Юракаре — генетически изолированный язык боливийских индейцев-юракаре.
Араванские языки — семья южноамериканских индейских языков, распространённых на западе Бразилии и в Перу. Насчитывает, по разным подсчётам, от 6 до 10 языков. Иногда включается в состав гипотетической макро-аравакской семьи.
Чокоа́нские языки — небольшая семья южноамериканских индейских языков, распространённых в Колумбии и Панаме. Общее число говорящих ок. 66 тыс. чел..
Барбакоа́нские языки — небольшая семья южноамериканских индейских языков, распространённых в Колумбии и Эквадоре. Общее число говорящих ок. 30 тыс. чел..
Дьяпа́нские языки — небольшая семья южноамериканских индейских языков, распространённых в Бразилии, в штатах Амазонас и Акри. Общее число говорящих около 650 чел..

Амери́ндские языки́ — это языковая макросемья, предложенная Дж. Гринбергом в его книге 1987 года «Language in the Americas». В этой книге Гринберг предположил, что все индейские языки Америки принадлежат к одной из трёх языковых семей. Согласно его гипотезе, только незначительное количество языков, сконцентрированных в Северной Америке, принадлежат к предложенным ранее языковым семьям На-дене и эскимосско-алеутских языков. Все остальные языки, которые обычно рассматриваются как относящиеся к десяткам отдельных и неродственных между собой языковых семей, Гринберг относит к америндской макросемье. Из-за большого количества методологических просчётов в исследовании отношений между языками эта гипотеза была отклонена большей частью лингвистического сообщества.
Плато-пенутийские (пенутианские) языки, англ. Plateau Penutian — семья индейских языков. Носители языков, в основном индейцы Плато, проживают на севере Калифорнии, западе Орегона вплоть до штатов Вашингтон и Айдахо.
Пано-таканские языки, или языки пано-такана — семья индейских языков Южной Америки. Распространена в Перу, западной Бразилии, Боливии и на севере Парагвая.
Яномамские языки — небольшая языковая семья, распространённая на северо-западе Бразилии и на юге Венесуэлы. Носители — народы яномамо.
Сапарские языки — малочисленная семья южноамериканских языков, распространённых в Перу и Эквадоре. Общее число носителей — менее 700 человек.
Терренс Кауфман, англ. Terrence Kaufman — американский лингвист, специализировавшийся в бесписьменных языках, языковых контактах и индейских языках. Профессор антропологии в Питсбургском университете.

Хивар(оан)ские языки, или языки хиваро (хибаро), — небольшая языковая семья, распространённая на севере Перу и востоке Эквадора.
Язык юкуде или маку — вымерший изолированный язык, распространённый на границе Венесуэлы и Бразилии в регионе Рораима вдоль реки Урарикоэра. Ранее носители обитали в районе между реками Падамо и Кунукунума.

Макуанские языки, надахупские языки, или языки маку — малочисленная семья индейских языков, распространённая в Бразилии, Колумбии и Венесуэле. Название Makú — уничижительное, на языке лингва-жерал означает «раб, низкий человек».
Чимуанские или юнканские языки — гипотетическая небольшая исчезнувшая семья языков, существовавшая на территории современных Перу и Эквадора в долине между Андами. На языках данной семьи говорили представители древних государств Чиму и Мочика. Предполагается родство с языками уру-чипайя.

Языки аймара или языки хаки — наряду с языками кечуа, одна из двух доминирующих языковых семей в Андах.
Куэ́ва — исчезнувший аборигенный народ, проживавший на территории провинции Дарьен на востоке Панамы. Был полностью уничтожен в период 1510—1535 годов в результате испанской колонизации.
Шипибо-конибо — один из наиболее распространённых паноанских языков. Количество носителей приблизительно 8000 человек из 26 000 членов союза племён шипибо-конибо. В шипибо выделяют 4 наречия:
- конибо
- шитибо (шетебо) с диалектами сетебо, сетибо, шитибо и маноита
- малибо (писквибо)
- шипибо
Язык ваорани — изолированный язык, на котором говорят представители народности ваорани, живущие в амазонской сельве в междуречье Напо и Курарая. Незначительное число говорящих, возможно, проживает в Перу.
Кашибо — язык, на котором говорит народ кашибо на реках Агуайтия, Сан-Алехандро, Сунгаро в Перу. Относится к паноанской языковой семье. Делится на марискальский, синчи-роканский и кашибо диалекты. Кашибо является официально признанным языком.