Ви́рус — неклеточный инфекционный агент, который может воспроизводиться только внутри клеток. Вирусы поражают все типы организмов, от растений и животных до бактерий и архей. Обнаружены также вирусы, способные реплицироваться только в присутствии других вирусов (вирусы-сателлиты).
Ретрови́русы — семейство РНК-содержащих вирусов, заражающих преимущественно позвоночных. Наиболее известный и активно изучаемый представитель — вирус иммунодефицита человека.
Транскри́пция — происходящий во всех живых клетках процесс синтеза РНК с использованием ДНК в качестве матрицы; перенос генетической информации с ДНК на РНК.
Ви́рус Эпште́йна — Барр (ВЭБ), или вирус Эпстайна — Барр, или вирус герпеса человека 4 типа, или герпесвирус человека тип 4 — вид вирусов из подсемейства гаммагерпесвирусов семейства герпесвирусов.
Ма́ртин Ви́ллем Бе́йеринк — голландский микробиолог и ботаник, создатель Делфтской школы микробиологов.
Розалинд Франклин — английский биофизик и учёная-рентгенограф, занималась изучением структуры ДНК.
Ортомиксовирусы — семейство РНК-содержащих вирусов из порядка Articulavirales. Диаметр вирусных частиц 80—120 нм. Нуклеокапсид спиральный, заключён в липопротеидную оболочку. Содержат 7—8 фрагментов одноцепочечной линейной РНК. Вирионная РНК неинфекционна и комплементарна информационной РНК. Размножаются в ядре и цитоплазме клеток птиц, млекопитающих; созревают путём почкования на плазматической мембране клеток. Распространяются без переносчика. Поражают дыхательные органы. Типичные представители — вирусы гриппа.
Bunyavirales — порядок вирусов, выделенный в 2016 году. Геном представлен одноцепочечными (-)РНК или (+/-)РНК. Обнаружены у членистоногих, грызунов и других млекопитающих, некоторые вирусы данного порядка могут заражать людей, некоторые — растения.
Вирус SV40 — вид полиомавирусов, обнаруженный в клетках обезьян, из рода Betapolyomavirus, является типовым видом рода. Как и у других полиомавирусов, геном SV40 представлен кольцевой двуцепочечной ДНК.
Виргавирусы — семейство палочковидных РНК-содержащих вирусов растений. Широко известный вирус табачной мозаики относится именно к этому семейству.
Колимовирусы — семейство ДНК-содержащих вирусов растений с механизмом обратной транскрипции и двуцепочечной ДНК, то есть вирусов, содержащих стадию обратной транскрипции в своём репликативном цикле.
Парвовирусы — семейство самых мелких ДНК-содержащих сферических вирусов, лишенных липопротеидной оболочки. Вирионы имеют диаметр 18—26 нм и содержат 60 капсомеров, тип симметрии икосаэдрический Т1. Геном вируса содержит одноцепочечную ДНК, обычно имеющую две открытые рамки трансляции. Рамка считывания, расположенная на 5’-конце генома, кодирует неструктурные белки, а вирионные белки закодированы ближе к 3’-концу генома. На концах генома формируются шпилечные структуры.
Benyvirus (лат.) — род патогенных для растений вирусов из монотипного семейства Benyviridae, которое не включают в какой-либо из известных порядков вирусов.
Хайнц Людвиг Френкель-Конрат — немецко-американский биохимик, труды которого способствовали выявлению взаимодополняющей роли структурных компонентов вирусов.
РНК-содержащие вирусы — вирусы, геном которых представлен рибонуклеиновой кислотой. Обычно она одноцепочечная (оцРНК), но может быть и двуцепочечной (дцРНК). Наиболее серьёзными заболеваниями человека, вызываемыми РНК-вирусами, являются геморрагическая лихорадка Эбола, ТОРС, COVID-19, бешенство, простуда, грипп, гепатит C, гепатит E, лихорадка Западного Нила, полиомиелит и корь.
Riboviria (лат.) — реалм РНК-содержащих вирусов, которые реплицируются с помощью РНК-зависимых РНК-полимераз и всех вирусов, кодирующих собственную РНК-зависимую ДНК-полимеразу. В состав реалма входят вирусы из нескольких групп классификации вирусов по Балтимору: группа III (дцРНК-вирусы), группа IV (+оцРНК-вирусы), группа V (-оцРНК-вирусы), группа VI и группа VII.
Monodnaviria (лат.) — реалм ДНК-содержащих вирусов. Геном большинства членов реалма представлен кольцевой одноцепочечной ДНК, которая реплицируется по типу катящегося кольца, причём инициация репликации обеспечивается эндонуклеазой из суперсемейства HUH, закодированной в геномах Monodnaviria. В состав реалма также включаются вирусы, произошедшие от «типичных» Monodnaviria и имеющих либо линейный геном, представленный одноцепочечной ДНК, либо геном в виде кольцевой двуцепочечной ДНК.
Ribozyviria (лат.) — реалм РНК-содержащих вирусов, выделенный в 2020 году и по состоянию на 2020 год содержащий единственное семейство Kolmioviridae. Представители Ribozyviria — вирусы-сателлиты, которые могут размножаться в заражённых клетках только в присутствии вируса-хозяина. Вирусы реалма Ribozyviria заражают только клетки животных, а наиболее изученным представителем реалма является патоген человека вирус гепатита дельта, который является сателлитом вируса гепатита B.
В вирусологии реалм — это высший таксономический ранг, созданный для вирусов Международным комитетом по таксономии вирусов, который курирует работу над таксономией вирусов. Примерно соответствует рангу домена клеточных организмов. По состоянию на 2023 год признаны шесть реалмов вирусов, они объединены специфическими высококонсервативными признаками:
- Adnaviria, который содержит архейные нитчатые вирусы с геномами двухцепочечной ДНК A-формы, кодирующей уникальный альфа-спиральный главный капсидный белок;
- Duplodnaviria, который содержит все вирусы с двухцепочечной ДНК, кодирующие главный капсидный белок HK97-fold;
- Monodnaviria, который содержит все вирусы с одноцепочечной ДНК (оцДНК), кодирующие эндонуклеазу суперсемейства HUH, и её потомков;
- Riboviria, в который включены все РНК-содержащие вирусы, кодирующие РНК-зависимую РНК-полимеразу, и все вирусы, кодирующие обратную транскриптазу;
- Ribozyviria, который содержит дельта-подобные вирусы гепатита с кольцевыми геномами negative-sense ssRNA;
- Varidnaviria, который содержит все вирусы с двухцепочечной ДНК, которые кодируют основной капсидный белок с вертикальным желеобразным рулетом.
Orthornavirae — царство вирусов, геномы которых состоят из рибонуклеиновой кислоты (РНК) и кодируют РНК-зависимую РНК-полимеразу (RdRp). RdRp используется для транскрипции генома вирусной РНК в информационную РНК (мРНК) и для репликации генома. Вирусы этого царства также имеют ряд общих характеристик, связанных с эволюцией, включая высокую скорость генетических мутаций, рекомбинаций и реассортации.
