Замглай — болотная система в верховьи реки Замглай в Репкинском и Городнянском районах Черниговской области восточнее пгт Репки.
«Болото Мох» — гидрологический заказник общегосударственного значения и мезотрофное (переходное) болото. Расположен в Корюковском районе южнее села Елино Черниговской области. Площадь — 98 га. Код — 5А00000Ж0006. Находится под контролем Корюковского гослесхоза.
Дорогинский заказник — гидрологический заказник общегосударственного значения, расположенный в Прилукском районе. Заказник создан 11 августа 1980 года. Площадь — 1 880 га. Код — 5В00000Ж0001. Находится под контролем Ичнянской городской общины.

Оболонский заказник — ботанический заказник общегосударственного значения, расположенный в восточной части Новгород-Северского района. Заказник создан 20 августа 1996 года. Площадь — 400 га. Код — 5А00000Ж0002. Находится под контролем частного предприятия «Оболонь».

Путивский заказник — ботанический заказник общегосударственного значения, расположенный на востоке Новгород-Северского района. Заказник создан 20 августа 1996 года. Площадь — 150 га. Код — 5А00000Ж0001. Находится под контролем Горбовского сельсовета.

«Беловодский заказник» — гидрологический заказник общегосударственного значения, расположенный на территории Роменского района.
Тростенское озеро и его окружение — государственный природный заказник (комплексный) регионального (областного) значения Московской области, целью которого является сохранение ненарушенных природных комплексов, их компонентов в естественном состоянии; восстановление естественного состояния природных комплексов, нарушенных осушительной мелиорацией прошлых десятилетий, поддержание экологического баланса. Заказник предназначен для:
- сохранения и восстановления природных комплексов;
- сохранения местообитаний редких видов растений и животных.

Красностанское Москворечье — государственный природный заказник (комплексный) регионального (областного) значения Московской области, целью которого является сохранение ненарушенных природных комплексов, их компонентов в естественном состоянии; восстановление естественного состояния нарушенных природных комплексов, поддержание экологического баланса.
Коренные ельники и сосняки Мокровского лесничества — государственный природный заказник (комплексный) регионального (областного) значения Московской области, территория которого имеет особое значение для сохранения и восстановления природных комплексов и поддержания экологического баланса. На заказник возложены следующие задачи:
- сохранение природных комплексов;
- сохранение местообитаний редких видов растений, лишайников, грибов и животных.
Леса и болота Ваулинского лесничества — государственный природный заказник (комплексный) регионального (областного) значения Московской области, целью которого является сохранение ненарушенных природных комплексов, их компонентов в естественном состоянии; восстановление естественного состояния природных комплексов, нарушенных торфоразработкой и осушительной мелиорацией прошлых десятилетий; поддержание экологического баланса территории. Заказник предназначен для:
- сохранения и восстановления природных комплексов;
- сохранения местообитаний редких видов растений, грибов и животных.
Хвойные леса в верховьях Москвы-реки — государственный природный заказник (комплексный) регионального (областного) значения Московской области, целью которого является сохранение ненарушенных природных комплексов, их компонентов в естественном состоянии; восстановление естественного состояния нарушенных природных комплексов, поддержание экологического баланса. Заказник предназначен для:
- сохранения и восстановления природных комплексов;
- сохранения местообитаний редких видов растений и животных.
Люльковский комплексный природный заказник — государственный природный заказник (комплексный) регионального (областного) значения Московской области, целью которого является сохранение ненарушенных природных комплексов, их компонентов в естественном состоянии; восстановление естественного состояния нарушенных природных комплексов, поддержание экологического баланса. Заказник предназначен для:
- сохранения и восстановления природных комплексов;
- сохранения местообитаний редких видов растений, лишайников и животных;
- ведения мониторинга видов растений, лишайников и животных, занесенных в Красную книгу Российской Федерации и Красную книгу Московской области;
- выполнения научно-исследовательских работ по изучению объектов особой охраны заказника.
Переходные болота междуречья рек Вори и Шани — государственный природный заказник (комплексный) регионального (областного) значения Московской области, целью которого является сохранение ненарушенных природных комплексов, их компонентов в естественном состоянии; восстановление естественного состояния природных комплексов, нарушенных осушительной мелиорацией прошлых десятилетий, поддержание экологического баланса. Заказник предназначен для:
- сохранения и восстановления природных комплексов;
- сохранения местообитаний редких видов растений и животных.
Новосуринский заказник — государственный природный заказник (комплексный) регионального (областного) значения Московской области, территория которого имеет особое значение для сохранения и восстановления природных комплексов и их компонентов и поддержания экологического баланса. На заказник возложены следующие задачи: сохранение природных комплексов; сохранение местообитаний редких видов растений и животных.
Коренной ельник и болото «Омшаник» — государственный природный заказник (комплексный) регионального (областного) значения Московской области, целью которого является сохранение ненарушенных природных комплексов, их компонентов в естественном состоянии; восстановление естественного состояния природных комплексов, нарушенных рубками и осушительной мелиорацией прошлых десятилетий, поддержание экологического баланса. Заказник предназначен для:
- сохранения и восстановления природных комплексов;
- сохранения местообитаний редких видов растений и животных.
Чередовский — государственный природный заказник (комплексный) регионального (областного) значения Московской области, целью которого является сохранение в первозданном виде природных комплексов, их компонентов в естественном состоянии; восстановление нарушенных природных комплексов, поддержание экологического баланса.
Елово-широколиственные леса на юге Каменского лесничества — государственный природный заказник (комплексный) регионального (областного) значения Московской области, территория которого имеет особое значение для сохранения и восстановления природных комплексов и поддержания экологического баланса. На заказник возложены следующие задачи:
- сохранение природных комплексов;
- сохранение местообитаний редких видов растений и животных.
Леса Серебряноборского лесничества — государственный природный заказник (комплексный) регионального (областного) значения Московской области, целью которого является сохранение ненарушенных природных комплексов, их компонентов в естественном состоянии; восстановление естественного состояния природных комплексов; поддержание экологического баланса. Заказник предназначен для:
- сохранения и восстановления природных комплексов;
- сохранения местообитаний редких видов растений и животных.
Темповский заказник — государственный природный заказник (комплексный) регионального (областного) значения Московской области, целью которого является сохранение природных комплексов, их компонентов в естественном состоянии; восстановление нарушенных природных комплексов; поддержание экологического баланса. Заказник предназначен для:
- сохранения и восстановления природных комплексов;
- сохранения местообитаний редких видов растений, лишайников и животных;
- ведения мониторинга организмов, занесенных в Красную книгу Российской Федерации и Красную книгу Московской области;
- выполнения научно-исследовательских работ по изучению объектов особой охраны заказника, а также по выработке и апробации природоохранных технологий;
- экологического просвещения и экологического образования.

Леса окрестностей агробиологической станции Павловская Слобода и озёрно-болотный комплекс у деревни Новинки — государственный природный заказник (комплексный) регионального (областного) значения Московской области, целью которого являетсяохранение ненарушенных природных комплексов, их компонентов в естественном состоянии; восстановление естественного состояния нарушенных природных комплексов, поддержание экологического баланса. Заказник предназначен для:
- сохранения и восстановления природных комплексов;
- сохранения местообитаний редких видов растений и животных.