Гистондеацетилаза 6

Перейти к навигацииПерейти к поиску
Гистондеацетилаза 6
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

3C5K, 3GV4, 3PHD, 5EDU, 5KH7

Идентификаторы
ПсевдонимыHDAC6, CPBHM, HD6, PPP1R90, JM21, histone deacetylase 6
Внешние IDOMIM: 300272 MGI: 1333752 HomoloGene: 31353 GeneCards: HDAC6
Расположение гена (человек)
X-хромосома человека
Хр.X-хромосома человека[1]
X-хромосома человека
Расположение в геноме HDAC6
Расположение в геноме HDAC6
ЛокусXp11.23Начало48,801,377 bp[1]
Конец48,824,982 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
X-хромосома мыши
Хр.X-хромосома мыши[2]
X-хромосома мыши
Расположение в геноме HDAC6
Расположение в геноме HDAC6
ЛокусX A1.1|X 3.58 cMНачало7,796,359 bp[2]
Конец7,814,128 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
Наибольшая экспрессия в
Дополнительные справочные данные
BioGPS




Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

10013

15185

Ensembl

ENSG00000094631

ENSMUSG00000031161

UniProt

Q9UBN7

Q9Z2V5

RefSeq (мРНК)
NM_006044
NM_001321225
NM_001321226
NM_001321227
NM_001321228

NM_001321229
NM_001321230
NM_001321231

NM_001130416
NM_010413

RefSeq (белок)
NP_001308154
NP_001308155
NP_001308156
NP_001308157
NP_001308158

NP_001308159
NP_001308160
NP_006035

NP_001123888
NP_034543

Локус (UCSC)Chr X: 48.8 – 48.82 MbChr X: 7.8 – 7.81 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Гистондеацетилаза 6 (англ. Histone deacetylase 6) — фермент, кодируемый у человека геном HDAC6[5][6].

Функция

Гистоны играют важнейшую роль в регуляции транскрипции, клеточного цикла и процесса развития. Ацетилирование/деацетилирование гистонов изменяет структуру хроматина и влияет на транскрипцию. Гистондеацетилаза 6 относится к классу II семейства гистондезацетилаз/acuc/APHA. Он содержит два каталитических домена, которые функционируют независимо друг от друга. Белок обладает гистондеацетилазной активностью и подавляет транскрипцию[7].

Клиническая значимость

Мутации в этом гене были связаны с болезнью Альцгеймера[8].

Суперэкспрессия этого белка коррелирует с онкогенезом и выживаемостью клеток, а также способствует метастазированию раковых клеток[9].

Функции

Гистондеацетилаза 6 участвует в разборке ресничек клетки, что необходимо для начала митоза[10]. Также способствует миграции клеток и катализирует деацетилирование α-тубулина[11], что может способствовать метастазированию раковых опухолей[9]. Влияет на транскрипцию и трансляцию путём регулирования белка теплового шока Hsp90 и стресс-гранул соответственно[9].

Известен высоким сродством к убиквитинированным белкам[12]. Гистондеацетилаза 6 играет важную роль в формировании стресс-гранул[англ.]; при фармакологическом ингибировании или при подавлении синтеза гистондеацетилазы 6 на генетическом уровне прекращается образование стресс-гранул.

Взаимодействия

HDAC6, как было выявлено, взаимодействует с HDAC11[13] и ZBTB16[14] .

HDAC6 также взаимодействует с белком G3BP1[англ.] стресс-гранул[12].

См. также

Примечания

  1. ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000094631 - Ensembl, May 2017
  2. ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000031161 - Ensembl, May 2017
  3. ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ↑ Grozinger C.M., Hassig C.A., Schreiber S.L. Three proteins define a class of human histone deacetylases related to yeast Hda1p (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1999. — June (vol. 96, no. 9). — P. 4868—4873. — doi:10.1073/pnas.96.9.4868. — PMID 10220385. — PMC 21783.
  6. ↑ Nagase T., Ishikawa K., Suyama M., Kikuno R., Hirosawa M., Miyajima N., Tanaka A., Kotani H., Nomura N., Ohara O. Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro (англ.) // DNA Research[англ.] : journal. — 1999. — May (vol. 5, no. 6). — P. 355—364. — doi:10.1093/dnares/5.6.355. — PMID 10048485.
  7. ↑ Entrez Gene: HDAC6 histone deacetylase 6.
  8. ↑ Cook C., Gendron T.F., Scheffel K., Carlomagno Y., Dunmore J., DeTure M., Petrucelli L. Loss of HDAC6, a novel CHIP substrate, alleviates abnormal tau accumulation (англ.) // Human Molecular Genetics[англ.] : journal. — Oxford University Press, 2012. — 5 April. — doi:10.1093/hmg/dds125. — PMID 22492994.
  9. ↑ 1 2 3 Aldana-Masangkay G.I., Sakamoto K.M. The role of HDAC6 in cancer (англ.) // BioMed Research International[англ.] : journal. — 2011. — Vol. 2011. — P. 875824. — doi:10.1155/2011/875824. — PMID 21076528. — PMC 2975074.
  10. ↑ Gradilone S. A., Radtke B. N., Bogert P. S., Huang B. Q., Gajdos G. B., LaRusso N. F. HDAC6 inhibition restores ciliary expression and decreases tumor growth. (англ.) // Cancer research. — 2013. — Vol. 73, no. 7. — P. 2259—2270. — doi:10.1158/0008-5472.CAN-12-2938. — PMID 23370327. [исправить]
  11. ↑ Gao Y.S., Hubbert C.C., Lu J., Lee Y.S., Lee J.Y., Yao T.P. Histone deacetylase 6 regulates growth factor-induced actin remodeling and endocytosis (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 2007. — Vol. 27, no. 24. — P. 8637—8647. — doi:10.1128/MCB.00393-07. — PMID 17938201. — PMC 2169396.
  12. ↑ 1 2 Kwon S., Zhang Y., Matthias P. The deacetylase HDAC6 is a novel critical component of stress granules involved in the stress response (англ.) // Genes & Development : journal. — 2007. — December (vol. 21, no. 24). — P. 3381—3394. — doi:10.1101/gad.461107. — PMID 18079183. — PMC 2113037.
  13. ↑ Gao L., Cueto M.A., Asselbergs F., Atadja P. Cloning and functional characterization of HDAC11, a novel member of the human histone deacetylase family (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2002. — July (vol. 277, no. 28). — P. 25748—25755. — doi:10.1074/jbc.M111871200. — PMID 11948178.
  14. ↑ Chauchereau A., Mathieu M., de Saintignon J., Ferreira R., Pritchard L.L., Mishal Z., Dejean A., Harel-Bellan A. HDAC4 mediates transcriptional repression by the acute promyelocytic leukaemia-associated protein PLZF (англ.) // Oncogene : journal. — 2004. — November (vol. 23, no. 54). — P. 8777—8784. — doi:10.1038/sj.onc.1208128. — PMID 15467736.

Литература

  • Pazin M.J., Kadonaga J.T. What's up and down with histone deacetylation and transcription? (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1997. — Vol. 89, no. 3. — P. 325—328. — doi:10.1016/S0092-8674(00)80211-1. — PMID 9150131.
  • Wolffe A.P. Transcriptional control. Sinful repression (англ.) // Nature. — 1997. — Vol. 387, no. 6628. — P. 16—7. — doi:10.1038/387016a0. — PMID 9139815.
  • Huynh K.D., Fischle W., Verdin E., Bardwell V.J. BCoR, a novel corepressor involved in BCL-6 repression (англ.) // Genes & Development : journal. — 2000. — Vol. 14, no. 14. — P. 1810—1823. — doi:10.1101/gad.14.14.1810. — PMID 10898795. — PMC 316791.
  • Mahlknecht U., Schnittger S., Landgraf F., Schoch C., Ottmann O.G., Hiddemann W., Hoelzer D. Assignment of the human histone deacetylase 6 gene (HDAC6) to X chromosome p11.23 by in situ hybridization (англ.) // Cytogenetics and Genome Research[англ.] : journal. — 2001. — Vol. 93, no. 1—2. — P. 135—136. — doi:10.1159/000056967. — PMID 11474198.
  • Kao H.Y., Lee C.H., Komarov A., Han C.C., Evans R.M. Isolation and characterization of mammalian HDAC10, a novel histone deacetylase (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2002. — Vol. 277, no. 1. — P. 187—193. — doi:10.1074/jbc.M108931200. — PMID 11677242.
  • Seigneurin-Berny D., Verdel A., Curtet S., Lemercier C., Garin J., Rousseaux S., Khochbin S. Identification of Components of the Murine Histone Deacetylase 6 Complex: Link between Acetylation and Ubiquitination Signaling Pathways (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 2001. — Vol. 21, no. 23. — P. 8035—8044. — doi:10.1128/MCB.21.23.8035-8044.2001. — PMID 11689694. — PMC 99970.
  • Tong J.J., Liu J., Bertos N.R., Yang X.J. Identification of HDAC10, a novel class II human histone deacetylase containing a leucine-rich domain (англ.) // Nucleic Acids Research : journal. — 2002. — Vol. 30, no. 5. — P. 1114—1123. — doi:10.1093/nar/30.5.1114. — PMID 11861901. — PMC 101247.
  • Gao L., Cueto M.A., Asselbergs F., Atadja P. Cloning and functional characterization of HDAC11, a novel member of the human histone deacetylase family (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2002. — Vol. 277, no. 28. — P. 25748—25755. — doi:10.1074/jbc.M111871200. — PMID 11948178.
  • Hubbert C., Guardiola A., Shao R., Kawaguchi Y., Ito A., Nixon A., Yoshida M., Wang X.F., Yao T.P. HDAC6 is a microtubule-associated deacetylase (англ.) // Nature. — 2002. — Vol. 417, no. 6887. — P. 455—458. — doi:10.1038/417455a. — PMID 12024216.
  • Kirsh O., Seeler J.S., Pichler A., Gast A., Müller S., Miska E., Mathieu M., Harel-Bellan A., Kouzarides T., Melchior F., Dejean A. The SUMO E3 ligase RanBP2 promotes modification of the HDAC4 deacetylase (англ.) // The EMBO Journal : journal. — 2002. — Vol. 21, no. 11. — P. 2682—2691. — doi:10.1093/emboj/21.11.2682. — PMID 12032081. — PMC 125385.
  • Hook S.S., Orian A., Cowley S.M., Eisenman R.N. Histone deacetylase 6 binds polyubiquitin through its zinc finger (PAZ domain) and copurifies with deubiquitinating enzymes (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2002. — Vol. 99, no. 21. — P. 13425—13430. — doi:10.1073/pnas.172511699. — PMID 12354939. — PMC 129689.
  • Westendorf J.J., Zaidi S.K., Cascino J.E., Kahler R., van Wijnen A.J., Lian J.B., Yoshida M., Stein G.S., Li X. Runx2 (Cbfa1, AML-3) Interacts with Histone Deacetylase 6 and Represses the p21CIP1/WAF1 Promoter (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 2002. — Vol. 22, no. 22. — P. 7982—7992. — doi:10.1128/MCB.22.22.7982-7992.2002. — PMID 12391164. — PMC 134736.
  • North B.J., Marshall B.L., Borra M.T., Denu J.M., Verdin E. The human Sir2 ortholog, SIRT2, is an NAD+-dependent tubulin deacetylase (англ.) // Molecular Cell[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 11, no. 2. — P. 437—444. — doi:10.1016/S1097-2765(03)00038-8. — PMID 12620231.
  • Voelter-Mahlknecht S., Mahlknecht U. Cloning and structural characterization of the human histone deacetylase 6 gene (англ.) // International Journal of Molecular Medicine[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 12, no. 1. — P. 87—93. — doi:10.3892/ijmm.12.1.87. — PMID 12792815.
  • Brush M.H., Guardiola A., Connor J.H., Yao T.P., Shenolikar S. Deactylase inhibitors disrupt cellular complexes containing protein phosphatases and deacetylases (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2004. — Vol. 279, no. 9. — P. 7685—7691. — doi:10.1074/jbc.M310997200. — PMID 14670976.
  • Pandey U.B., Batlevi Y., Baehrecke E.H., Taylor J.P. HDAC6 at the intersection of autophagy, the ubiquitin-proteasome system and neurodegeneration (англ.) // Autophagy : journal. — Vol. 3, no. 6. — P. 643—645. — doi:10.4161/auto.5050. — PMID 17912024. (Epub 2007 Sep 10)
  • Pandey U.B., Nie Z., Batlevi Y., McCray B.A., Ritson G.P., Nedelsky N.B., Schwartz S.L., DiProspero N.A., Knight M.A., Schuldiner O., Padmanabhan R., Hild M., Berry D.L., Garza D., Hubbert C.C., Yao T.P., Baehrecke E.H., Taylor J.P. HDAC6 rescues neurodegeneration and provides an essential link between autophagy and the UPS (англ.) // Nature : journal. — 2007. — 14 June (vol. 447, no. 7146). — P. 859—863. — doi:10.1038/nature05853. — PMID 17568747.