Моло́га — река в Тверской, Новгородской и Вологодской областях России, впадает в Весьегонский плёс Рыбинского водохранилища на Волге. Длина — 456 км, площадь водосборного бассейна — 29,7 тыс. км².
Атемеша (Атемежа) — река в России, протекает по Бежецкому и Максатихинскому районам Тверской области. Устье реки находится в 323 км по правому берегу реки Мологи. Длина реки составляет 30 км, площадь водосборного бассейна — 315 км².
Бережа — река в России, протекает в Рамешковском и Бежецком районах Тверской области. Устье реки находится в 410 км по правому берегу реки Молога. Длина реки составляет 33 км, площадь водосборного бассейна — 193 км². В 2,8 км от устья справа в Бережу впадает Галчанка.
Бочиха — река в России, протекает по Бежецкому району Тверской области.
Ваня — река в Устюженском районе Вологодской области России, левый приток Мологи.
Волдомица — река в России, протекает в Лесном районе Тверской области и Пестовском районе Новгородской области. Устье реки находится в 163 км по левому берегу реки Молога. Длина реки составляет 26 км, площадь водосборного бассейна — 143 км².
Гуська — река в России, протекает по Пестовскому району Новгородской области. Устье реки находится в 156 км по левому берегу реки Молога. Длина реки составляет 16 км, площадь водосборного бассейна — 44,2 км².
Ижина — река в Устюженском районе Вологодской области России, правый приток Мологи.
Кеза — река в Тверской области России, протекает по территории Удомельского, Лесного и Максатихинского районов. Длина реки составляет 38 км, площадь водосборного бассейна — 456 км².
Мартыновка — река в Устюженском районе Вологодской области России, правый приток Мологи.
Острожня — река в Устюженском районе Вологодской области России, правый приток Мологи.
Полонуха — река в Лесном районе Тверской области России. Устье реки находится в 170 км по левому берегу реки Мологи. Длина реки составляет 40 км, площадь водосборного бассейна — 226 км².
Ривица — река в России, протекает по Максатихинскому району Тверской области. Устье реки находится в 290 км от устья Мологи по левому берегу. Длина реки составляет 49 км, площадь водосборного бассейна — 322 км².
Синица — река в России, протекает по Максатихинскому району Тверской области, по территории Труженицкого сельского поселения. Река вытекает из болота западнее деревни Горка, течёт преимущественно на восток. Устье реки находится в 253 км от устья реки Мологи по левому берегу, у деревни Топальское. Длина реки составляет 14 км.
Топалка — река в России, протекает по Максатихинскому району Тверской области. Устье реки находится в 224 км от устья реки Мологи по правому берегу. Длина реки составляет 30 км, площадь водосборного бассейна — 211 км².
Трестенка — река в России, протекает в Бежецком районе Тверской области. Исток — у деревни Клеймиха. Устье реки находится в 416 км по правому берегу реки Мологи. Длина реки составляет 13 км.
Тушемелька — река в Бокситогорском районе Ленинградской области России, левый приток реки Чагоды.
Улука — река в Сандовском районе Тверской области России. Устье реки находится в 189,5 км по правому берегу реки Мологи. Длина реки составляет 32 км, площадь водосборного бассейна — 162 км².
Шалочь — река в Устюженском районе Вологодской области России, левый приток Мологи.
Колодня — река в России, левый приток Мологи. Протекает по территории Пестовского района Новгородской и Чагодощенского и Устюженского районов Вологодской областей.
— исток, 
— устье
