Ольша́нка — ручей в районах Лианозово и Бибирево Северно-Восточного административного округа Москвы, правый приток Чермянки. Водоток практически на всём протяжении заключён в подземный коллектор. По степени техногенной трансформации река относится к III классу — в открытом течении проходит на 10—49%, русло сильно трансформировано.

Чёрный ручей — малая река в районе Ивановское Восточного административного округа города Москвы, левый приток Серебрянки. Водоток трансформирован и частично убран в подземный коллектор. Название ручья связано с характером воды — грязной, тёмной от торфа.

Саморо́динка — малая река в районах Проспект Вернадского и Тропарёво-Никулино Западного административного округа, Обручевский Юго-Западного административного округа Москвы, правый приток Очаковки. Частично заключена в подземный коллектор, русло сильно трансформировано. В истоках Самородинки, у станции метро «Беляево», находилась деревня Беляево, на правом берегу возле устья — деревня Никольское. Долина Самородинки в 1991 году была объявлена памятником природы.
Крыла́тский руче́й — водоток в районе Крылатское Западного административного округа Москвы, правый приток Москвы-реки на территории ландшафтного заказника «Крылатские холмы». По степени техногенной трансформации относится к III классу — в открытом течении проходит на 10—49 %, речное русло сильно трансформировано. Река протекает в овраге Каменная Клетва, который является самой длинной и крупной по площади овражно-балочной системой «Крылатских холмов».
Со́болевский руче́й — небольшая река в районе Щукино Северо-Западного административного округа Москвы, левый приток Москвы-реки. Протекает в подземном коллекторе, по степени техногенной трансформации относится к IV классу — поверхностный водоток утрачен, русло канализировано более чем на 90 %.
Буда́нка — бывшая река в центральной части Москвы, малый правый приток Москвы-реки. По состоянию на начало 2018 года под руслом Буданки расположены подземные коллекторы. Название реки происходит от фамилии Буданов и от слова «буд» — «строить, постройка».
Большой Носков ручей (Носко́вка) — малая река в районе Капотня Юго-Восточного административного округа Москвы, левый приток Москвы-реки. Его длина составляет 2 км, в открытом русле — 0,4 км. Площадь водосборного бассейна — 2 км². По состоянию на начало 2018 года заключен в подземный коллектор, верховья засыпаны. Название реки происходит от фамилии Носков.
Брёховский овраг — малая река в Юго-Западном административном округе Москвы, правый приток Очаковки. Название происходит от бывшей деревни Брёхово, которая располагалась на берегу ручья до начала 1970 годов. По состоянию на 2018-й верховья реки засыпаны, водоток частично проходит в подземном коллекторе. Длина Брёховского оврага с временным водотоком в верховьях составляла 1,9 км, после заключения в коллектор остался постоянный поверхностный водоток длиной 210—230 метров.
Голья́новский ручей — река в Центральном административном округе Москвы, левый приток Яузы. Своё название получил от Гольяновской улицы, гидроним не имеет прямого отношения к Гольяновскому пруду и одноимённому району. Полностью заключен в подземный коллектор.
Е́льницкий руче́й — ручей в Восточном административном округе Москвы, правый приток реки Сосенки. Своё название получил в конце XX века по бывшей Ельницкой пустоши. По состоянию на начало 2018 года нижняя часть русла заключена в подземный коллектор.
Заха́рковский овраг — бывшая малая река в районе Южное Тушино Северо-Западного административного округа Москвы, правый приток Химки на южной границе Захарковского сада. По состоянию на начало 2018 года ручей сохранился в виде небольшого залива Химкинского водохранилища напротив Северного речного вокзала. Вдоль Химкинского бульвара заключён в подземный коллектор. Своё название получил от деревни Захарково.
Ко́птевский ручей — малая река в районах Коптево и Тимирязевский Северного административного округа Москвы, левый приток Жабенки. Устье расположено в Петровско-Разумовском заказнике. Название происходит от деревни Коптево. По состоянию на начало 2018 года заключён в подземный коллектор, низовья сохранились в виде залива Большого Садового пруда.
Овра́г Лы́хина — малая река в районе Зябликово Южного административного округа Москвы, левый приток реки Шмелёвки. Длина ручья составляет 900 метров. Название антропонимическое.
Лео́новский ручей — малая река в районах Свиблово и Ростокино Северо-Восточного административного округа Москвы, левый приток Яузы. Длина реки составляет 2,6 км. Первый гидроним произошёл от села и усадьбы Леоново, второй — от урочища Высково. Леоновским ручьём ошибочно называли реку Будайку и слив с Капустянского пруда. По состоянию на начало 2018 года почти целиком заключён в подземный коллектор.

Ону́чин овра́г — малая река в районе Раменки Западного административного округа Москвы, правый приток Раменки. Своё название получила от антропонима Онуча, который происходит от слова «онучи» — портянки.
Песо́чный ручей (Прото́к) — ручей в районе Арбат Центрального административного округа Москвы, левый приток Москвы-реки. «Песочным» водоток назвали по характеру почвы, а «протоком» обычно наименовали сухие речные русла. С конца XIX века ручей заключён в подземный коллектор, а его долина полностью засыпана.
Сенько́вский овраг — малая река в районах Чертаново Южное и Чертаново Центральное Южного административного округа Москвы, правый приток Городни. Речное русло заключено в подземный коллектор. Название антропонимическое.
Я́сный овра́г — малая река в районе Хамовники Центрального административного округа Москвы, левый приток Москвы-реки. Речное русло заключено в подземный коллектор. Происхождение названия не установлено.
Тро́ице-Лы́ковский руче́й — малая река в районе Строгино Северо-Западного административного округа Москвы, правый приток Москвы-реки. Верховья засыпаны, речное русло трансформировано и заключено в подземный коллектор. Название получил от бывшего села Троице-Лыково.

Ю́жный Октя́брьский руче́й — малая река в районе Хорошёво-Мнёвники Северо-Западного административного округа Москвы, левый приток Москвы-реки.