который происходит от слова «онучи» — портянки.
Я́сный овра́г — малая река в районе Хамовники Центрального административного округа Москвы, левый приток Москвы-реки. Речное русло заключено в подземный коллектор. Происхождение названия не установлено.

Ю́жный Октя́брьский руче́й — малая река в районе Хорошёво-Мнёвники Северо-Западного административного округа Москвы, левый приток Москвы-реки.
Хохло́вка — малая река в Нижегородском районе Юго-Восточного административного округа Москвы, правый приток Нищенки. Своё название получила от деревни Хохловки и исторической местности Калитники. По состоянию на начало 2018 года речное русло убрано в подземный коллектор.