Интегрин альфа-10

Перейти к навигацииПерейти к поиску
Интегрин альфа-10
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

1PT6, 1QC5, 1QCY, 2L8S, 2M32, 4A0Q

Идентификаторы
ПсевдонимыITGA10, PRO827, integrin subunit alpha 10
Внешние IDOMIM: 604042 MGI: 2153482 HomoloGene: 2697 GeneCards: ITGA10
Расположение гена (человек)
1-я хромосома человека
Хр.1-я хромосома человека[1]
1-я хромосома человека
Расположение в геноме ITGA10
Расположение в геноме ITGA10
Локус1q21.1Начало145,891,208 bp[1]
Конец145,910,111 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
3-я хромосома мыши
Хр.3-я хромосома мыши[2]
3-я хромосома мыши
Расположение в геноме ITGA10
Расположение в геноме ITGA10
Локус3|3 F2.1Начало96,552,900 bp[2]
Конец96,571,835 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
Наибольшая экспрессия в
Дополнительные справочные данные
BioGPS
н/д
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

8515

213119

Ensembl

ENSG00000143127

ENSMUSG00000090210

UniProt

O75578

н/д

RefSeq (мРНК)

NM_001303040
NM_001303041
NM_003637

NM_001081053
NM_001302471

RefSeq (белок)

NP_001289969
NP_001289970
NP_003628

н/д

Локус (UCSC)Chr 1: 145.89 – 145.91 MbChr 3: 96.55 – 96.57 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Интегрин альфа-10 (α10) — мембранный белок, гликопротеин из надсемейства интегринов, продукт гена ITGA10, альфа-субъединица интегрина α10β1, рецептора для коллагена.

Функции

Интегрин альфа-10/бета-1 (α10β1) является рецептором для коллагена.[5]

Структура

Интегрин альфа-10 — крупный белок, состоит из 1145 аминокислот, молекулярная масса белковой части — 127,6 кДа. N-концевой участок (1100 аминокислот) является внеклеточным, далее расположен единственный трансмембранный фрагмент и небольшой внутриклеточный фрагмент (22 аминокислоты). Внеклеточный фрагмент включает 7 FG-GAP повторов, VWFA домен, до 11 участков N-гликозилирования. Цитозольный участок включает GFFKR мотив.

Интегрин альфа-10 относится к интегринам с I-доменом (VWFA домен), которые не подвергаются ограниченному протеолизу в процессе созревания. Альтернативный сплайсинг приводит к образованию 2 изоформ.

Тканевая специфичность

Интегрин α10β1 широко представлен в различных тканях, наиболее высокий уровень экспрессии — в мышцах и сердце. Присутствует также в суставных хрящах.

См. также

  • Интегрины

Примечания

  1. ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000143127 - Ensembl, May 2017
  2. ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000090210 - Ensembl, May 2017
  3. ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ↑ Uniprot database entry for ITGA10 (accession number O75578). Дата обращения: 7 марта 2012. Архивировано 16 февраля 2018 года.

Библиография

  • Gullberg D.E., Lundgren-Akerlund E. Collagen-binding I domain integrins--what do they do? (англ.) // Prog Histochem Cytochem : journal. — 2002. — Vol. 37, no. 1. — P. 3—54. — PMID 11876085.
  • Camper L., Hellman U., Lundgren-Akerlund E. Isolation, cloning, and sequence analysis of the integrin subunit alpha10, a beta1-associated collagen binding integrin expressed on chondrocytes (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1998. — Vol. 273, no. 32. — P. 20383—20389. — doi:10.1074/jbc.273.32.20383. — PMID 9685391.
  • Bengtsson T., Camper L., Schneller M., Lundgren-Akerlund E. Characterization of the mouse integrin subunit alpha10 gene and comparison with its human homologue. Genomic structure, chromosomal localization and identification of splice variants (англ.) // Matrix Biol.[англ.] : journal. — 2001. — Vol. 20, no. 8. — P. 565—576. — doi:10.1016/S0945-053X(01)00164-0. — PMID 11731273.
  • Brakebusch C., Hirsch E., Potocnik A., Fässler R. Genetic analysis of beta1 integrin function: confirmed, new and revised roles for a crucial family of cell adhesion molecules (англ.) // Journal of Cell Science[англ.] : journal. — The Company of Biologists[англ.], 1997. — Vol. 110, no. 23. — P. 2895—2904. — PMID 9359872.
  • Clark H.F., Gurney A.L., Abaya E., et al. The Secreted Protein Discovery Initiative (SPDI), a Large-Scale Effort to Identify Novel Human Secreted and Transmembrane Proteins: A Bioinformatics Assessment (англ.) // Genome Res. : journal. — 2003. — Vol. 13, no. 10. — P. 2265—2270. — doi:10.1101/gr.1293003. — PMID 12975309. — PMC 403697.
  • Lehnert K., Ni J., Leung E., et al. The integrin alpha10 subunit: expression pattern, partial gene structure, and chromosomal localization (англ.) // Cytogenetic and Genome Research[англ.] : journal. — Karger Publishers[англ.], 1999. — Vol. 87, no. 3—4. — P. 238—244. — doi:10.1159/000015434. — PMID 10702680.
  • Strausberg R.L., Feingold E.A., Grouse L.H., et al. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2002. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
  • Svoboda K.K. Chondrocyte-matrix attachment complexes mediate survival and differentiation (англ.) // Microsc. Res. Tech.[англ.] : journal. — 1998. — Vol. 43, no. 2. — P. 111—122. — doi:10.1002/(SICI)1097-0029(19981015)43:2<111::AID-JEMT4>3.0.CO;2-O. — PMID 9822998.
  • Bengtsson T., Aszodi A., Nicolae C., et al. Loss of alpha10beta1 integrin expression leads to moderate dysfunction of growth plate chondrocytes (англ.) // Journal of Cell Science[англ.] : journal. — The Company of Biologists[англ.], 2005. — Vol. 118, no. Pt 5. — P. 929—936. — doi:10.1242/jcs.01678. — PMID 15713743.
  • Wenke A.K., Rothhammer T., Moser M., Bosserhoff A.K. Regulation of integrin alpha10 expression in chondrocytes by the transcription factors AP-2epsilon and Ets-1 (англ.) // Biochem. Biophys. Res. Commun.[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 345, no. 1. — P. 495—501. — doi:10.1016/j.bbrc.2006.04.123. — PMID 16684505.

Ссылки