
Алфимово — деревня в Ступинском районе Московской области в составе Леонтьевского сельского поселения. В деревне на 2015 год 12 улиц. По Постановлению Губернатора МО от 19 мая 2001 года к Алфимово был присоединён посёлок Красная Заря. Селение, как деревня Олихимова, впервые упоминается в 1577 году, вблизи расположена железнодорожная платформа Лютик Большого кольца МЖД.
Агарино — деревня в Ступинском районе Московской области в составе Семёновского сельского поселения. На 2015 год Агарино, фактически, дачный посёлок: при 18 жителях в деревня 7 улиц и 1 садовое товарищество, деревня связана автобусным сообщением с соседними населёнными пунктами. Впервые в исторических документах упоминается в 1627 году, как Огорино, с 1709 года — Агарино. В
Калянино — деревня в Ступинском районе Московской области в составе Семёновского сельского поселения. На 2015 год Калянино, фактически, дачный посёлок: при 6 жителях в деревне 1 улица, 4 переулка и 4 садовых товарищества. Впервые в исторических документах упоминается в 1627 году, в 1646 году в деревне было 12 дворов, в 1929 году — 41 двор, из них 38 крестьянских (всего 159 человек, 60 мужчин и 99 женщин.
Канищево — деревня в Ступинском районе Московской области в составе Семёновского сельского поселения.
Кравцово — деревня в Ступинском районе Московской области в составе Семёновского сельского поселения. На 2015 год в Кравцово, фактически, дачный посёлок: при 23 жителях в деревне 6 улиц, 2 проезда и 2 садовых товарищества. Впервые в исторических документах упоминается в 1472 году, как сельцо Кравцовское, как деревня Кравцово — с XVI века.
Макеево — деревня в Ступинском районе Московской области в составе Семёновского сельского поселения. На 2015 год в Макеево, фактически, дачный посёлок: при 4 жителях в деревне 1 улица, 8 проездов и садовое товарищество.
Петрищево — деревня в Ступинском районе Московской области в составе Семёновского сельского поселения. На 2015 год Петрищево, фактически, дачный посёлок: при 2 жителях в деревне 1 улица — Цветочная и 5 садовых товариществ. В деревне в 1905 году был построен кирпичный часовенный столб, до наших дней не сохранившийся.
Протасово — деревня в Ступинском районе Московской области в составе Семёновского сельского поселения. На 2015 год Протасово, фактически, дачный посёлок: при 7 жителях в деревне 3 улицы. Впервые в исторических документах Протасово упоминается в 1627 году.
Старокурово — деревня в Ступинском районе Московской области в составе Семёновского сельского поселения. На 2015 год Старокурово 3 улицы, 2 переулка и 4 садовых товарищества. Впервые в исторических документах, как сельцо, упоминается в 1577 году.
Торбеево — деревня в Ступинском районе Московской области в составе Семёновского сельского поселения. На 2015 год Торбеево 2 улицы, 3 проезда и 4 садовых товарищества. В Торбеево в XIX веке была построена деревянная часовня, приписанная к церкви в Ивановском, до наших дней не сохранилась.
Колдино — деревня в Ступинском районе Московской области в составе Городского поселения Ступино. На 2016 год в Колдино 1 улица — Кулижная и Кулижный переулок. Впервые в исторических документах упоминается в 1577 году, как деревня Колдына. В 1887 году в деревне была построена деревянная часовня, не дошедшая до наших дней.
Зыбино — деревня в Ступинском районе Московской области в составе Городского поселения Ступино. На 2016 год в Зыбино 1 улица — Охотничья, Охотничий переулок и садовое товарищество. Впервые в исторических документах упоминается в 1577 году, как сельцо Зыбино.
Забелино — деревня в Ступинском районе Московской области в составе Городского поселения Жилёво. На 2016 год в Забелино 2 улицы — Таежная и Уссурийская. Впервые в исторических документах селение упоминается в 1577 году.
Колычево — село в Ступинском районе Московской области в составе Городского поселения Жилёво. На 2016 год в Колычево 5 улиц, деревня связана автобусным сообщением с райцентром и соседними населёнными пунктами, некогда принадлежала боярам Колычевым. У деревни находится источник целителя Пантелеймона.
Мурзино — деревня в Ступинском районе Московской области в составе Городского поселения Жилёво. На 2016 год в Мурзино 1 улица — Заповедная и 1 садовое товарищество. Впервые в исторических документах селение упоминается в 1577 году.
Секирино — деревня в Ступинском районе Московской области в составе Городского поселения Жилёво. На 2016 год в Секирино 1 улица — Ракитовая и 1 садовое товарищество.
Уварово — деревня в Ступинском районе Московской области в составе Городского поселения Жилёво. На 2016 год в Уварово 2 улицы — Заречная и Радужная. Впервые в исторических документах селение упоминается в 1577 году, как «деревня Уварово на Уваровском ручейку о 25 домах в вотчине П. И. Головина. Старая его вотчина».
Хирино — деревня в Ступинском районе Московской области в составе Городского поселения Жилёво. На 2016 год в Хирино 3 улицы и 1 садовое товарищество. Впервые в исторических документах селение упоминается в 1577 году, как «пустошь, что была деревня Хирино».
Шматово — деревня в Ступинском районе Московской области в составе Городского поселения Жилёво. На 2016 год в Шматово, фактически, дачный посёлок — при 7 жителях в деревне 5 улиц и 8 садовых товариществ, деревня связана автобусным сообщением с райцентром и соседними населёнными пунктами. С XVIII века в Шматово существовала Успенская церковь. В 1821 году было построено новое, кирпичное здание с Никольским приделом, сломана в середине XX века.

Толочаново — деревня в Ступинском районе Московской области в составе Городского поселения Михнево.