
Фукси́н (солянокислый розанилин) C20H20N3Cl — зелёные кристаллы с металлическим блеском, водные растворы пурпурно-красного цвета. Краситель трифенилметанового ряда, на свету малостоек. Один из первых синтетических красителей (получен в 1856 году Я. Натансоном).

Метод окраски по Цилю — Нильсену — метод окраски микроорганизмов для выявления кислотоустойчивых микобактерий, актиномицетов и других кислотоустойчивых микроорганизмов. Кислотоустойчивость микроорганизмов обусловлена наличием в их клетках липидов, воска и оксикислот. Такие микроорганизмы плохо окрашиваются разведёнными растворами красителей. Для облегчения проникновения красителя в клетки микроорганизмов нанесённый на препарат карболовый фуксин Циля подогревают над пламенем горелки. Окрашенные микроорганизмы не обесцвечиваются слабыми растворами минеральных кислот и спирта.
Трипановый синий (4,4′-бис(1-гидрокси-8-амино-3,6-дисульфонафталиназо)-3,3′-диметилбифенила динатриевая соль) — органическое соединение с химической формулой C34H24N6Na4O14S4, прямой азокраситель, используемый для селективного окрашивания клеток и тканей. Синие или голубые кристаллы, плохо растворимые в воде и спирте. Впервые был синтезирован Паулем Эрлихом в 1904 году.

Азур I (азур 1, триметилтионина хлорид, Azure I, Azure B, C.I. #: 52010, CAS #: 531-55-5) — основный тиазиновый краситель. Представляет собой темно-зеленые кристаллы, растворимые в воде. Брутто-формула C15H16ClN3S
Прижизненное или витальное окрашивание — метод окрашивания организмов или живых препаратов их тканей для повышения контраста при наблюдении под микроскопом.

Ализариновый красный С (ализарин С, alizarin red S, натриевая соль 9,10-дигидро-3,4-дигидрокси-9,10-диоксо-2-антраценсульфокислоты) — органическое соединение ряда антрахиноновых красителей с химической формулой C14H7NaO7S. Применяется в аналитической химии как индикатор для определения ионов алюминия, скандия, иттрия и фтора.

Нейтральный красный (3-амино-6-диметиламино-2-метилфеназоний хлористый) — органическое соединение с химической формулой C15H17ClN4, производное феназина, относящееся к диазиновым красителям. Используется в микробиологии для прижизненного окрашивания клеточных культур и в аналитической химии как кислотно-основной индикатор.

Сафрани́н (3,6-диамино-2,7-диметил-10-фенилфеназинхлоргидрат) — органическое соединение, основный диазиновый краситель, относящийся к классу сафранинов, с химической формулой C20H19N4Cl. Тёмно-красный порошок, растворимый в воде и спирте. Применяется как краситель для шерсти, шёлка, бумаги и кожи, несмотря на то, что имеет плохую светопрочность. Также используется для приготовления лаков, чернил, как десенсибилизатор в фотографии.

Я́нус зелёный (2-диэтиламино-3,6-диметил-9-фенилфеназоний-7-азо-4′-диметиланилин хлористый) — органическое соединение, краситель, относящийся к диазотированным сафранинам и имеющий химическую формулу C32H35N6Cl. Тёмно-зелёный порошок, дающий синий водный раствор. Применяется в микроскопии для прижизненного окрашивания, в аналитической химии — как реактив на олово и как окислительно-восстановительный индикатор.

Хризоидин (2,4-диаминоазобензол гидрохлорид) — органическое соединение, азокраситель с химической формулой C12H13ClN4. Чёрные или коричневые кристаллы, растворимые в воде. Применяется в микроскопии для окрашивания бактерий и тканей, а также в аналитической химии как кислотно-основный индикатор.

Феносафранин (3,6-диамино-10-фенилфеназоний хлорид) — органическое соединение, основный диазиновый краситель, относящийся к классу сафранинов, с химической формулой C18H15N4Cl. Зелёные кристаллы, растворяющиеся в воде с образованием красного раствора. Применяется в микроскопии как краситель, в аналитической химии, как индикатор и в фотографии, как десенсибилизатор.

Голубой Эванса (3,3′-диметилбифенилен-4,4′-бис(7-азо-1-амино-8-гидроксинафталин-2,4-дисульфокислоты) тетранатриевая соль) — органическое соединение, прямой дисазокраситель с химической формулой C34H24N6Na4O14S4. Имеет вид мелких фиолетово-коричневых кристаллов. Применяется в микроскопии для окрашивания гистологических препаратов.

Кристалли́ческий фиоле́товый (N,N,N′,N′,N′′,N′′-гексаметилпарарозанилин хлорид) — органическое соединение, основный трифенилметановый краситель с химической формулой C25H30N3Cl, одна из форм метилового фиолетового. Имеет вид блестящих зелёных кристаллов, применяется в качестве кислотно-основного индикатора и для различных окрасок препаратов в биологии.

4-Диметиламинобензальдегид (p-диметиламинобензальдегид, DMAB, п-ДАБА) — ароматическое органическое соединение с химической формулой (CH3)2NC6H4CHO. Имеет вид белых кристаллов, является основным компонентом реактива Эрлиха, который включает в себя, помимо диметиламинобензальдегида, ещё спирт и соляную кислоту. Применяется в микроскопии и аналитической химии, а также в органическом синтезе для получения красителей.

Судан III (2-гидроксинафталин-1-азо-1′-бензол-4′-азобензол) — органическое соединение, синтетический азокраситель с химической формулой C22H16N4O, относящийся к группе судановых красителей. Имеет вид красновато-коричневого порошка, применяется для окрашивания в микроскопии.

Крези́ловый фиоле́товый — органическое соединение с химической формулой C19H18ClN3O, основный оксазиновый краситель. Коричнево-зелёный порошок, плохо растворимый в воде и спирте. Используется в микроскопии для биологических исследований и прижизненного окрашивания.

Акридиновый оранжевый (3,6-бис(диметиламино)акридин) — органическое соединение, основный акридиновый краситель с химической формулой C17H19N3. Оранжевый или красный порошок, легко растворимый в воде и спирте. Применяется в микроскопии для окраски препаратов.

Мети́ловый зелёный (гептаметилпарарозанилин хлористый) — органическое соединение, основный трифенилметановый краситель с химической формулой C26H33Cl2N3. Зелёные кристаллы, растворимые в воде. Используется в микроскопии для окрашивания биологических препаратов.

Ауранция — органическое соединение, аммонийная соль гексанитродифениламина с химической формулой C12H8N8O12, кислотный нитрокраситель, ранее применявшийся для окраски кожи; продолжает использоваться в микроскопии для окраски препаратов. Красный или оранжевый порошок, плохо растворимый в воде. Соединение, как и гексанитродифениламин, обладает взрывчатыми свойствами, что позволяет применять его в детонаторах.

Метиленовый зелёный (6-нитро-3,7-бис(диметиламино)фентиазоний хлористый) — органическое соединение, основный тиазиновый краситель с химической формулой C16H17ClN4O2S. Кристаллы коричневого цвета, дающие сине-зелёный водный раствор. Применяется в микроскопии.