
Би́ва (яп. 琵琶湖 Бива-ко), раньше называлось Оми, в русскоязычных источниках также Мизууми, от мидзууми (яп. 湖, «озеро») — крупнейшее озеро Японии, находящееся в префектуре Сига, к северо-востоку от бывшей столицы Киото. Пресноводное, имеет тектоническое происхождение. Часто упоминается в японской литературе, так как находится близко к древней столице. Про это озеро складывались стихи, с ним связаны многочисленные битвы. По преданию, название озера происходит от музыкального инструмента бива из-за сходства очертаний с формой этого инструмента.

Масю — бессточное кратерное озеро в восточной части японского острова Хоккайдо. Располагается на территории округа Кусиро в префектуре Хоккайдо. Входит в состав национального парка Акан.

И́се, Исе-ван (яп. 伊勢湾 исэ-ван, «залив Исе») или И́сеноу́ми (яп. 伊勢海 исэ-но-уми, «море Исэ») — залив Филиппинского моря в Японии, вдается в южное побережье центральной части острова Хонсю. Расположен в прибрежных водах префектур Айти и Миэ. С запада, севера и востока окружён полуостровами Сима, Тита и Ацуми. На севере в залив впадают реки Кисо, Нагара, Иби и Сёнай. На юго-востоке сообщается с заливом Микава через пролив Накаяма.

Саро́ма — солоноватое лагунное озеро на северо-восточном берегу японского острова Хоккайдо. Располагается на территории округа Охотск в префектуре Хоккайдо. Относится к бассейну Охотского моря, сообщаясь с ним через пролив на северо-западе. Вместе с озёрами Ноторо, Тофуцу и Абасири входит в состав квазинационального парка Абасири.

Накауми — солоноватое лагунное озеро на севере юго-западной части японского острова Хонсю. Располагается на границе префектур Симане и Тоттори. Относится к бассейну Японского моря, сообщаясь с ним на северо-востоке через пролив Накаэносето (Сакай), впадающий в бухту Михо.

Синдзи — солоноватое озеро лагунного происхождения на севере юго-западной части японского острова Хонсю. Располагается на территории префектуры Симане. Относится к бассейну Японского моря, сообщаясь с ним на северо-востоке через канал Сада-Гава, впадающий в бухту Этомо. Седьмое по площади озеро Японии.

Хамана — солоноватое лагунное озеро на юге центральной части японского острова Хонсю. Располагается на территории префектуры Сидзуока. Относится к бассейну Тихого океана, сообщаясь с ним на юге через пролив шириной 200 м, впадающий в залив (плёс) Энсю-Нада.

Огавара — солоноватое лагунное озеро на севере японского острова Хонсю. Располагается на территории префектуры Аомори. Относится к водосборному бассейну Тихого океана, сообщаясь с ним через реку Такасе на северо-востоке.

Аба́сири — солоноватое озеро лагунного происхождения на востоке японского острова Хоккайдо. Располагается на территории округа Охотск в префектуре Хоккайдо. Относится к бассейну Охотского моря, сообщаясь с ним через реку Абасири на северо-востоке, впадающую в залив Абасири. Вместе с озёрами Ноторо, Тофуцу и Сарома входит в состав квазинационального парка Абасири. В озеро впадают реки Абасири, Мемамбецу и Томаппу.

Акке́си — солоноватое лагунное озеро юго-восточного побережья японского острова Хоккайдо. Располагается на территории округа Кусиро в префектуре Хоккайдо. Относится к бассейну Тихого океана, сообщаясь с ним через пролив на западе, впадающий в бухту Аккеси.

Куттяро — солоноватое озеро лагунного происхождения на северо-восточном побережье северной части японского острова Хоккайдо. Располагается на территории округа Соя в префектуре Хоккайдо. Относится к бассейну Охотского моря, сообщаясь с ним через реку Куттяро на востоке.

Су́ва — пресноводное горное озеро в центре средней части японского острова Хонсю. Располагается между городами Окая и Сува, на территории префектуры Нагано. Относится к водосборному бассейну Филиппинского моря. Сток из озера идёт на запад через реку Тенрю в залив (плёс) Энсю-Нада.

Акан — пресноводное горное озеро в восточной части японского острова Хоккайдо. Располагается на территории округа Кусиро в префектуре Хоккайдо. Относится к бассейну Тихого океана. Сток из озера идёт на юго-восток через реку Акан, впадающую в залив у города Кусиро. Входит в состав национального парка Акан.

Тюдзендзи — пресноводное горное озеро на северо-востоке центральной части японского острова Хонсю. Располагается на территории префектуры Тотиги. Входит в состав национального парка Никко. Относится к бассейну реки Тоне. Сток из озера идёт на восток через реку Дайя, впадающую в Кину.

Ике́да — пресноводное кратерное озеро юго-восточной оконечности полуострова Сацума на юге японского острова Кюсю. Располагается на территории префектуры Кагосима. Входит в состав национального парка Кирисима-Яку. Относится к водосборному бассейну Восточно-Китайского моря. Сток из озера идёт на юг через реку, впадающую в залив у населённого пункта Кавадзири.

Тофуцу — лагунное озеро на востоке японского острова Хоккайдо. Располагается на территории округа Охотск в префектуре Хоккайдо. Относится к бассейну Охотского моря, сообщаясь с ним на северо-западе через протоку, впадающую в залив Абасири. Вместе с озёрами Ноторо, Абасири и Сарома входит в состав квазинационального парка Абасири.

Комуке-То — солоноватоводное эвтрофное озеро на северо-восточном побережье японского острова Хоккайдо. Располагается на территории округа Охотск в префектуре Хоккайдо. Относится к бассейну Охотского моря, сообщаясь с ним через пролив на северо-востоке. В 1987 году на базе озера создана одноимённая особо охраняемая природная территория.

Торо-Ко — пресноводное эвтрофное озеро на юге восточной части японского острова Хоккайдо. Располагается на территории округа Кусиро в префектуре Хоккайдо. Относится к бассейну реки Кусиро-Гава, впадающей в Тихий океан. C 1987 года входит в состав национального парка Кусиро-Сицугэн.

Онума — пресноводное эвтрофное озеро на юге западной части японского острова Хоккайдо. Располагается на территории округа Осима в префектуре Хоккайдо. Входит в состав одноимённой особо охраняемой природной территории площадью 158,2 км², учреждённой в 1982 году.

Михо или Михо-Ван (яп. 美保湾 михо-ван) — бухта Японского моря на острове Хонсю. Залив простирается от мыса Дзидзо (яп. 地蔵崎) на западе до устья реки Амида (яп. 阿弥陀川) на востоке. Ширина залива составляет около 20 км, длина — около 10 км. Залив отделён песчаной косой (полуостровом) Юмигахама от озера Накауми, с которым он сообщается через пролив Сакаи