Саму́р — река в России, в Южном Дагестане; по части русла проходит граница России с Азербайджаном. Является второй по величине рекой в Дагестане, частично пограничной с Азербайджаном. Исток находится в Рутульском районе Дагестана.
Казикумухское Койсу — река в России (Дагестан), правый приток Каракойсу. Протекает по территории Лакского, Левашинского и Гергебильского районов.
Каракойсу — река в России (Дагестан), правый приток реки Аварское Койсу. Протекает по территории Чародинского, Гунибского и Гергебильского районов.
Ахтычай — река в России, правый приток Самура. Течёт по территории Рутульского и Ахтынского районов Республики Дагестан. Длина — 63 км, площадь водосборного бассейна — 963 км².
Куна́р / Читра́л — трансграничная река, начинающаяся на северо-востоке Пакистана (Хайбер-Пахтунхва) и заканчивающаяся в восточной части Афганистана в провинциях Кунар и Нангархар. Образуется в результате слияния рек Путкух и Мастудж (Битерипари). Является левым и самым крупным притоком реки Кабул впадающим в него в 5 км ниже города Джелалабад.
Каяна — река в России (Дагестан), левый приток р. Самур. Протекает по территории Рутульского района.
Аттагайчай (Аттагай) — река в России (Дагестан), правый приток реки Самур. Протекает по территории Рутульского района.
Курдул — река в России (Дагестан), правый приток р. Самур. Протекает по территории Рутульского района.
Кара-Самур — река в России (Дагестан), левый приток р. Самур. Протекает по территории Рутульского района. От истока до впадения реки Хултайчай носит название Гунтуца, до впадения реки Хиривалю — Хултайчай.
Шиназчай — река в России (Дагестан), левый приток р. Самур. Протекает по территории Рутульского района. От истока до впадения реки Сангарнец носит название Курапнец.
Гюльгерыча́й — река, протекающая по территории Сулейман-Стальского и Магарамкентского районов Дагестана, является искусственным притоком.
Хпеджчай (Ага-Камар) — река в России, в Республике Дагестан, левый приток реки Курах. Протекает по территории Агульского и Курахского районов. В верховье носит название Ганарирух.
Арач — река в России, в Республике Дагестан, левый приток реки Курах. Протекает по территории Курахского и Сулейман-Стальского районов. В верховье носит название Ламаркул, до с. Цмур — Ашага-Мака.
Гдымчай — река в России, правый приток реки Ахтычай, протекает в Дагестане, по территории Ахтынского района. Устье реки находится в 26 км от устья реки Ахтычай по правому берегу. Длина реки составляет 18 км. Площадь водосборного бассейна — 82,4 км².
Даличай — река в России, правый приток реки Ахтычай, протекает в Республике Дагестан по территории Ахтынского района. Устье реки находится в 35 км от устья реки Ахтычай по правому берегу. Длина реки составляет 14 км. Площадь водосборного бассейна — 107 км².
Мисичай — река в России, протекает в Агульском районе Республики Дагестан. Длина реки составляет 14 км. Площадь водосборного бассейна — 42,7 км².
Кахулкам (Кахул-дере) — река в России, левый приток реки Самур, протекает в Республике Дагестан, по территории Ахтынского района. Устье реки находится в 118 км по левому берегу реки Самур. Длина реки составляет 14 км.
Алахунчай — река в России, протекает в Рутульском районе РеспубликтДагестан. Длина реки составляет 18 км. Площадь водосборного бассейна — 76,9 км².
Хиривалю — река в России, протекает по Рутульскому району республики Дагестан. Длина реки составляет 22 км. Площадь водосборного бассейна — 127 км².
Усухчай, Мулларчай, Чехычай — река в Докузпаринском районе Дагестана. Правый приток реки Самур.