Барка — река в России, протекает по Щетинскому сельском поселении Череповецкого района Вологодской и Пошехонском району Ярославской области. Длина реки составляет 14 км.
Бодье — река в России, протекает по Череповецкому району Вологодской области. Исток находится в лесной болотистой местности между деревнями Поповское, Красново, Новинка и Думново. Населённых пунктов на реке нет. Устье реки находится в 9,8 км по левому берегу реки Сарка. Длина реки составляет 12 км.
Большой Юг — река в Вологодской области России.
Искра — река в России, протекает в основном в Вологодской области и только устье находится в Ярославской, значительная часть реки находится на территории Дарвинского заповедника. Длина реки — 22 км.
Кибрик — река в России, протекает в Грязовецком районе Вологодской области и Первомайском районе Ярославской области. Устье реки находится в 14 км по левому берегу реки Кема. Длина реки составляет 11 км.

Колоденка — река в России, протекает по территории Череповецкого района Вологодской области. Длина реки — 36 км, площадь водосборного бассейна — 202 км².
Кошта — река в России, протекает по территории Череповецкого района Вологодской области и городу Череповцу. Река впадает в Рыбинское водохранилище. Длина реки составляет 19 км, площадь водосборного бассейна — 106 км².
Мусорка (Масловка) — река в России, протекает по Череповецком районе Вологодской области.
Нотелга — река в России, протекает по Вологодскому району Вологодской области и по границе с Ярославской областью. Исток реки образуется слиянием у нежилой деревни Павлово ручьёв Чёрного и Котел в. Река течёт на юго-восток по лесной ненаселённой местности. В 7,8 км от устья, по левому берегу реки впадает река Янгосорка. Ниже устья Янгосорки граница областей проходит по реке — правый берег Ярославская, левый — Вологодская область. Устье реки находится в 12 км по правому берегу реки Сегжи, у деревни Леушкино, расположенной на левом, вологодском берегу.
Подзагорская — река в России, протекает в Череповецком районе Вологодской области.
Пурновка — река в России, протекает в Череповецком районе Вологодской области. Исток реки находится в болотце к западу от деревни Гурлево. Течёт, в основном, на север по лесной ненаселённой местности. Устье реки находится в 61 км по левому берегу реки Большой Юг в урочище Пурново. Длина реки составляет 12 км. Левый приток речка Талица, длиной около 2 км, также протекает в лесной ненаселённой местности.
Судьбица — река в России, протекает в Череповецком и Шекснинском районах Вологодской области. Исток находится на северо-восточном склоне возвышенности, на которой находится деревня Жаворонково. Протекает на северо-запад мимо деревень Новая Деревня, Пронино, Вакарино, Кузьминское, через урочища Дуброво-Карповское, Дуброво-Григорьевское, огибает с севера урочище Большой Камень. Устье реки находится по левому берегу залива Рыбинского водохранилища, образовавшегося по руслу Шексны, между устьями рек Большой Юг и Судебка. Длина реки составляет 17 км.
Тулша — река в России, протекает в Вологодской и Ярославской областях. Исток находится в Череповецком районе Вологодской области около деревни Гурлево. Протекает между деревнями Суковатка и Избная, после чего попадает на территорию Ярославской области. Течёт в ненаселённой лесной местности, принимает левые притоки Великий и Кубря. Далее протекает мимо деревень Мерлево, Овсянниково, Щипцово.

Уломка — река в Вологодской области России. Длина реки составляет 42 км, площадь водосборного бассейна — 208 км².
Чермакса — река в России, протекает по Череповецкому району Вологодской области.
Чимсора — река в России, протекает по территории Ягницкого сельского поселения Череповецкого района Вологодской области, большей частью по территории Дарвинского заповедника. Длина реки составляет 21 км.
Янгосорка — река в России, протекает в Вологодском районе Вологодской области. Исток находится к северу от деревни Алексеево. Обогнув село с востока, река течёт на юг по лесной ненаселённой местности. Недалеко от устья протекает мимо урочища Большое Проншино. Устье реки находится в 7,8 км по левому берегу реки Нотелга. Длина реки составляет 20 км.
Сарка — река в России, течёт по территории Череповецкого района Вологодской области. Правый приток Большого Юга.
Уломское — озеро в Вологодской области России. Располагается на территории Уломского сельского поселения Череповецкого района, к востоку от озера Колоденское. Относится к бассейну Рыбинского водохранилища.
Мороцкое — озеро в Вологодской области России. Располагается на территории Уломского сельского поселения Череповецкого района, к юго-западу от озера Искорское. Относится к бассейну Рыбинского водохранилища. Образует западную границу Дарвинского заповедника.