Фенилалани́н — ароматическая альфа-аминокислота. Существует в двух оптически изомерных формах l и d и в виде рацемата. По химическому строению соединение можно представить как аминокислоту аланин, в которой один из атомов водорода замещён фенильной группой.
Тирози́н — ароматическая альфа-аминокислота. Существует в двух оптически изомерных формах — L и D и в виде рацемата (DL). По строению соединение отличается от аминокислоты фенилаланина наличием фенольной гидроксильной группы в пара-положении бензольного кольца.
Триптофа́н — ароматическая альфа-аминокислота. Существует в двух оптически изомерных формах, L и D, и в виде рацемата (DL).
Глутаматдекарбоксилаза (англ. Glutamate decarboxylase, GAD, GAD65, GAD67, шифр КФ 4.1.1.15) — фермент, катализирующий преобразование глутамата в ГАМК посредством декарбоксилирования по следующей реакции:
- HOOC-CH2-CH2-CH(NH2)-COOH → CO2 + HOOC-CH2-CH2-CH2NH2.
5-Гидрокситриптофан (5-HTP), также известный как окситриптан (МНН), — это аминокислота, встречающаяся в природе, в частности в семенах Griffonia simplicifolia. Является прекурсором нейротрансмитера серотонина. Также является промежуточным веществом в метаболизме триптофана, одной из важнейших аминокислот:
Оксидаза D-аминокислот - фермент, окисляющий D-аминокислоты. DAAO обнаруживается в пероксисомах и представляет собой FAD-содержащий флавопротеин.
Пирролизин — нестандартная протеиногенная аминокислота, которая участвует в биосинтезе белка у ряда метаногенных архей. Был обнаружен в 2002 году на активном участке фермента метилтрансферазы, выделенной из метаногенной археи Methanosarcina barkeri, и является 22-й из найденных в природе аминокислот, которые входят в состав природных белков. В организме человека отсутствует.
Пол Наим Берг — американский биохимик, лауреат Нобелевской премии по химии. Эмерит-профессор Стэнфордского университета, член НАН США и Американского философского общества (1983), иностранный член Французской академии наук (1981) и Лондонского королевского общества (1992). Также удостоен Национальной научной медали (1983) и других наград.
Шикима́тный путь — метаболический путь, промежуточным метаболитом которого является шикимовая кислота (шикимат). Шикиматный путь отмечается как специализированный путь биосинтеза бензоидных ароматических соединений. Шикиматным путём в природе синтезируются такие известные соединения, как фенилаланин, тирозин, триптофан, бензоат, салицилат. Шикиматный путь является источником ароматических предшественников терпеноидных хинонов, токоферолов, фолата, флавоноидов, лигнинов, суберинов, меланинов, таннинов и огромного множества других соединений, играющих в природе различную роль. Шикиматный путь — один из древнейших эволюционно консервативных метаболических путей; как источник фундаментальных составляющих живой материи фактически представляет собой часть первичного метаболизма. Значение шикиматного пути велико, так как этот путь является единственным установленным путём биосинтеза ряда важнейших природных соединений, в том числе значимых в плане их практического использования. В строгом смысле под шикиматным путём следует понимать только общую часть разветвлённого метаболического процесса — путь биосинтеза хоризмовой кислоты (хоризмата).
Изоформа белка — любая из нескольких разных форм одного и того же белка, происходящих из одного гена или семейства генов.
Непротеиногенные аминокислоты — аминокислоты, которые не участвуют в биосинтезе белка. Непротеиногенные аминокислоты часто не входят в состав непатогенных и «нормальных» белков человека, не следует их путать с нестандартными аминокислотами, которые образуются непосредственно при синтезе белка или в результате различных ковалентных модификаций молекулярных структур протеиногенных (кодируемых) аминокислот в составе белков, например, гидроксипролина, десмозина или аллизина. Однако они могут входить в состав некоторых небольших молекул или пептидов, синтез которых является нерибосомальным. Химически синтезированные аминокислоты можно назвать неприродными аминокислотами. Многие из них являются токсинами и ингибиторами ферментов разнообразных метаболических реакций. Известно свыше 400 природных аминокислот и, возможно, больше тысячи их комбинаций. Неприродные аминокислоты могут быть синтетически получены из их нативных аналогов с помощью модификаций, таких как алкилирование аминогруппы, замещение боковой цепи, циклизация за счёт удлинения структурных связей и изостерических замен в аминокислотном остове.
Эрнест Фредерик Гейл — британский микробиолог, профессор химической микробиологии в Кембриджском университете. Сыграл значительную роль в изучении молекулярных основ действия антибиотиков. Изучал дезаминазы и декарбоксилазы бактерий, что привело к открытию пиридоксальфосфата.
Гистидиндекарбоксилаза — декарбоксилирующий фермент из класса лиаз, катализирующий процесс декарбоксилирования молекулы протеиногенной аминокислоты гистидина по реакции:
Транспортёр серотонина, или натрий-зависимый транспортёр серотонина — это внутриклеточный белок, являющийся продуктом гена SLC6A4 и обозначаемый аббревиатурами SERT или 5-HTT. Транспортёр серотонина относится к семейству белков-транспортёров моноаминов. Исходно физиологической функцией SERT считали обратный захват и транспорт серотонина в тромбоциты, затем внимание было сосредоточено на обратном захвате серотонина из синаптической щели обратно в выделивший его пресинаптический нейрон, поскольку блокаторы SERT оказались эффективными средствами против депрессий и тревожных состояний. Однако, множеством работ продемонстрировано, что функция SERT отнюдь не исчерпывается нейронами и тромбоцитами: в частности, с участием этого транспортера происходит аккумулирование серотонина в яичниках, яйцеклетках и эмбрионах различных видов животных, что важно для нормального развития.
Недостаточность декарбоксилазы ароматических аминокислот - редкое аутосомно-рецессивное генетическое заболевание, вызываемое мутациями гена DDC, кодирующего соответствующий фермент.
Недостаточность дигидроптеридинредуктазы — генетическое расстройство синтеза тетрагидробиоптерина (BH4), вызываемое мутациями гена QDPR. Мутации гена нарушают работу фермента 6,7-дигидроптеридинредуктазы (ДГПР), отвечающего за регенерацию BH4. Тип наследования - аутосомно-рецессивный.
CD98 — мембранный гликопротеин, гетеродимер, состоящий из двух субъединиц SLC3A2 и SLC7A5, которые образуют так называемый «большой переносчик нейтральных аминокислот». LAT1 является мембранным белком-переносчиком, переносящий главным образом аминокислоты с разветвлёнными боковыми цепями и ароматические аминокислоты. Особенно высокий уровень экспрессии LAT1 обнаружен в мозге в капиллярах гематоэнцефалического барьера.
Карбидопа (Лодозин) — препарат, который назначают людям с болезнью Паркинсона с целью подавления периферического метаболизма леводопы. Это свойство важно тем, что оно позволяет большей части вводимой леводопы преодолевать гематоэнцефалический барьер для воздействия на центральную нервную систему, вместо того чтобы подвергаться периферическому метаболизму с образованием веществ, неспособных преодолеть указанный барьер.
Аконитатдекарбоксилаза (англ. aconitate decarboxylase, ACOD1 или cis-Aconitate decarboxylase, CAD — фермент, катализирующий преобразование цис-аконитата в итаконат по следующей реакции:
