
Шексна́ — река в Вологодской области России, левый приток Волги. Длина 139 км, площадь водосборного бассейна — 19 тыс. км². Годовой сток составляет 5,42 км³. Берёт начало из Белого озера, впадает в Рыбинское водохранилище. Местность по берегам реки носит название Пошехонье.

Волго-Балтийский водный путь — сокр. Волгобалт — система каналов, рек и озёр на северо-западе Российской Федерации, соединяющая бассейны Каспийского и Балтийского морей. Проходит через Рыбинское водохранилище до г. Череповец, р. Шексна, Белое озеро, р. Ковжа, Мариинский канал, р. Вытегра, Онежский канал, Онежское озеро, р. Свирь, Ладожское озеро и р. Нева. Мариинская водная система сооружена в 1799—1810 годах, переустраивалась в 1890—1896 годах, после коренной реконструкции в 1964 году получила современное название. Длина пути составляет приблизительно 1100 км, глубина судоходного фарватера — не менее 4 м, что обеспечивает проход судов водоизмещением до 5000 т. Продолжением Волго-Балтийского пути является Беломорско-Балтийский канал, соединяющий Онежское озеро с Белым морем.

Бе́лое — озеро в Вологодской области России. Относится к бассейну Шекснинского водохранилища.

Вы́тегра — река в Вытегорском районе Вологодской области, часть Волго-Балтийского водного пути.

Марии́нская во́дная систе́ма, Марианское сообщение — водный путь в России, соединяющий бассейн Волги с Балтийским морем, пролегающий от Рыбинска до Петербургского морского порта через приладожские каналы.

Ке́ма — река в Вологодской области России, впадает в озеро Белое, принадлежит бассейну Волги. Длина реки — 150 км, площадь водосборного бассейна — 4480 км², средний расход 44,8 м³/с.
А́нненский Мост — село в Вытегорском районе Вологодской области России, центр Анненского сельского поселения.

Ко́вжское — озеро, расположено в Вытегорском районе Вологодской области России. Площадь 65 км², длина 18 км, ширина 4 км.

Вытегорский или Мариинский канал — ключевое звено Мариинской водной системы, соединявшее реки Ковжу и Вытегру. В 1886 году на смену старому каналу прорыт Ново-Мариинский канал, прошедший севернее Маткозера. Оба канала расположены в Вытегорском районе Вологодской области России.

Сельское поселение Анненское — сельское поселение в составе Вытегорского района Вологодской области. Центр — село Анненский Мост.
Лема — река в Вытегорском районе Вологодской области России, правый приток Мегры.
Матиморека — река в Вытегорском районе Вологодской области, левый приток Робреки.
Самина — река в России. Исток берёт в Саминском озере на территории Саминского сельского поселения Вытегорского района Вологодской области, большая часть русла расположена на территории того же сельского поселения, небольшой участок в Пудожском районе Республики Карелия, устье — в 18 км по правому берегу реки Андома, на территории Андомского сельского поселения Вытегорского района. Длина реки составляет 79 км.
- В 64 км от устья по правому берегу реки впадает Сахатручей
- В 45 км от устья по левому берегу реки впадает Пертручей
- В 32 км от устья по правому берегу реки впадает река Челма.
- В 34 км от устья по левому берегу реки впадает река Хмелевица.
- В 4 км от устья по левому берегу реки впадает река Пажия.
- В 19 км от устья по левому берегу реки впадает река Куржекса.
- Более мелкие притоки: Матручей, Турнега.
Южная Тухта — река в Вытегорском районе Вологодской области России, левый приток Андомы.
Инопаш — ручей в России, левый (последний) приток Шексны, протекает в Рыбинском районе Ярославской области. Длина водотока 22 км, площадь водосбора 61,8 км².
Шола — река в Шольском сельском поселении Белозерского района Вологодской области России. Длина реки — 81 км. Площадь водосборного бассейна — 2460 км².

Вытегорский округ путей сообщения — орган управления водными путями в северной и северо-западной частях Российской империи в составе управления водяных и шоссейных сообщений Министерства путей сообщения. Правление Округа находилось в городе Вытегра Олонецкой губернии.
Ужла — река в Вытегорском районе Вологодской области. Начинается в Ужельском озере, затем течёт через болото Гладкое. Впадает в реку Ковжу около посёлка Ужла. На наземных незаболоченных участках русла река протекает через елово-берёзовый лес. В среднем течении уходит под землю, потом выходит на поверхность, образуя воклюз глубиной 64 м. Скорость течения воды на подземном участке составляет 0,5 м/с. По данным измерений, расход воды в колодце колеблется от 0,3 до 1,5 м³/с, превышая расход воды в верхнем течении, что может свидетельствовать о существовании подземных притоков. Длина — 25 км. Площадь бассейна — 313 км².
Ивода — река в Бабаевском районе Вологодской области, в бассейне Шолы.