Се́тунька — малая река на западе Москвы, значительный правый приток Сетуни, является вторым водотоком по длине и мощности в Солнцеве.

Пре́сня (Синичка) — малая река в Пресненском районе города Москвы, левый приток Москвы-реки. С 1908 года заключена в подземный коллектор, верховья полностью уничтожены.

Я́звенка — водоток в Москве и Московской области, правый приток Городни. На территории города протекает по границе районов Бирюлёво Восточное, Орехово-Борисово Южное и Орехово-Борисово Северное Южного административного округа. Речное русло в некоторых местах искусственно трансформировано, река частично заключена в подземный коллектор. По степени техногенной трансформации относится к I классу — сохранилась в открытом течении более чем на 90%.

Синичка — малая река на территории районов Соколиная Гора, Лефортово и Басманный города Москвы, левый приток Яузы. По степени техногенной трансформации относится к IV классу — речное русло с 1950 года заключено в подземный коллектор, поверхностный водоток утрачен.
Ка́пля (Ка́пелька) — ручей в Мещанском районе Центрального административного округа Москвы, левый приток Напрудной. Водоток проходит в подземном коллекторе.
Черторы́й (Черторо́й) — малая река в Центральном административном округе Москвы, левый приток Москвы-реки. С XIX века протекает в подземном коллекторе. В XVI веке ручей использовали для наполнения рва, который проходил вдоль стен Белого города.
Си́вка — ручей в районе Арбат Центрального административного округа Москвы, правый приток Черторыя.
Са́ра — ручей в Таганском районе Центрального административного округа Москвы, левый приток Москвы-реки. По степени техногенной трансформации относится к IV классу — поверхностный водоток утрачен, река канализирована более чем на 90%. Ручей с 1912 года протекает в подземном коллекторе.
Дани́ловский ручей (Дани́ловка, Худе́ница) — малая река Южного административного округа Москвы в бывшей Даниловской слободе, правый приток Москвы-реки. Своё название получил от Данилова монастыря, вдоль которого проходил водоток. Гидроним «Худеница» возник по урочищу, которое располагалось на этой территории. По состоянию на начало 2018 года заключён в подземный коллектор.
Ко́птевский ручей — малая река в районах Коптево и Тимирязевский Северного административного округа Москвы, левый приток Жабенки. Устье расположено в Петровско-Разумовском заказнике. Название происходит от деревни Коптево. По состоянию на начало 2018 года заключён в подземный коллектор, низовья сохранились в виде залива Большого Садового пруда.
Котляко́вский ручей — малая река в районе Москворечье-Сабурово Южного административного округа Москвы, левый приток Чертановки. Название происходит от деревни Котляково. По состоянию на начало 2018 года ручей заключён в подземный коллектор, его долина засыпана, местность застроена промышленной зоной.
Лени́вка — бывшая малая река в районе Хамовники Центрального административного округа Москвы, левый приток Москвы-реки. Получил название благодаря своему медленному, спокойному течению. На берегу ручья располагался Ленивый Торжок, то есть рынок. Гидроним Волхонка, возник от одноимённой улицы.
По состоянию на начало 2018 года заключена в подземный коллектор или полностью засыпана.
Куми́нский Овраг — бывшая малая река в Северо-Западном административном округе Москвы, нижний правый приток реки Таракановки. Своё название получил от фамилии «Кумин». Длина ручья составляла 700 метров. Водоток проходил недалеко от Хорошевского шоссе.
Малый Носков ручей — малая река в районе Капотня Юго-Восточного административного округа Москвы, левый приток Большого Носкова ручья. Своё название получил от гидронима принимающей реки. По состоянию на начало 2018 года заключён в подземный коллектор.
Песо́чный ручей (Прото́к) — ручей в районе Арбат Центрального административного округа Москвы, левый приток Москвы-реки. «Песочным» водоток назвали по характеру почвы, а «протоком» обычно наименовали сухие речные русла. С конца XIX века ручей заключён в подземный коллектор, а его долина полностью засыпана.
Сорочка — малая река в Таганском районе Центрального административного округа Москвы, левый приток Москвы-реки. Точное происхождение названия не установлено. Возможно, оно связано со словом «Сара» — осока, болото, заболоченная река. В финно-угорских языках встречается корень «сар», имеющий сходное значение. В русском языке есть похожий корень «сыр», образованный от слов сырой, сырость. Вероятно, гидроним менялся в такой последовательности: Сара-Сарочка-Сорочка, где последнее — от наименования птицы. Своё название водоток мог получить от резиденции Сарских архиереев. Речное русло заключено в подземный коллектор.
Путя́евский ручей — малая река в районе Сокольники Восточного административного округа Москвы, правый приток Яузы. На реке расположен каскад из шести прудов, который способствует очищению загрязнённой воды ручья. Название антропонимическое.
Я́сный овра́г — малая река в районе Хамовники Центрального административного округа Москвы, левый приток Москвы-реки. Речное русло заключено в подземный коллектор. Происхождение названия не установлено.

Троеку́ровский руче́й — малая река в районе Очаково-Матвеевское Западного административного округа Москвы, правый приток Сетуни. Своё название получил от бывшего села Троекурово.
Садно́вский овра́г — малая река на юге Москвы, в районе Северное Бутово Юго-Западного административного округа, правый приток Битцы.